エピトープ（[ 1 ]抗原決定基とも呼ばれ免疫系、特に抗体、B細胞、またはT細胞認識される抗原の部分です。エピトープに結合する抗体の部分はパラトープ呼ばれます。エピトープは通常、非自己タンパク質ですが、宿主由来の配列で認識できるもの（自己免疫疾患の場合など）もエピトープです。[ 2 ]
タンパク質抗原のエピトープは、その構造とパラトープとの相互作用に基づいて、立体構造エピトープと線状エピトープの2つのカテゴリーに分類されます。 [ 3 ]立体構造エピトープと線状エピトープは、エピトープがとる3次元立体構造に基づいてパラトープと相互作用します。この立体構造は、関与するエピトープ残基の表面特性と、抗原の他のセグメントの形状または三次構造によって決定されます。立体構造エピトープは、不連続なアミノ酸残基の相互作用によってとる3次元立体構造によって形成されます。一方、線状エピトープは、連続するアミノ酸残基の相互作用によってとる3次元立体構造によって形成されます。線状エピトープは、関与するアミノ酸の一次構造のみによって決定されるわけではありません。そのようなアミノ酸残基に隣接する残基、および抗原のより遠いアミノ酸残基は、一次構造残基がエピトープの3次元立体構造をとる能力に影響を与えます。[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]エピトープの90%は立体構造によるものである。[ 9 ]
関数
B細胞エピトープ
免疫グロブリンまたは抗体が結合する抗原の部分は、B細胞エピトープと呼ばれます。[ 12 ] B細胞エピトープは、立体構造エピトープと線状エピトープの2つのグループに分けられます。[ 12 ] B細胞エピトープは主に立体構造エピトープです。[ 13 ] [ 14 ]四次構造を考慮すると、追加のエピトープの種類があります。[ 14 ]タンパク質サブユニットが凝集するとマスクされるエピトープは、クリプトトープと呼ばれます。[ 14 ]ネオトープは、特定の四次構造にあるときにのみ認識されるエピトープであり、エピトープの残基は複数のタンパク質サブユニットにまたがることができます。[ 14 ]サブユニットが解離すると、ネオトープは認識されなくなります。[ 14 ]
クロスアクティビティ
エピトープは時に交差反応性を示す。この性質は、免疫系が抗イディオタイプ抗体による免疫調節において利用している（ノーベル賞受賞者のニールス・カイ・イェルネが最初に提唱した）。抗体が抗原のエピトープに結合すると、そのパラトープは別の抗体のエピトープとなり、その抗体が結合する。この2番目の抗体がIgMクラスであれば、その結合によって免疫応答が亢進される。一方、IgGクラスであれば、その結合によって免疫応答が抑制される。
参考文献
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外部リンク
- 抗体は抗原の表面にある立体構造に結合する（ジェーンウェイ免疫生物学第3.8節）。
- 抗原は、抗体の結合部位にあるポケットや溝、あるいは拡張された表面に結合することができる（Janeway Immunobiology 図 3.8）。
エピトープデータベース
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- Bcipep：B細胞エピトープのデータベース
- SYFPEITHI — T細胞エピトープの初のオンラインデータベース
- IEDB — 認識コンテキストの注釈付きT細胞およびB細胞エピトープデータベース — NIH資金提供
- ANTIJEN — 英国ジェンナー研究所のT細胞およびB細胞エピトープデータベース
- IMGT/3Dstructure-DB — 免疫グロブリン（IG）およびトランスポゾン（TR）の注釈付きB細胞およびT細胞エピトープの三次元構造 — IMGT、モンペリエ、フランス
- SEDB：構造エピトープデータベース — ポンディチェリー大学、DIT資金提供
- 米国国立医学図書館の医学主題見出し（MeSH）におけるエピトープ
