bZIPドメイン

塩基性ロイシンジッパードメイン（bZIPドメイン）は、多くのDNA結合真核生物タンパク質に見られます。このドメインの一部には、配列特異的なDNA結合特性を媒介する領域と、 2つのDNA結合領域を結合（二量体化）するために必要なロイシンジッパーが含まれています。DNA結合領域は、アルギニンやリジンなどの多数の塩基性アミノ酸から構成されています。このドメインを含むタンパク質は転写因子です。^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

bZIP転写因子

bZIP転写因子はすべての真核生物に存在し、二量体化転写因子の最大のファミリーの1つを形成しています。^{[ 3 ]} 2008年の進化研究では、4つのbZIP遺伝子がすべての植物の最近の共通祖先のゲノムにコードされていたことが明らかになりました。^{[ 4 ]} bZIP転写因子間の相互作用は多数かつ複雑であり^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 3 ]}、上皮組織における癌の発生^{[ 7 ]}、内分泌組織の細胞によるステロイドホルモンの合成^{[ 8 ]} 、生殖機能に影響を与える因子^{[ 9 ]}、および人間の健康に影響を与える他のいくつかの現象において重要な役割を果たしています。

bZIPドメイン含有タンパク質

AP-1 fos / junヘテロ二量体は転写因子を形成する
Jun-B転写因子
CREB cAMP応答エレメント転写因子
OPAQUE2（O2）は、トウモロコシ（Zea mays）の胚乳に存在する貯蔵タンパク質の一種をコードする22kDゼイン遺伝子の転写因子である。
NFE2L2またはNrf2
Bzip Maf転写因子

このドメインを含むヒトタンパク質

ATF1 ; ATF2 ; ATF4 ; ATF5 ; ATF6 ; ATF7 ; バッハ1 ; バッハ2 ; BATF ; BATF2 ; CEBPA ; CEBPB ; CEBPD ; セブペ; CEBPG ; CEBPZ ; CREB1 ; CREB3 ; CREB3L1 ; CREB3L2 ; CREB3L3 ; CREB3L4 ; CREB5 ; CREBL1 ; クリーム; E4BP4 ; FOSL1 ; FOSL2 ; ジュン；ジュンブ; ジャンド; マファ; MAFB ; 農林水産省; 農林水産省; NRL; C-MAF ; 農水省; NFE2 ; NFE2L2 ; NFE2L3 ; SNFT ; XBP1

参考文献

↑ Ellenberger T (1994). "DNA認識の理解：基本領域ロイシンジッパーと基本領域ヘリックスループヘリックスDNA結合ドメインの構造". Curr. Opin. Struct. Biol . 4 (1): 12– 21. doi : 10.1016/S0959-440X(94)90054-X .
↑ Hurst HC (1995). "転写因子 1: bZIP タンパク質". Protein Profile . 2 (2): 101– 68. PMID 7780801 .
1 2 Amoutzias, Grigoris D.; Robertson, David L.; Van de Peer, Yves; Oliver, Stephen G. (2008-05-01). "Choose your partners: dimerization in eukaryotic transcription factors". Trends in Biochemical Sciences . 33 (5): 220– 229. doi : 10.1016/j.tibs.2008.02.002 . ISSN 0968-0004 . PMID 18406148 .
↑ Corrêa LG、Riaño-Pachón DM、Schrago CG、dos Santos RV、Mueller-Roeber B、Vincentz M (2008)。Shiu SH (編)。「緑色植物の進化におけるbZIP転写因子の役割：4つの創始遺伝子から生じる適応的特徴」。PLOS ONE。3 ( 8 ) e2944。Bibcode : 2008PLoSO ... 3.2944C。doi : 10.1371 / journal.pone.0002944。PMC 2492810。PMID 18698409。
↑ Vinson, Charles; Acharya, Asha; Taparowsky, Elizabeth J. (2006-01-01). "B-ZIP転写因子のin vitroおよびin vivoにおける相互作用の解明" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression . 1759 ( 1– 2): 4– 12. doi : 10.1016/j.bbaexp.2005.12.005 . ISSN 0006-3002 . PMID 16580748 .
↑ Newman, John RS; Keating, Amy E. (2003-06-27). "Comprehensive identification of human bZIP interactions with coiled-coil arrays" . Science . 300 ( 5628 ): 2097–2101 . Bibcode : 2003Sci...300.2097N . doi : 10.1126/science.1084648 . ISSN 1095-9203 . PMID 12805554. S2CID 36715183 .
↑ヴラホプロス SA、ロゴテティ S、ミカス D、ギアリカ A、ゴルゴウリス V、ゾンプルリス V (2008 年 4 月)。「発癌におけるATF-2の役割」。バイオエッセイ。30 (4): 314–27 .土井: 10.1002/bies.20734。hdl : 10442/7311。PMID 18348191。S2CID 678541。
↑ Manna PR、Dyson MT、Eubank DW、Clark BJ、Lalli E、Sassone-Corsi P、Zeleznik AJ、Stocco DM (2002 年 1 月)。「cAMP 応答エレメント結合タンパク質ファミリーのメンバーによるステロイド生成およびステロイド生成急性調節タンパク質の調節」。Mol . Endocrinol . 16 (1): 184–99 . doi : 10.1210/mend.16.1.0759 . PMID 11773448 .
↑ Hoare S、Copland JA、Wood TG、Jeng YJ、Izban MG、Soloff MS (1999 年 5 月)。「ヒト乳腺細胞におけるオキシトシン受容体遺伝子発現の誘導に関与する GABP α/β 結合部位の同定、 c - Fos/ c -Jun による増強」。Endocrinology。140 ( 5): 2268–79。doi : 10.1210/endo.140.5.6710。PMID 10218980。

