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| エイリアス | GRIK1、EAA3、EEA3、GLR5、GLUR5、GluK1、gluR-5、グルタミン酸イオンチャネル型受容体カイニン酸型サブユニット1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム: 138245; MGI : 95814;ホモロジーン: 68992;ジーンカード: GRIK1; OMA :GRIK1 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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グルタミン酸受容体イオンチャネル型カイニン酸1は、 GRIK1としても知られ、ヒトではGRIK1遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5]
関数
この遺伝子は、リガンド依存性イオンチャネルとして機能するイオンチャネル型グルタミン酸受容体（GluR）の多くのサブユニットのうちの1つをコードしています。この遺伝子によってコードされる特定のGluRサブユニットは、カイニン酸受容体サブタイプです。イオンチャネル型グルタミン酸受容体の受容体アセンブリと細胞内輸送は、RNA編集と選択的スプライシングによって制御されています。これらの受容体は興奮性神経伝達を媒介し、正常なシナプス機能に不可欠です。異なるアイソフォームをコードする2つの選択的スプライシング転写バリアントが報告されています。この遺伝子のエクソンは、この遺伝子と同じ方向に転写されるが、タンパク質をコードしていないと思われるC21orf41遺伝子のエクソンと散在しています。[5]
インタラクション
GRIK1はDLG4 [6]、PICK1 [6]、SDCBP [6]と相互作用することが示されている。
RNA編集
タイプ
A から I への RNA 編集は、RNA に作用するアデノシン脱アミナーゼのファミリー ( ADAR ) によって触媒され、これらは pre-mRNA の二本鎖領域内のアデノシンを特異的に認識し、それらを脱アミノ化してイノシンにします。イノシンは、細胞の翻訳機構によってグアノシンとして認識されます。ADAR ファミリーには ADAR 1 ～ 3 の 3 つのメンバーがあり、酵素的に活性なメンバーは ADAR1 と ADAR2 のみです。ADAR3 は脳で調節的な役割を果たしていると考えられています。ADAR1 と ADAR2 は組織で広く発現していますが、ADAR3 は脳に限定されています。RNA の二本鎖領域は、編集部位の近くの領域にある残基間の塩基対形成によって形成され、残基は通常は隣接するイントロンにありますが、エクソン配列の場合もあります。編集領域と塩基対を形成する領域は、編集相補配列 (ECS) として知られています。 ADAR は、二本鎖 RNA 結合ドメインを介して dsRNA 基質と直接結合し、相互作用します。編集部位がコーディング配列内に発生すると、コドンの変更が発生する可能性があります。これにより、主要なタンパク質構造の変化により、タンパク質アイソフォームの翻訳が発生する可能性があります。したがって、編集によってタンパク質の機能も変化する可能性があります。A から I への編集は、イントロン、非翻訳領域 (UTR)、LINE、SINE (特に Alu 反復) などの非コーディング RNA 配列で発生します。これらの領域での A から I への編集の機能には、スプライス サイトの作成や RNA の核内保持などが含まれると考えられています。
位置
GluR-5のpre-mRNAは、膜領域2（M2）にあるQ/R部位の1箇所で編集されます。編集の結果、コドンの変更があります。コドンの変更は、（CAG）グルタミン（Q）から（CGG）アルギニン（R）です。[7] GluR-6と同様に、ECSは編集部位の約2000ヌクレオチド下流にあります。[8]
規制
Q/R 部位の編集は発達と組織によって制御されます。脊髄、脳梁、小脳での編集は 50% ですが、視床、扁桃体、海馬での編集は約 70% です。
結果
構造
編集の結果、受容体の 2 番目の膜ドメインのアミノ酸が変化します。
関数
編集部位は第2細胞内ドメイン内に存在し、編集は受容体のCA2+透過性に影響を与えると考えられている。Q/R部位の編集はチャネルのCa2+透過性を低下させると考えられている[7]
Q/R部位のRNA編集は、アラキドン酸やドコサヘキサエン酸などの膜脂肪酸によるチャネルの阻害を引き起こす可能性がある[9]編集されたアイソフォームのみを持つカイニン酸受容体は、これらの脂肪酸によって強く阻害される。しかし、編集されていないサブユニットを1つ含めるだけで、この阻害を止めるのに十分である（。[9]
参照
- カイニン酸受容体
- GRIK1 RNA編集
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000171189 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022935 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab 「Entrez Gene: GRIK1 グルタミン酸受容体、イオンチャネル型、カイニン酸 1」。
- ^ abc Hirbec, Hélène; Francis, Joanna C.; Lauri, Sari E.; Braithwaite, Steven P.; Coussen, Françoise; Mulle, Christophe; Dev, Kumlesh K.; Coutinho, Victoria; Meyer, Guido; Isaac, John TR; Collingridge, Graham L.; Henley, Jeremy M.; Couthino, Victoria (2003年2月)。「PICK1とGRIPによる海馬苔状線維シナプスにおけるAMPA受容体とカイニン酸受容体の迅速で異なる調節」。Neuron . 37 ( 4 )。米国: 625–38。doi : 10.1016 /S0896-6273 ( 02)01191-1。ISSN 0896-6273。PMC 3314502 。PMID 12597860。
- ^ ab Seeburg PH、Single F、Kuner T、Higuchi M、Sprengel R (2001 年 7 月)。「マウスのグルタミン酸受容体チャネルにおけるイオンフローの主要決定因子の遺伝子操作」。Brain Res . 907 (1–2): 233–43。doi :10.1016/S0006-8993( 01 )02445-3。PMID 11430906。S2CID 11969068 。
- ^ Herb A、Higuchi M、Sprengel R、Seeburg PH (1996 年 3 月)。「カイニン酸受容体 GluR5 および GluR6 プレ mRNA の Q/R サイト編集には、離れたイントロン配列が必要」。Proc . Natl . Acad. Sci . USA 93 (5): 1875–80。Bibcode : 1996PNAS ...93.1875H。doi : 10.1073/ pnas.93.5.1875。PMC 39875。PMID 8700852。
- ^ ab Wilding TJ、Fulling E、Zhou Y、Huettner JE (2008 年 7 月)。「GluR6 の細孔ヘリックスにおけるアミノ酸置換が膜脂肪酸による阻害を制御する」。J . Gen. Physiol. 132 (1): 85–99. doi :10.1085/jgp.200810009. PMC 2442176. PMID 18562501 。
さらに読む
- Nutt SL、 Kamboj RK (1995)。 「ヒトカイニン酸受容体サブユニットのRNA編集」。NeuroReport。5 (18): 2625–9。doi : 10.1097 / 00001756-199412000-00055。PMID 7696618。
- Roche KW, Raymond LA, Blackstone C, Huganir RL (1994). 「グルタミン酸受容体サブユニット GluR6 の膜貫通トポロジー」J. Biol. Chem . 269 (16): 11679–82. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32623-6 . PMID 8163463.
- Gregor P、O'Hara BF、Yang X 、 Uhl GR (1994)。「グルタミン酸受容体遺伝子 GluR5 および GluR6の発現と新規サブユニットアイソフォーム」。NeuroReport。4 (12): 1343–6。doi : 10.1097 /00001756-199309150-00014。PMID 8260617 。
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外部リンク
- GRIK1+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館医学件名表(MeSH)