日本の政治主流派は立憲民主党と自民党が支配的な勢力である一方、左派と右派には政治的な過激主義が存在する。
戦後の歴史において、左派も右派も自民党から政権を奪取することはできなかったが、特定のテーマに関して世論に影響を与えることに成功した。こうしたテーマには、日本の外交関係、軍の役割、領土問題、国家の象徴性などが含まれる。靖国神社のようなテーマにおいては、これら3つの要素すべてが影響を及ぼす。
国民と政府は、ある程度の公共秩序の乱れを、適切に機能する民主主義に不可欠なものとして容認しているようだ。デモは通常、定められた形式に従って行われる。グループは法的許可を得て、指定されたルートと区域を守る。プラカードや拡声器を使って意見を表明する。交通が混乱したり、警察とデモ参加者の間で小競り合いが起こることもある。しかし、逮捕はまれで、一般的には暴力行為が絡む場合に限られる。
過激派グループのメンバーは人口のごく一部に過ぎず、政府にとって深刻な脅威とはならないものの、当局はこれらのグループによる暴力行為、そして個々の暴力事件がもたらす影響を懸念している。過激派による暴力的な抗議活動は、国民の支持を得られないような、ごく一部の過激な主張を掲げて行われることもある。左派と右派の間で時折発生する衝突では、参加者に負傷者が出ている。
1989年の朝日年鑑によると、「極左」の活動家は14,400人で、5つの主要な「流」と27または28の異なる派閥に組織されていた。総会員数は約35,000人だった。新左翼の活動は成田三里塚の新東京国際空港(三里塚闘争)に集中していた。1970年代初頭、急進派と普段は保守的な農民が、空港建設のための農地収用に反対するため、極めて異例の同盟を結成した。建設現場では、数千人の農民と急進派が機動隊と衝突し、暴力的な衝突となり、数十人が死亡した。空港は1980年代に完成し運用を開始したが、抵抗運動は規模を縮小して続いた。急進派は、計画の推進に直接的または間接的に関与した者に対してゲリラ攻撃を仕掛け、空港拡張計画を阻止しようとした。 1990年までに、この活動によって死者も出た。天皇ゆかりの場所への攻撃もあった。1990年1月には、左翼勢力が東京と京都の皇居に向けて手製のロケット弾を発射した。
テロ活動という点では、最も重要な新左翼グループは日本赤軍であった。1969年に結成された日本赤軍は、1970年の日本航空国内線旅客機の平壌行きハイジャックや1972年のロッド空港虐殺など、数々の事件に関与した。また、 1974年のシンガポールのシェル石油精製所襲撃事件であるラジュ事件にも関与し、同年にはハーグのフランス大使館、1975年にはクアラルンプールの米国大使館とスウェーデン大使館を占拠した。 1977年には、日本赤軍はインド上空で日本航空機をハイジャックし、600万米ドルの身代金と日本の刑務所に収監されていた6人の囚人の釈放を要求し、成功させた。
その活動家たちは、パレスチナ解放人民戦線のようなパレスチナ運動を含む国際的なテロ組織と緊密な関係を築いた。日本赤軍は北朝鮮の金日成政権とも密接な関係を持っていた。この組織は厳格に組織化されており、ある学者は、その「経営スタイル」は日本の大企業のそれに似ていると指摘している。
政府がテロリストの要求に「屈した」として国内外から激しい批判を受けた後、当局はハイジャックをより困難にするため、約560万の有効な日本旅券を回収して再発行する意向を発表した。テロリスト集団を追跡するための特別警察部隊が編成され、空港の厳重な警備措置が開始された。定期的に脅迫を行っていたにもかかわらず、日本赤軍は1980年代には比較的活動が低調だった。1990年には、そのメンバーが北朝鮮とレバノンでさらなる訓練を受けており、さまざまな政治的目的を推進するための傭兵として利用可能であると報じられた。
創設者であり指導者である重信房子は、2000年11月に日本の大阪で逮捕された。
右翼過激派は極めて多様であった。1989年には、そのような団体が800団体、総勢約12万人ものメンバーを擁していた。しかし、警察の集計によると、活動していたのはわずか50団体、2万3000人程度であった。右翼過激派は、戦前の時代と強い繋がりを持つ、熱狂的なロマン主義に浸っていた。彼らは、血と汗と鉄の男らしさに魅了され、(多くの非過激派団体と同様に)戦後日本の精神的病弊に対する解毒剤として、伝統的な武士道の価値観を提唱した。言葉よりも暴力的な直接行動を好む彼らの姿勢は、 1930年代の軍国主義過激派や、1850年代から1860年代の徳川時代末期の英雄的な「意志の強い男たち」の例を反映していた。現代の右翼過激派は、戦後の米国への「依存体制」の終結、天皇の戦前の神聖地位への復帰、そして憲法第9条の否認を要求した。右翼の多く、あるいはほとんどは、日本の暴力団組織であるヤクザと密接な関係を持っていた。日本の右翼過激派は、しばしば国家主義的なスローガンを放送する拡声器を搭載した黒いバスを使用することで知られている。
1970年11月、日本を代表する小説家の一人である三島由紀夫が、自衛隊部隊の反乱を企てたものの失敗に終わり、儀式的な自殺を遂げたことは、世間に衝撃と関心をもたらした。三島と彼が率いる小規模な私兵組織「楯の会」は、自衛隊の蜂起が、戦後の「停滞した平和の時代」に終止符を打ち、国民に古き良き価値観を再確認させるきっかけとなることを期待していた。
右翼過激派は、 1960年の社会主義指導者浅沼稲次郎暗殺事件や1978年の大平正義元首相暗殺未遂事件にも関与していたが、戦前の過激派とは異なり、彼らのほとんどは騒々しい街頭デモ、特に左派の日本教職員組合の大会を標的とした嫌がらせ活動に終始していた。しかし、1990年代初頭には、「新右翼」がより暴力的になっている兆候が見られた。1987年5月、リベラル系の朝日新聞の記者が、赤報隊に所属する銃撃犯によって殺害された。赤報隊はまた、日本の戦争記録に関する教科書の記述の改訂などの問題で外国の圧力に屈したとして、中曽根康弘元首相の暗殺を脅迫した。 1990年1月、正気塾(正気な思想家たちの学校)のメンバーが長崎市長の本島仁氏を銃撃し、重傷を負わせた。この襲撃は、本島市長が昭和天皇について批判的な発言をしたことがきっかけとなった可能性がある。
この攻撃は、天皇制に反対する左派の中核派が故天皇の弟の邸宅にロケット弾を発射したと犯行声明を出した2日後、そして政府が1990年11月の明仁天皇即位に至る一連の出来事を発表する前日に発生した。即位式は、天皇を取り巻く神秘性が過度に強調されている、あるいは過度に軽視されていると考える左派と右派の過激派グループにとって、標的になりやすいと考えられていたが、深刻な事件は発生しなかった。