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| サーモプロテウス | |
|---|---|
科学的分類 
| |
| ドメイン： | 古細菌 |
| 王国： | プロテオアーキオータ |
| 上門: | TACKグループ |
| 門: | サーモプロテオタ |
| クラス： | 熱タンパク質 |
| 注文： | サーモプロテア |
| 家族： | テルモプロテア科 |
| 属: | サーモプロテウス ジリッグ & ステッター 1982 |
| タイプ種 | |
| サーモプロテウス・テナックス ジリッグ＆ステッター 1982
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| 種 | |
サーモプロテウスは、サーモプロテア科の古細菌の属です。これらの原核生物は、サルフォロバス属、ピロディクティウム属、デスルフォロコッカス属に関連する好熱性硫黄依存性生物です。 [1]これらは水素硫黄独立栄養生物であり、最高95℃の温度で成長することができます。
説明と意義
サーモプロテウスは、野生では独立栄養性の硫黄還元によって生育する嫌気性菌の属です。他の超好熱菌と同様に、サーモプロテウスは古細菌の根底に位置する地球最古の生物の生きた例です。
ゲノム構造
サーモプロテウスの遺伝子配列は、この生物の代謝様式について多くのことを明らかにしました。ゲノム全体の長さは1.84 Mbpで、DNAは二本鎖で環状です。遺伝子はオペロンと呼ばれる共転写クラスターに配置されています。サーモプロテウス・テナックスのゲノムは完全に配列されています。[2]
系統発生
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[3]と国立生物工学情報センター（NCBI）[4]に基づいています。
細胞構造と代謝
サーモプロテウスやその他の超好熱菌の代謝についても、かなりの研究が行われてきた。サーモプロテウスは硫黄還元によって独立栄養的に代謝するが、培養では硫黄呼吸によってはるかに速く成長する。T . tenaxでは、いくつかの代謝経路によって、細胞は細胞のエネルギー要件に応じて（たとえば、細胞の発生段階や成長段階に応じて）代謝モードを選択できる。すべての古細菌と同様に、サーモプロテウスは、20または40炭素分岐脂質のエーテル結合グリセロール誘導体である独自の膜脂質を持っている。脂質の不飽和は一般に共役している（細菌や真核生物に見られる非共役とは対照的）。サーモスフェラでは、クレナーキオタのすべてのメンバーと同様に、膜は膜全体にわたる40炭素脂質によって支配されている。これにより、膜は両端に極性基を持つ単層で構成されます。細胞は直径最大 4 マイクロメートル、長さ最大 100 マイクロメートルの棒状で、細胞の端に枝を発達させて個々の細胞に成長することで増殖します。鞭毛によって運動します。
エコロジー
サーモプロテウス属は酸性の温泉や水場などで発見されており、アイスランド、イタリア、北アメリカ、ニュージーランド、アゾレス諸島、インドネシアなどの生息地で隔離されている。最適生育温度は85℃である。[4] [11]
参考文献
- ^ Woese C; Olsen G (1986). 「古細菌の系統学：ウルクダムの展望」Syst Appl Microbiol . 7 (2–3): 161–77. doi :10.1016/s0723-2020(86)80001-7. PMID 11542063.
- ^ Siebers B; Zaparty M; Raddatz G; Tjaden B; Albers SV; et al. (2011). 「The Complete Genome Sequence of Thermoproteus tenax: A Physiologically Versatile Member of the Crenarchaeota」. PLOS ONE . 6 (10): e24222. Bibcode :2011PLoSO...624222S. doi : 10.1371/journal.pone.0024222 . PMC 3189178. PMID 22003381 .
- ^ JP Euzéby. 「Thermoproteus」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2023年6月10日閲覧。
- ^ ab Sayers; et al. 「Thermoproteus」。国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース。 2023年6月10日閲覧。
- ^ 「The LTP」 。 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年5月10日閲覧。
- ^ 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) 。 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ Messner P; Pum D; Sára M; Stetter K; Sleytr U (1986). 「古細菌 Thermoproteus tenax および Thermoproteus neutrophilus の細胞膜の超微細構造」J Bacteriol . 166 (3): 1046–54. doi :10.1128/jb.166.3.1046-1054.1986. PMC 215230. PMID 3086286 .
外部リンク
- BacDive の Thermoproteus - 細菌多様性メタデータ