BPIFA2

BPIFA2
識別子
別名	BPIFA2、C20orf70、PSP、SPLUNC2、bA49G10.1、BPIフォールド含有ファミリーAメンバー2
外部ID	MGI : 97787 ; HomoloGene : 69034 ; GeneCards : BPIFA2 ; OMA : BPIFA2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クリスチャン	染色体20（ヒト）
終わり	33,181,412 bp
遺伝子の位置（マウス）
クリスチャン	染色体2（マウス）
終わり	153,857,999 bp
RNA発現パターン
	トップは
	耳下腺; 鼻粘膜上皮; 舌; 舌本体; 回腸粘膜; 前脛骨筋; 精子; 舌の上面; 生殖腺; 鼻粘膜の嗅覚領域;
	トップは
	耳下腺; 涙腺; 顎下腺; 外眼筋; 咬筋; 性的に未成熟な生物; リンパ節; 嗅上皮; 脊髄の腰部亜節; 髄膜;
	より多くの参照発現データ
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; リポ多糖結合; 脂質結合;
細胞成分	細胞外エクソソーム; 細胞外領域;
生物学的プロセス	細菌に対する防御反応; 抗菌性体液性免疫応答;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	140683
	19194
	ENSG00000131050
	ENSMUSG00000042459
	Q96DR5
	P07743
	NM_080574 NM_001319164
	NM_008953
	NP_001306093 NP_542141
	NP_032979
	ウィキデータ
人間を表示/編集	マウスの表示/編集

BPIフォールド含有ファミリーAメンバー2（BPIFA2）は、耳下腺分泌タンパク質（PSP）としても知られ、ヒトではBPIFA2遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] BPIFA2遺伝子配列は複数の転写^産物^（^{スプライス}バリアント）を予測しており、 2つのmRNAバリアントがよく特徴付けられています。結果として得られるBPIFA2は分泌タンパク質であり、耳下腺（唾液腺）で非常に高いレベルで発現し、舌を含む口腔咽頭粘膜で高いレベルで発現し、乳腺、精巣、肺、膀胱、血液、前立腺、副腎、腎臓、膵臓など、他の多くの組織タイプや腺で中程度のレベルで発現しています。^[⁶^]

スーパーファミリー

BPIFA2は、2つの類似したドメインが「ブーメラン」型に形成された殺菌性/透過性増加タンパク質フォールド（BPIフォールド）の存在によって定義されるBPIフォールドタンパク質スーパーファミリーのメンバーです。 ^{[ 7 ]} このスーパーファミリーは、BPI/LBP/PLUNCファミリーまたはBPI / LPB / CETPファミリーとしても知られています。^{[ 8 ]} BPIフォールドは、グラム陰性細菌に見られるリポ多糖のアシル炭素鎖などの疎水性および両親媒性分子と相互作用できる非極性結合ポケットを作成しますが、このファミリーのメンバーは他の多くの機能を持っている可能性があります。

BPI/LBP/PLUNC スーパーファミリーの遺伝子は、昆虫、軟体動物、線虫などの非脊椎動物種に遠縁の相同遺伝子を含め、すべての脊椎動物種に見られます。 ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}この広範なグループには、BPI フォールド構造モチーフをコードし、単一の染色体上にクラスター化しているBPIF 遺伝子ファミリーがあります。たとえば、ヒトでは染色体 20、マウスでは染色体 2、ラットでは染色体 3、ブタでは染色体 17、ウシでは染色体 13 です。BPIF 遺伝子ファミリーは、BPIFA と BPIFB の 2 つのグループに分かれています。ヒトでは、BIPFA は 3 つのタンパク質コード遺伝子BPIFA1、BPIFA2、BPIFA3、および 1 つの偽遺伝子BPIFA4Pから構成されています。 BPIFBは、5つのタンパク質コード遺伝子（BPIFB1、BPIFB2、BPIFB3、BPIFB4、BPIFB6）と2つの偽遺伝子（BPIFB5P、BPIFB9P）から構成されている。ヒトでは偽遺伝子として認識されるものが、他の種では完全に機能する遺伝子として認識される場合もある。

ヒトでは、BPIFA2遺伝子は最初にヒトPLUNC関連遺伝子として同定されました。^{[ 11 ]}少し前にはヒトPSPとして^{[ 12 ]}、さらに15年ほど前にはマウスPSP遺伝子として同定されていました。^{[ 13 ]}

