人間の体内に存在するタンパク質
SDCBP 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1N99、1NTE、1OBX、1OBY、1OBZ、1R6J、1V1T、1W9E、1W9O、1W9Q、1YBO、4Z33
識別子 エイリアス SDCBP 、MDA-9、ST1、SYCL、TACIP18、MDA9、シンデカン結合タンパク質 外部ID OMIM : 602217; MGI : 1337026; HomoloGene : 4110; GeneCards : SDCBP; OMA :SDCBP - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体4（マウス） [2] バンド 4|4 A1 始める 6,365,650 bp [2] 終わり 6,408,423 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 網膜色素上皮 臓側胸膜 羊水 眼瞼結膜 壁側胸膜 胚上皮 血 ヒップの皮膚 神経節隆起 単球
トップの表現 骨髄間質 原腸胚 胎児肝臓造血前駆細胞 幽門洞 頭蓋冠 脛骨大腿関節 房室弁 右肺 胃の粘液細胞 顎下腺
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質N末端結合 縮れた綴じ タンパク質結合 同一のタンパク質結合 細胞骨格アンカー活性 インターロイキン5受容体結合 ホスファチジルイノシトール-4,5-ビスリン酸結合 脂質結合 カドヘリン結合 シンデカン結合 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 細胞成分
細胞質 細胞外小胞 血液微粒子 小胞体膜 膜 焦点接着 メラノソーム 接着結合 細胞膜 細胞接合 小胞体 膜ラフト 細胞外エクソソーム 細胞骨格 核 細胞外領域 細胞外空間 核質 細胞質 インターロイキン5受容体 核膜 アズール顆粒腔 細胞内膜小器官 生物学的プロセス
トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路の正の調節 細胞内シグナル伝達 細胞外エクソソームの集合の正の制御 受容体の内在化の負の調節 膜へのタンパク質標的化 エフリン受容体シグナル伝達経路 基質依存性細胞移動、細胞伸長 経路制限SMADタンパク質リン酸化の正の制御 JNKカスケードの正の制御 上皮間葉転換の正の調節 有糸分裂細胞周期の調節 プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解過程の負の制御 エクソソーム分泌の正の調節 リン酸化の正の制御 アクチン細胞骨格組織 化学シナプス伝達 細胞集団増殖の正の調節 細胞成長の積極的な制御 細胞移動の正の調節 好中球脱顆粒 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001007067 NM_001007068 NM_001007069 NM_001007070 NM_005625 NM_001330537 NM_001348339 NM_001348340 NM_001348341
RefSeq (タンパク質) NP_001007068 NP_001007069 NP_001007070 NP_001007071 NP_001317466 NP_005616 NP_001335268 NP_001335269 NP_001335270
場所 (UCSC) 8 章: 58.55 – 58.58 Mb 4 章: 6.37 – 6.41 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
シンテニン-1 は、ヒトでは SDCBP 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5]
関数 この遺伝子によってコードされるタンパク質は、当初、シンデカンを介したシグナル伝達を細胞骨格に結び付ける分子として特定されました。シンテニンタンパク質には、さまざまな膜貫通タンパク質の細胞質 C 末端ドメインに結合するタンデム反復 PDZ ドメインが含まれています。このタンパク質は、細胞骨格膜組織、細胞接着、タンパク質輸送、転写因子の活性化にも影響する可能性があります。このタンパク質は主に膜結合接着部と接着斑に局在していますが、小胞体と核にも見られます。選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生成されます。 [6]
インタラクション
参考文献
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さらに読む
Bass MD、Humphries MJ (2002)。「シンデカン-4 の細胞質相互作用が接着受容体と成長因子受容体のシグナル伝達を調整する」。Biochem . J. 368 ( Pt 1): 1–15. doi :10.1042/BJ20021228. PMC 1222989. PMID 12241528 。 Harrod TR、Justement LB (2003)。「リンパ球生物学における膜貫通タンパク質チロシンホスファターゼ CD148 の機能の評価」。Immunol . Res . 26 (1–3): 153–66. doi :10.1385/IR:26:1-3:153. PMID 12403354. S2CID 26502472. Sarkar D、Boukerche H、Su ZZ、Fisher PB (2005)。「mda-9/シンテニン：新しい細胞シグナル伝達と転移関連遺伝子に関する最近の知見」。Pharmacol . Ther . 104 (2): 101–15。doi :10.1016/ j.pharmthera.2004.08.004。PMID 15518882 。 「レター：精神医学の条件」 N. Engl. J. Med . 292 (18): 982. 1975. doi :10.1056/NEJM197505012921826. PMID 1117941. Lin JJ、 Jiang H 、 Fisher PB (1998)。