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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | BPIFB1、C20orf114、LPLUNC1、BPI フォールドを含むファミリー B メンバー 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | MGI : 2137431;ホモロジーン: 50047;ジーンカード: BPIFB1; OMA :BPIFB1 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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BPIフォールド含有ファミリーBメンバー1（BPIFB1）は、ヒトではBPIFB1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] BPIFB1は分泌タンパク質であり、気道（呼吸器および嗅覚上皮）の粘膜および唾液腺で非常に高いレベルで発現し、消化管（舌、胃、腸上皮）および膵臓では中程度のレベルで発現する。[6]
スーパーファミリー
BPIFB1は、2つの類似したドメインが「ブーメラン」形状で形成する殺菌性/透過性増加タンパク質フォールド（BPIフォールド）の存在によって定義されるBPIフォールドタンパク質スーパーファミリー のメンバーです。 [7]このスーパーファミリーは、 BPI/LBP/PLUNCファミリーまたはBPI / LPB / CETPファミリー としても知られています。[8] BPIフォールドは、グラム陰性細菌に見られるリポ多糖のアシル炭素鎖などの疎水性および両親媒性分子と相互作用できる非極性結合ポケットを作成しますが、このファミリーのメンバーは他にも多くの機能を持っている可能性があります。
BPI/LBP/PLUNC スーパーファミリーの遺伝子は、昆虫、軟体動物、回虫などの非脊椎動物の遠い相同遺伝子を含むすべての脊椎動物種に見られます。 [9] [10]その広範なグループには、BPI フォールド構造モチーフをコードし、単一の染色体上にクラスター化して見つかる BPIF 遺伝子ファミリーが含まれます。たとえば、ヒトでは染色体 20、マウスでは染色体 2、ラットでは染色体 3、ブタでは染色体 17、ウシでは染色体 13 です。BPIF 遺伝子ファミリーは、BPIFA と BPIFB の 2 つのグループに分かれています。ヒトでは、BIPFA は 3 つのタンパク質コード遺伝子BPIFA1、BPIFA2、BPIFA3、および 1 つの擬似遺伝子BPIFA4Pで構成されています。一方、BPIFB は 5 つのタンパク質コード化遺伝子BPIFB1、BPIFB2、BPIFB3、BPIFB4、BPIFB6と 2 つの疑似遺伝子BPIFB5P、BPIFB9Pで構成されています。ヒトで疑似遺伝子として現れるものは、他の種では完全に機能する遺伝子として現れる場合があります。
BPIFB1はマウスではLPLUNC1遺伝子（長口蓋肺および鼻上皮クローン1）としても同定されたが[11]、その後PLUNCタンパク質はBPIフォールドスーパーファミリーのサブファミリーに分類された。[10]ニワトリゲノムの体系的解析では、遺伝子ファミリーのLplunc1(Bpifb1) / Lplunc5(Bpifb5)ブランチは存在しないことが判明したため、BPIFB1およびBPIFB5タンパク質は哺乳類の種分化後にのみ出現した可能性が高い。[12]
関数
哺乳類では、BPIFB1タンパク質は、口、鼻腔、肺、消化管の粘膜における細菌への曝露に対する自然免疫反応に関与しています。 [13]グラム陰性細菌を感知して反応する役割を果たし、抗菌活性に寄与します。
ヒトでは、嚢胞性線維症（CF）、慢性閉塞性肺疾患（COPD）、喘息などの呼吸器疾患で異常発現しています。[13]また、鼻咽頭癌（NPC）、胃癌、唾液腺腫瘍、肺癌などの腫瘍でも差次的に発現しているため、BPIFB1はこれらの疾患の治療標的であると考えられてきました。 たとえば、BPIFB1の発現はNPCでは抑制されていますが、細胞培養やマウスで遺伝子が過剰発現すると、腫瘍細胞の移動と浸潤（転移）が減少します。[14]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000125999 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027485 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: ファミリー B、メンバー 1 を含む BPI フォールド」。
- ^ 「遺伝子: BPIFB1 - ENSG00000125999」。bgee.org。Bgeeスイート: 動物における統合キュレーション発現アトラスおよび比較トランスクリプトミクス。 2023年2月15日閲覧。
- ^ Beamer LJ、Carroll SF、 Eisenberg D (1998 年 4 月)。「BPI/ LBPタンパク質ファミリー: 保存領域の構造解析」。タンパク質 科学。7 ( 4): 906–914。doi :10.1002/pro.5560070408。PMC 2143972。PMID 9568897。
- ^ 「CDD保存タンパク質ドメインファミリー：BPI」。www.ncbi.nlm.nih.gov。
- ^ Beamer LJ、Fischer D、Eisenberg D (1998 年 7 月)。 「哺乳類のLPS結合タンパク質および脂質輸送タンパク質の遠縁の検出」。タンパク質科学。7 (7): 1643–1646。doi : 10.1002 /pro.5560070721。PMC 2144061。PMID 9684900 。
- ^ ab Bingle CD、Seal RL、Craven CJ (2011 年 8 月)。「BPI フォールド含有スーパーファミリーのサブファミリーとしての PLUNC/PSP/BSP30/SMGB タンパク質の体系的な命名法」。生化学協会トランザクション。39 ( 4): 977–983。doi : 10.1042/BST0390977。PMC 3196848。PMID 21787333 。
- ^ Hou J, Yashiro K, Okazaki Y, Saijoh Y, Hayashizaki Y, Hamada H (2004年2月). 「BPI/PLUNCスーパーファミリーに属するマウスにおける左右非対称に発現する新規遺伝子の同定」. Developmental Dynamics . 229 (2): 373–379. doi : 10.1002/dvdy.10450 . PMID 14745963. S2CID 21625082.