関数

PSPの機能は、BPI/LBP/PLUNCファミリーに属することが最終的に認識されるまで長年不明のままであり、その後、BPIFA2/PSP/SPLUNC2の殺菌特性がそのファミリーに属することが認識されました。^{[ 14 ]}これは主に唾液中に分泌されるため、口内に入る病原体に対する第一線の防御機構の一つです。BPIFA1は細菌上のリポ多糖（LPS）に結合し、細菌の凝集を誘導することができ、これは唾液タンパク質の主要な抗菌機能です。^{[ 15 ]}例えば、BPIFA2タンパク質は緑膿菌の増殖を阻害することが示されていますが、これらの細菌の凝集は引き起こしません。^{[ 16 ]}

粘膜液の表面張力を低下させる界面活性剤として働く BPIFA1/PLUNC と同様に、BPIFA2/PIP も唾液中の重要な界面活性剤です。ノックアウトマウスでこの遺伝子がサイレンシングされると、唾液は水の表面張力を示します。^{[ 17 ]}さらに、BPIFA2/PIP がないと、唾液中の LPS レベルは正常マウスよりも低く、ノックアウトマウスはエンドトキシン血症の兆候を示し、細菌が第一線の防御を回避して消化管に入り、軽度の炎症を引き起こしていることを示唆しています。

参考文献

1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000131050 – Ensembl、2017年5月
1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000042459 – Ensembl、2017年5月
↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
↑ "BPIFA2 BPIフォールド含有ファミリーAメンバー2 [ Homo sapiens (ヒト) ] - 遺伝子 - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov .
↑ "遺伝子: BPIFA2 - ENSG00000131050" . bgee.org . Bgeeスイート: 動物における統合されたキュレーション済み発現アトラスと比較トランスクリプトミクス。
↑ Beamer LJ、Carroll SF、Eisenberg D (1998 年 4 月)。「BPI /LBP ファミリータンパク質: 保存領域の構造解析」。Protein Science。7 ( 4 ) : 906–914。doi : 10.1002 / pro.5560070408。PMC 2143972。PMID 9568897。
↑ 「CDD 保存タンパク質ドメインファミリー: BPI」。www.ncbi.nlm.nih.gov。
↑ Beamer LJ、Fischer D、Eisenberg D (1998年7月)。「哺乳類LPS結合タンパク質および脂質輸送タンパク質の遠縁の検出」。Protein Science。7 ( 7 ) : 1643–1646。doi : 10.1002 / pro.5560070721。PMC 2144061。PMID 9684900。
↑ Bingle CD、Seal RL、Craven CJ (2011 年 8 月)。「BPI フォールド含有スーパーファミリーのサブファミリーとしての PLUNC/PSP/BSP30/SMGB タンパク質の体系的命名法」。Biochemical Society Transactions。39 ( 4 ) : 977–983。doi : 10.1042 / BST0390977。PMC 3196848。PMID 21787333。
↑ Bingle CD、Craven CJ (2002年4月15日)。「PLUNC：上気道および鼻咽頭で発現する新規候補宿主防御タンパク質ファミリー」。Human Molecular Genetics。11 ( 8): 937–943。doi : 10.1093/ hmg / 11.8.937。PMID 11971875。
↑ 「ヒト耳下腺分泌タンパク質mRNA、完全cds」。NLM NCBI。2001年11月7日。 2023年2月17日取得。
↑ Madsen HO、Hjorth J (1985)。「マウスPSP mRNAの分子クローニング」。Nucleic Acids Research。13 ( 1 ) : 1– 13。doi : 10.1093/ nar / 13.1.1。PMC 340970。PMID 2582349。
↑ Bingle L、Barnes FA、Lunn H、Musa M、Webster S、Douglas CW、et al. (2009 年 9 月) 「齧歯類耳下腺分泌タンパク質のヒト相同体である SPLUNC2 の特性評価と発現」 . Histochemistry and Cell Biology . 132 (3): 339– 349. doi : 10.1007/s00418-009-0610-4 . PMID 19499239 . S2CID 24708348 . 2023 年2 月 17 日取得.
↑ Gorr SU、Abdolhosseini M、Shelar A、Sotsky J ( 2011年8月1日)。「SPLUNC2/PSPとタンパク質由来の合成ペプチドの二重の宿主防御機能」。Biochemical Society Transactions。39 ( 4 ) : 1028–1032。doi : 10.1042 / BST0391028。PMC 3417823。PMID 21787342。
↑ Prokopovic V、Popovic M、Andjelkovic U、Marsavelski A、Raskovic B、Gavrovic-Jankulovic M、Polovic N (2014 年 3 月)。「BPIFA2 タンパク質の単離、生化学的特性評価および抗菌活性」。Archives of Oral Biology。59 ( 3): 302–9。doi : 10.1016 / j.archoralbio.2013.12.005。PMID 24581853。
↑ Nandula SR、Huxford I、Wheeler TT、Aparicio C、Gorr SU (2020年8月)。「耳下腺分泌タンパク質BPIFA2は、リポ多糖の作用に影響を与える唾液界面活性剤である」。Experimental Physiology。105 ( 8 ) : 1280– 1292。doi : 10.1113 / EP088567。PMC 9484039。PMID 32390232。