「メラノーマ分化関連遺伝子-9、mda-9はヒトガンマインターフェロン応答遺伝子である」。 遺伝子 。207 (2): 105–10。doi :10.1016/S0378-1119(97)00562-3。PMID 9511750 。 Torres R、Firestein BL、Dong H、Staudinger J、Olson EN、Huganir RL、Bredt DS、Gale NW、Yancopoulos GD (1999)。「PDZタンパク質はEph受容体とそのエフリンリガンドに結合し、クラスターを形成し、シナプス的に共局在する」。 ニューロン 。21 ( 6 ) : 1453–63。doi : 10.1016 /S0896-6273(00)80663-7。PMID 9883737。S2CID 15441813 。 Lin D、Gish GD、Songyang Z、Pawson T (1999)。「Bクラスエフリンのカルボキシル末端はPDZドメイン結合モチーフを構成する」。J . Biol. Chem . 274 (6): 3726–33. doi : 10.1074/jbc.274.6.3726 . PMID 9920925。 Fernández-Larrea J、Merlos-Suárez A、Ureña JM、Baselga J、Arribas J (1999)。「プロTGF-αを細胞表面に標的化する初期分泌経路におけるPDZタンパク質の役割」。Mol . Cell . 3 (4): 423–33. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80470-0 . PMID 10230395。 Fialka I、Steinlein P、Ahorn H、Böck G、Burbelo PD、Haberfellner M、Lottspeich F、Paiha K、Pasquali C、Huber LA (1999)。「Madin-Darby 犬腎臓細胞における頂端初期エンドサイトーシス区画のタンパク質としてのシンテニンの同定」。J . Biol. Chem . 274 (37): 26233–9. doi : 10.1074/jbc.274.37.26233 . PMID 10473577。 Grootjans JJ、Reekmans G、Ceulemans H、David G (2000)。「シンテニン-シンデカンの結合には、シンデカン-シンテニーとシンテニンの両方のPDZドメインの協力が必要」。J . Biol. Chem . 275 (26): 19933–41. doi : 10.1074/jbc.M002459200 . PMID 10770943。 Koroll M、Rathjen FG、Volkmer H (2001)。「神経細胞認識分子ニューロファシンはシンテニン-1と相互作用するが、シンテニン-2とは相互作用しない。どちらも自己会合活性を示す」。J . Biol. Chem . 276 (14): 10646–54. doi : 10.1074/jbc.M010647200 . PMID 11152476。 Zimmermann P、Tomatis D、Rosas M、Grootjans J、Leenaerts I、Degeest G、Reekmans G、Coomans C、David G (2001)。「細胞接着部位およびマイクロフィラメントの構成要素としてのシンデカン結合PDZタンパク質であるシンテニンの特性」。Mol . Biol. Cell . 12 (2): 339–50. doi :10.1091/mbc.12.2.339. PMC 30947. PMID 11179419 。 Jannatipour M、Dion P、Khan S、Jindal H、Fan X、Laganière J、Chishti AH、Rouleau GA (2001)。「シュワノミンアイソフォーム1はPDZドメインを介してシンテニンと相互作用する」。J . Biol. Chem . 276 (35): 33093–100. doi : 10.1074/jbc.M105792200 . PMID 11432873。 Geijsen N、Uings IJ、Pals C、Armstrong J、McKinnon M、Raaijmakers JA、Lammers JW、Koenderman L、Coffer PJ (2001)。「IL-5Ralpha 相互作用タンパク質を介したサイトカイン特異的転写制御」。Science。293 ( 5532 ) : 1136–8。doi : 10.1126 /science.1059157。PMID 11498591。S2CID 28003281。 Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, Meyer G, Nakanishi S, Henley JM, Dev KK (2002). 「PDZ タンパク質 PICK1、GRIP、およびシンテニンは複数のグルタミン酸受容体サブタイプに結合する。PDZ 結合モチーフの分析」 (PDF) 。J . Biol. Chem . 277 (18): 15221–4. doi : 10.1074/jbc.C200112200 。PMID 11891216. S2CID 13732968。 Koo TH、Lee JJ、Kim EM、Kim KW、Kim HD、Lee JH (2002)。「シンテニンは過剰発現し、転移性ヒト乳がんおよび胃がん細胞株で細胞移動を促進する」。Oncogene . 21 ( 26): 4080–8. doi : 10.1038/sj.onc.1205514 . PMID 12037664。 Biederer T、Sara Y、Mozhayeva M、Atasoy D、Liu X、Kavalali ET、Südhof TC (2002)。「SynCAM、シナプスの組み立てを促進するシナプス接着分子」。Science。297 ( 5586 ) : 1525–31。Bibcode : 2002Sci ...297.1525B。doi : 10.1126/science.1072356。PMID 12202822。S2CID 14529914 。