外部リンク

SMARTデータベースにおけるbZIPドメインのエントリ
bZIPファミリーは、 2013年12月7日にWayback Machineにアーカイブされました（ PlantTFDB ：植物転写因子データベース）。
植物bZIP転写因子（2012年3月20日にWayback Machineにアーカイブ済み）

[Ellenberger_1994-1] Ellenberger T (1994). "DNA認識の理解：基本領域ロイシンジッパーと基本領域ヘリックスループヘリックスDNA結合ドメインの構造". Curr. Opin. Struct. Biol . 4 (1): 12– 21. doi : 10.1016/S0959-440X(94)90054-X .

[pmid7780801-2] Hurst HC (1995). "転写因子 1: bZIP タンパク質". Protein Profile . 2 (2): 101– 68. PMID 7780801 .

[:0-3] 1 2 Amoutzias, Grigoris D.; Robertson, David L.; Van de Peer, Yves; Oliver, Stephen G. (2008-05-01). "Choose your partners: dimerization in eukaryotic transcription factors". Trends in Biochemical Sciences . 33 (5): 220– 229. doi : 10.1016/j.tibs.2008.02.002 . ISSN 0968-0004 . PMID 18406148 .

[pmid18698409-4] Corrêa LG、Riaño-Pachón DM、Schrago CG、dos Santos RV、Mueller-Roeber B、Vincentz M (2008)。Shiu SH (編)。「緑色植物の進化におけるbZIP転写因子の役割：4つの創始遺伝子から生じる適応的特徴」。PLOS ONE。3 ( 8 ) e2944。Bibcode : 2008PLoSO ... 3.2944C。doi : 10.1371 / journal.pone.0002944。PMC 2492810。PMID 18698409。

[5] Vinson, Charles; Acharya, Asha; Taparowsky, Elizabeth J. (2006-01-01). "B-ZIP転写因子のin vitroおよびin vivoにおける相互作用の解明" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression . 1759 ( 1– 2): 4– 12. doi : 10.1016/j.bbaexp.2005.12.005 . ISSN 0006-3002 . PMID 16580748 .

[6] Newman, John RS; Keating, Amy E. (2003-06-27). "Comprehensive identification of human bZIP interactions with coiled-coil arrays" . Science . 300 ( 5628 ): 2097–2101 . Bibcode : 2003Sci...300.2097N . doi : 10.1126/science.1084648 . ISSN 1095-9203 . PMID 12805554. S2CID 36715183 .

[pmid18348191-7] ヴラホプロス SA、ロゴテティ S、ミカス D、ギアリカ A、ゴルゴウリス V、ゾンプルリス V (2008 年 4 月)。「発癌におけるATF-2の役割」。バイオエッセイ。30 (4): 314–27 .土井: 10.1002/bies.20734。hdl : 10442/7311。PMID 18348191。S2CID 678541。

[pmid11773448-8] Manna PR、Dyson MT、Eubank DW、Clark BJ、Lalli E、Sassone-Corsi P、Zeleznik AJ、Stocco DM (2002 年 1 月)。「cAMP 応答エレメント結合タンパク質ファミリーのメンバーによるステロイド生成およびステロイド生成急性調節タンパク質の調節」。Mol . Endocrinol . 16 (1): 184–99 . doi : 10.1210/mend.16.1.0759 . PMID 11773448 .

[pmid10218980-9] Hoare S、Copland JA、Wood TG、Jeng YJ、Izban MG、Soloff MS (1999 年 5 月)。「ヒト乳腺細胞におけるオキシトシン受容体遺伝子発現の誘導に関与する GABP α/β 結合部位の同定、 c - Fos/ c -Jun による増強」。Endocrinology。140 ( 5): 2268–79。doi : 10.1210/endo.140.5.6710。PMID 10218980。

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