ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
DNMT3B 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3QKJ、3FLG、5CIU
識別子 エイリアス DNMT3B 、ICF、ICF1、M.HsaIIIB、DNA(シトシン-5-)メチルトランスフェラーゼ3ベータ、DNAメチルトランスフェラーゼ3ベータ、FSHD4 外部ID OMIM : 602900; MGI : 1261819; HomoloGene : 56000; GeneCards : DNMT3B; OMA :DNMT3B - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体2(マウス) [2] バンド 2|2 H1 始める 153,491,370 bp [2] 終わり 153,529,650 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 二次卵母細胞 毛包 精子 胚 生殖腺 睾丸 神経節隆起 膵臓の体 心室帯 精巣上体
トップの表現 胚葉上層 原始的な線 胚 膣の骨盤部分 副腎管 膣上皮 射精管 胎児の尾 腹壁 胚
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
メチルトランスフェラーゼ活性
トランスフェラーゼ活性
DNA結合
転写コリプレッサー活性
DNAメチルトランスフェラーゼ活性
クロマチン結合
金属イオン結合
タンパク質結合
DNA(シトシン-5-)メチルトランスフェラーゼ活性
DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
ヒストン脱アセチル化酵素結合
細胞成分 生物学的プロセス
電離放射線に対する反応
シトシンのC-5メチル化
エストラジオールに対する反応
低酸素症への反応
高酸素に対する細胞反応
RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
活動への反応
デキサメタゾン刺激に対する細胞反応
ビタミンAへの反応
DNAメチル化
メチル化
遺伝子発現の正の調節
遺伝子発現の負の調節、エピジェネティック
ヒストンH3-K4メチル化の正の制御
ニューロン分化の正の調節
ヒストンH3-K9メチル化の負の制御
遺伝子発現の調節
カフェインに対する反応
毒性物質に対する反応
コカインに対する反応
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001207055 NM_001207056 NM_006892 NM_175848 NM_175849 NM_175850
NM_001003960 NM_001003961 NM_001003963 NM_001122997 NM_001271744 NM_001271745 NM_001271746 NM_001271747 NM_010068
RefSeq (タンパク質) NP_001193984 NP_001193985 NP_008823 NP_787044 NP_787045 NP_787046
NP_001003960 NP_001003961 NP_001003963 NP_001116469 NP_001258673 NP_001258674 NP_001258675 NP_001258676 NP_034198
場所 (UCSC) 20 章: 32.76 – 32.81 Mb 2 章: 153.49 – 153.53 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
DNA(シトシン-5)メチルトランスフェラーゼ3ベータは 、 ヒトでは DNMT3B 遺伝子によってコードされる 酵素 である。 [5] この遺伝子の変異は、 免疫不全、セントロメア不安定性、顔面異常症候群 に関連している。 [6]
関数
CpG メチル化は、 胚発生 、 インプリンティング 、X 染色体不活性化 に重要な エピジェネティック修飾です。マウスの研究では、DNA メチル化が哺乳類の発生に必要であることが実証されています。この遺伝子は DNA メチルトランスフェラーゼをコードしており、維持メチル化ではなく de novo メチル化で機能すると考えられています 。このタンパク質は主に核に局在し、その発現は発生的に制御されます。8 つの選択的スプライシング転写バリアントが記述されています。バリアント 4 と 5 の全長配列は決定されていません。 [5]
臨床的意義
免疫不全・セントロメア不安定性・顔面異常(ICF)症候群は、 DNMT3B遺伝子の変異によって引き起こされる異常なDNAメチル化に起因する リンパ球 成熟の欠陥の結果である。 [6]
遺伝子の変異も ニコチン依存症 の一因となる可能性がある。 [7]
インタラクション
DNMT3B は以下と相互作用する ことが示されています :
参考文献
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さらに読む
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外部リンク