外部リンク

UCSCゲノムブラウザにあるヒトBPIFA2ゲノムの位置とBPIFA2遺伝子の詳細ページ。
米国国立医学図書館の医学主題見出し（MeSH）におけるPIP+タンパク質、+ヒト
米国国立医学図書館の医学主題見出し（MeSH）における「BPIFA2+タンパク質、+ヒト」

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000131050 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000042459 – Ensembl、2017年5月

[3] 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[5] "BPIFA2 BPIフォールド含有ファミリーAメンバー2 [ Homo sapiens (ヒト) ] - 遺伝子 - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov .

[6] "遺伝子: BPIFA2 - ENSG00000131050" . bgee.org . Bgeeスイート: 動物における統合されたキュレーション済み発現アトラスと比較トランスクリプトミクス。

[Beamer-1998-A-7] Beamer LJ、Carroll SF、Eisenberg D (1998 年 4 月)。「BPI /LBP ファミリータンパク質: 保存領域の構造解析」。Protein Science。7 ( 4 ) : 906–914。doi : 10.1002 / pro.5560070408。PMC 2143972。PMID 9568897。

[8] 「CDD 保存タンパク質ドメインファミリー: BPI」。www.ncbi.nlm.nih.gov。

[Beamer-1998-B-9] Beamer LJ、Fischer D、Eisenberg D (1998年7月)。「哺乳類LPS結合タンパク質および脂質輸送タンパク質の遠縁の検出」。Protein Science。7 ( 7 ) : 1643–1646。doi : 10.1002 / pro.5560070721。PMC 2144061。PMID 9684900。

[Bingle-2011-10] Bingle CD、Seal RL、Craven CJ (2011 年 8 月)。「BPI フォールド含有スーパーファミリーのサブファミリーとしての PLUNC/PSP/BSP30/SMGB タンパク質の体系的命名法」。Biochemical Society Transactions。39 ( 4 ) : 977–983。doi : 10.1042 / BST0390977。PMC 3196848。PMID 21787333。

[Bingle-2002-11] Bingle CD、Craven CJ (2002年4月15日)。「PLUNC：上気道および鼻咽頭で発現する新規候補宿主防御タンパク質ファミリー」。Human Molecular Genetics。11 ( 8): 937–943。doi : 10.1093/ hmg / 11.8.937。PMID 11971875。

[12] 「ヒト耳下腺分泌タンパク質mRNA、完全cds」。NLM NCBI。2001年11月7日。 2023年2月17日取得。

[Madsen-1985-13] Madsen HO、Hjorth J (1985)。「マウスPSP mRNAの分子クローニング」。Nucleic Acids Research。13 ( 1 ) : 1– 13。doi : 10.1093/ nar / 13.1.1。PMC 340970。PMID 2582349。

[Bingle-2009-14] Bingle L、Barnes FA、Lunn H、Musa M、Webster S、Douglas CW、et al. (2009 年 9 月) 「齧歯類耳下腺分泌タンパク質のヒト相同体である SPLUNC2 の特性評価と発現」 . Histochemistry and Cell Biology . 132 (3): 339– 349. doi : 10.1007/s00418-009-0610-4 . PMID 19499239 . S2CID 24708348 . 2023 年2 月 17 日取得.

[15] Gorr SU、Abdolhosseini M、Shelar A、Sotsky J ( 2011年8月1日)。「SPLUNC2/PSPとタンパク質由来の合成ペプチドの二重の宿主防御機能」。Biochemical Society Transactions。39 ( 4 ) : 1028–1032。doi : 10.1042 / BST0391028。PMC 3417823。PMID 21787342。

[Prokopovic-2014-16] Prokopovic V、Popovic M、Andjelkovic U、Marsavelski A、Raskovic B、Gavrovic-Jankulovic M、Polovic N (2014 年 3 月)。「BPIFA2 タンパク質の単離、生化学的特性評価および抗菌活性」。Archives of Oral Biology。59 ( 3): 302–9。doi : 10.1016 / j.archoralbio.2013.12.005。PMID 24581853。

[Nandula-2020-17] Nandula SR、Huxford I、Wheeler TT、Aparicio C、Gorr SU (2020年8月)。「耳下腺分泌タンパク質BPIFA2は、リポ多糖の作用に影響を与える唾液界面活性剤である」。Experimental Physiology。105 ( 8 ) : 1280– 1292。doi : 10.1113 / EP088567。PMC 9484039。PMID 32390232。

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

産物

[

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]