真核生物の大リボソームサブユニット（60S）

リボソーム粒子は、沈降係数に応じてスヴェドベリ単位で表記される。60Sサブユニットは真核生物の80Sリボソームの大きなサブユニットであり、他の主要構成要素は真核生物の小さなリボソームサブユニット（40S）である。これは、70S原核生物リボソームの50Sサブユニットと構造的および機能的に関連している。^{[1] [2] [3] [4] [5] [6]}しかし、60Sサブユニットは原核生物の50Sサブユニットよりもはるかに大きく、多くの追加のタンパク質セグメントとリボソームRNA拡張セグメントを含む。

下の「クラウンビュー」に示されている大サブユニットの特徴には、中央の突起 (CP) と、細菌タンパク質成分に従って命名された 2 つの茎 (サブユニットインターフェイスから見た左側が L1 茎、右側が L7/L12) があります。tRNA の結合部位は、 A サイト、P サイト、E サイトの 3 つがあります (詳細については、タンパク質翻訳に関する記事を参照してください)。60S サブユニットのコアは、28S リボソーム RNA (略して 28S rRNA) によって形成されます。これは、リボソームの活性部位 (ペプチジルトランスフェラーゼセンター、PTC) にも寄与する原核生物の23S rRNAと相同です。^{[2] [4]} rRNA コアは、数十のタンパク質で装飾されています。図「T. thermophila由来の真核生物 60S リボソームサブユニットの結晶構造」では、リボソーム RNA コアは灰色のチューブで表され、拡張セグメントは赤色で示されています。真核生物、古細菌、細菌に相同性を持つタンパク質は青色のリボンで示されています。真核生物と古細菌の間でのみ共有されるタンパク質はオレンジ色のリボンで示され、真核生物に特有のタンパク質は赤色のリボンで示されています。

表「60Sリボソームタンパク質」は、60Sサブユニットの個々のタンパク質フォールドを上記のように保存性によって色分けして示しています。数個の残基またはループから非常に長いアルファヘリックスや追加ドメインに至るまでの真核生物特有の拡張は、赤で強調表示されています。^[2]

歴史的に、リボソームタンパク質には異なる命名法が使われてきました。たとえば、タンパク質はゲル電気泳動実験での移動特性に応じて番号が付けられてきました。したがって、異なる名前は異なる生物の相同タンパク質を指す場合がありますが、同じ名前が必ずしも相同タンパク質を示すわけではありません。表「60S リボソームタンパク質」は、ヒトのリボソームタンパク質名と酵母、細菌、古細菌の相同タンパク質名を相互参照しています。^[7]さらに詳しい情報は、リボソームタンパク質遺伝子データベース (RPG) にあります。^[7]

• 真核生物の小さなリボソームサブユニット（40S）

• リボソームタンパク質遺伝子データベース (RPG)