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| ヴルカニサエタ | |
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| 科学的分類 | |
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| 属: | ヴルカニサエタ 伊藤・鈴木・中瀬 2002
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| タイプ種 | |
| ヴルカニサエタディストリビュータ 伊藤・鈴木・中瀬 2002
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| 種 | |
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分類学上、VulcanisaetaはThermoproteaceae科の属です。
説明と意義
Vulcanisaetaは嫌気性、従属栄養性、超好熱性の古細菌で、85～90 °C、pH 4.0～4.5 で最適に増殖します。この生物は、東日本の硫酸塩地帯または配管された温泉水から直接採取されたサンプルから分離されています。
ゲノム構造
Vulcanisaeta 属のゲノムはいくつか配列が解読されています。配列が解読された古細菌ゲノムの一覧を参照してください。DNA の G + C 含有量は 44 ～ 46% で、 Thermoproteaceae属の他の種よりも比較的低いと予測されています。
細胞構造と代謝
Vulcanisaetaの細胞は、まっすぐなまたはわずかに湾曲した桿体で、幅は 0.4 ～ 0.6 μm です。細胞が分岐していたり、末端に球状の物体があったりする場合もあります。この古細菌は、炭素源として、麦芽糖、デンプン、リンゴ酸、酵母エキス、ペプトン、牛肉エキス、カザミノ酸、ゼラチンを利用しますが、D-アラビノース、D-フルクトース、ラクトース、スクロース、 D-キシロース、酢酸、酪酸、ギ酸、フマル酸、プロピオン酸、ピルビン酸、コハク酸、メタノール、ホルムアミド、メチルアミン、トリメチルアミンは利用できません。電子受容体として、この生物は硫黄とチオ硫酸塩を使用します。ThermocladiumやCaldivirgaなどの遺伝的に類似した他の古細菌とは異なり、Vulcanisaeta は培地にビタミン混合物や古細菌細胞抽出液が存在しない状態でも増殖します。
エコロジー
Vulcanisaeta属の菌株は日本の温泉地で発見されている。この生物は日本の温泉から分離される菌株の中で最も一般的な桿菌類であるにもかかわらず、他国からは分離されていない。これは、アゾレス諸島、アイスランド、インドネシア、イタリア、日本、フィリピン、ロシア、米国など世界中に分布するThermoproteus属やPyrobaculum属とは対照的である。そのため、 Vulcanisaeta属は日本を含む限られた地域に分布している可能性がある。 [1]
系統発生
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[2]と国立生物工学情報センター（NCBI）[1]に基づいています。
参照
参考文献
- ^ ab Sayers; et al. 「Vulcanisaeta」。国立生物工学情報センター（NCBI）分類データベース。 2023年6月10日閲覧。
- ^ JP Euzéby. 「Vulcanisaeta」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2023年6月10日閲覧。
- ^ 「The LTP」 。 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年5月10日閲覧。
- ^ 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) 。 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
さらに読む
- Jay ZJ; JP. Beam; MA. Kozubal ; Rdem Jennings; DB. Rusch & Inskeep WP (2016 年 12 月)。「イエローストーン国立公園の高温環境における主要な Thermoproteales の分布、多様性、機能」。 環境微生物学。18 (12): 4755–4769。doi : 10.1111/1462-2920.13366。PMID 27130276。
- Jay ZJ、Inskeep WP (2015 年 7 月)。 「 Thermoproteales 目における 16S rRNA 遺伝子イントロン の分布、多様性、重要性」。Biology Direct。10 ( 35): 35。doi : 10.1186 / s13062-015-0065-6。PMC 4496867。PMID 26156036。
- Mavromatis, Konstantinos (2010). 「Vulcanisaeta distributa 標準株 (IC-017(T)) の完全なゲノム配列」.ゲノム科学の標準. 3 (2): 117–125. doi :10.4056/sigs.1113067. PMC 3035369. PMID 21304741 .
- 伊藤哲也;鈴木Ｋ；中瀬哲也 (2002) 「Vulcanisaeta distributa gen. nov.、sp. nov.、および Vulcanisaeta souniana sp. nov.、日本の温泉から分離された超好熱性の棒状のクレンキエオテス」。内部。 Ｊ．Ｓｙｓｔ．進化。微生物。52 (Pt 4): 1097–1104。土井：10.1099/ijs.0.02152-0。PMID 12148613。
- Burggraf S; Huber H; Stetter KO (1997). 「16S rRNA 配列データに基づくクレンアーカエル目と科の再分類」Int. J. Syst. Bacteriol . 47 (3): 657–660. doi : 10.1099/00207713-47-3-657 . PMID 9226896.
- Zillig W; Stetter KO; Schafer W; Janekovic D; Wunderl S; Holz I; Palm P (1981)。「Thermoproteales: アイスランドのソルファタラスから分離された、極めて好熱好酸性の嫌気性古細菌の新種」。Zentralbl . Mikrobiol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. Abt. 1 Orig . C2 : 205–227。