- ^ Chiang SC、Veldhuizen EJ、Barnes FA、Craven CJ、Haagsman HP、Bingle CD (2011 年 3 月)。「ニワトリにおける BPI/LBP/PLUNC 様遺伝子レパートリーの同定と特徴付けにより、LBP 遺伝子が存在しないことが明らかに」。Developmental and Comparative Immunology . 35 (3): 285–295. doi :10.1016/j.dci.2010.09.013. PMC 3253384 . PMID 20959152。
- ^ ab Li J, Xu P, Wang L, Feng M, Chen D, Yu X, Lu Y (2020年5月). 「BPIFB1の分子生物学と疾患におけるその進歩」. Annals of Translational Medicine . 8 (10): 651. doi : 10.21037/atm - 20-3462 . PMC 7290611. PMID 32566588.
- ^ Wei F, Wu Y, Tang L, He Y, Shi L, Xiong F, et al. (2018年1月). 「BPIFB1 (LPLUNC1) はVTNおよびVIMと相互作用して鼻咽頭癌の移動および浸潤を阻害する」. British Journal of Cancer . 118 (2): 233–247. doi :10.1038/bjc.2017.385. PMC 5785741. PMID 29123267 .
外部リンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト BPIFB1 ゲノムの位置と BPIFB1 遺伝子の詳細ページ。
さらに読む
- Larocque RC、Sabeti P、Duggal P、Chowdhury F、Khan AI、Lebrun LM、他 (2009 年 4 月)。「長口蓋、肺、鼻の上皮クローン 1 の変異は、バングラデシュ人のコレラと関連している」。遺伝子 と免疫。10 ( 3 ): 267–272。doi :10.1038/gene.2009.2。PMC 2672110。PMID 19212328。
- Zhang B、Nie X、Xiao B、Xiang J、Shen S、Gong J、他 (2003 年 9 月)。「抑制サブトラクティブ ハイブリダイゼーションと cDNA マイクロアレイによる鼻咽頭上皮組織の組織特異的遺伝子と鼻咽頭癌の差次的発現遺伝子の同定」。遺伝子、染色体、癌。38 (1): 80–90。doi :10.1002/ gcc.10247。PMID 12874788。S2CID 24805514 。
- Bingle CD、Seal RL、Craven CJ (2011 年 8 月)。「BPI フォールド含有スーパーファミリーのサブファミリーとしての PLUNC/PSP/BSP30/SMGB タンパク質の体系的な命名法」。生化学 協会トランザクション。39 (4 ) : 977–983。doi : 10.1042 /BST0390977。PMC 3196848。PMID 21787333。
- Bingle CD、Craven CJ (2002 年 4 月)。「PLUNC: 上気道と鼻咽頭で発現する宿主防御タンパク質候補の新規ファミリー」。ヒト分子遺伝学。11 (8): 937–943。doi :10.1093/ hmg /11.8.937。PMID 11971875。
- Bingle CD、Wilson K、Lunn H、Barnes FA、High AS、Wallace WA、他 (2010 年 5 月)。「ヒト LPLUNC1 は、呼吸器系および上部気道消化管の杯細胞および小腺から分泌される産物である」。組織化学 および細胞生物学。133 (5): 505–515。doi :10.1007/s00418-010-0683-0。PMC 2852594。PMID 20237794。
- Bingle L、Wilson K、Musa M、Araujo B、Rassl D、Wallace WA、他 (2012 年 11 月)。「嚢胞性線維症肺疾患では BPIFB1 (LPLUNC1) がアップレギュレーションされる」。組織 化学および細胞生物学。138 (5): 749–758。doi :10.1007/s00418-012-0990-8。PMC 3470695。PMID 22767025。
- Shin OS、Uddin T、Citorik R、Wang JP、Della Pelle P、Kradin RL、他 (2011 年 11 月)。「LPLUNC1 はコレラ菌に対する自然免疫反応を調節する」。The Journal of Infectious Diseases。204 ( 9): 1349–1357。doi :10.1093 / infdis/jir544。PMC 3182310。PMID 21900486。