キュウリ（Cucurbita pepo）

C. pepoは、最も古い栽培種の 1 つ、あるいは最古の栽培種である。^{[ 6 ] [ 13 ] [ 14 ]}最も古い既知の場所は、メキシコ南部のオアハカ州で8,000 ～ 10,000 年前、メキシコのタマウリパス州オカンポで約 7,000 年前である。^{[ 6 ] [ 13 ] [ 14 ]}

ヨーロッパ人が到来する前は、C.  pepoはC.  moschataとともに、栽培可能な北アメリカのあらゆる地域に持ち込まれていました。^{[ 15 ]} C.  pepoの古代の分布域は、北はテキサス、ミシシッピ川流域を遡ってイリノイ、東はフロリダ、そしておそらくメイン州にまで広がっていました。^{[ 7 ]}これは、東部農業複合体の一部として先史時代の北アメリカで栽培されていたいくつかの植物の 1 つです。少なくとも 4,000 年前にはミズーリ州に現れていたことが知られています。 ^{[ 16 ]}乾燥地帯で育つ品種もあれば、湿潤地帯で育つ品種もあります。^{[ 7 ]}これらの人々の多くは、特に西部では、商業市場では見られないさまざまな丈夫なカボチャやパンプキンを今でも栽培しています。^{[ 15 ]} それでも、C. pepoもC. moschataも、同じ地域を起源とする豆のように南アメリカには持ち込まれませんでした。^{[ 15 ]}  

C.  pepoの起源に関する議論は、少なくとも 1857 年以来続いています。^{[ 17 ]}最近の生物系統学的調査では、2 つの異なる栽培化イベントが示されています。1 つはメキシコで発生し、C .  pepo subsp. fraterna を生み出し、もう 1 つは現在の米国東部で発生し、C.  pepo subsp. texana を生み出しました。系統発生学的観点からの優勢な祖先種は^{[ 16 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]}です。

C. pepo種内の形態的差異は非常に大きいため、そのさまざまな亜種や栽培品種は、まったく別の種として誤って識別されてきた。これらの大きな差異は、その広範な地理的分布に起因している。^{[ 7 ]} 

いくつかの分類群が提案されているが、2012年現在、普遍的に受け入れられているものはない。^{[ 21 ]} 2002年にデッカー・ウォルターズによって提案された分類群の慣例は次のとおりである。^{[ 7 ]}

• C. pepo subsp. pepo - 栽培カボチャ、ズッキーニ、オレンジ色のヒョウタン（「オレンジボール」と「オレンジワーテッド」）
• C. pepo subsp. ovifera var. ovifera – 栽培されているクルックネック、ホタテ、ドングリ、ほとんどの観賞用ヒョウタン
• C. pepo subsp. ovifera var. ozarkana – ミシシッピ川流域およびオザーク高原に自生する個体群
• C. pepo subsp. ovifera var. texana – テキサス州の野生個体群
• C. pepo subsp. fraterna – メキシコ北東部の野生個体群

2003年の研究では3つの亜種が認識された：^{[ 22 ]}

• Cucurbita pepo subsp.フラテルナ
• Cucurbita pepo subsp. pepo
• キュウリ科カボチャ亜種テキサナ

1986年、植物学者のパリスは、基本的な形状に基づいて8つの食用グループからなるC.  pepoの分類を提案した。 ^{[ 10 ] [ 23 ]}ごく少数のC.  pepo栽培品種を除いて、すべてこれらのグループに含めることができる。^{[ 23 ]}これらの8つの食用栽培品種のC.  pepoは、形状と色が大きく異なり、^{[ 16 ] [ 24 ] [ 25 ]} 1つの非食用栽培品種がある。^{[ 26 ]}

ランダム増幅多型DNAは、C.  pepoの種、変種、栽培品種の関係を整理するのに有用であることが証明されており、現代の栽培品種のほとんど、あるいはすべてがC.  texanaに由来するものではないことが示されている。それらはC.  fraternaまたはメキシコ南部の未だ不明の祖先種と関連している。 ^{[ 7 ]}

栽培種のカボチャは、 C  . pepo subsp. fraternaとC. pepo subsp. texanaの複合種であると提唱されている。^{[ 18 ] [ 19 ]} 1989 年のカボチャの起源と発達に関する研究では、元の野生種は小さな丸い果実であり、現代のカボチャはその直接の子孫であると示唆された。この調査では、クロックネック、観賞用ヒョウタン、ホタテは初期の変種であり、ドングリはホタテとカボチャの交配種であると提唱された。^{[ 10 ]}   

遺伝子アレル解析に基づくと、栽培種のC.  pepoには2つの異なるグループが存在する。1つはカボチャ、カラバサ、クリオラ、マロースカッシュで、もう1つは観賞用ヒョウタン、クロックネック、アコーン、スキャロップ、その他数種である。C .  pepo subsp. fraternaは遺伝的に最初のグループに近く、C.  pepo subsp. texanaは遺伝的に2番目のグループに近い。^{[ 20 ] [ 28 ]}