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| アルファピトウイルス | |
|---|---|
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| アルファピトウイルスシベリカム | |
ウイルスの分類 
| |
| (ランク外): | ウイルス |
| 領域: | バリドナビリア |
| 王国： | バンフォードヴィラエ |
| 門: | 核細胞ウイルス門 |
| クラス： | メガビリケテス |
| 注文： | ピマスコウイルス科 |
| 家族： | ピトウイルス科 |
| 属: | アルファピトウイルス |
| 種[1] | |
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アルファピトウイルスは、アメーバに感染するウイルス・シベリカム[2] [3]とアルファピトウイルス・マッシリエンセ[4]の2種が知られている巨大ウイルスの属である。これはDNAベースであり、核細胞質大型DNAウイルス系統群のメンバーである。2014年にロシアのシベリアの永久凍土から採取された3万年前の氷床コアで生存可能な標本が発見された。
説明
アルファウイルスはトガウイルス科の2つの属のうちの1つであり、[5]ルビウイルス（風疹ウイルス）ともう1つのトガウイルス属です。[5]フラビウイルスは、特にダニや蚊によって伝染する一本鎖RNAウイルスです。[6]ピトウイルス科は、アメーバに感染する巨大ウイルスで、これまでに知られている中で最大のウイルス粒子を持っています。[7]
アルファピトウイルス属という名前は、古代ギリシャのピトスという大型貯蔵容器に由来し、この新種を表すために選ばれた。アルファピトウイルスの標本は、長さがおよそ 1.5μm（1500nm ）、直径が0.5μm（500nm）で、これまでに発見された中で最大のウイルスである。これは、これまで知られていた最大のウイルスであるパンドラウイルス科のウイルスよりも50%大きく、 [8]真核生物で最小の細胞であるオストレオコッカスよりも大きいが、パンドラウイルスは1.9～2.5メガベースのDNAを含む最大のウイルスゲノムを持っている。[9]
アルファピトウイルスは、一端に開口部がある厚い楕円形の壁を持ち、内部はハニカムのような構造をしています。[2]
アルファピソウイルスのゲノムには467の異なる遺伝子が含まれており、これは一般的なウイルスよりも多いが、パンドラウイルスに見られる推定タンパク質コード配列2556個よりはるかに少ない。[8]そのため、そのゲノムは他の既知のウイルスよりはるかに密度が低い。そのタンパク質の3分の2は他のウイルスのものと異なっている。パンドラウイルスとの物理的な類似性にもかかわらず、アルファピソウイルスのゲノム配列は、パンドラウイルスとはほとんど関連がなく、マルセイユウイルス科、メガウイルス科、イリドウイルス科のメンバーによく似ていることを明らかにしている。[10]これらの科にはすべて、DNAゲノムを持つ大きな二十面体のウイルスが含まれている。アルファピソウイルスのゲノムのGC含有量は36%で、メガウイルス科と似ているが、パンドラウイルスのGC含有量は61%以上である。[11]オルフェオウイルス科アルファオルフェオウイルス属、ピトウイルス科アルファピトウイルス属、セドラトウイルス科アルファセドラトウイルス属は現在ICTVによって批准されている。[12]
レプリケーション
アルファピトウイルスの ゲノムは、約 610,000塩基対(bp)の1 本の環状二本鎖 DNA ( dsDNA ) 染色体で、約 467 個のオープン リーディング フレーム(ORF) をコードし、467 個の異なるタンパク質に変換されます。[13]ゲノムは、mRNA を生成するために必要なすべてのタンパク質をコードしており、これらのタンパク質は精製されたウイルス粒子に存在します。[10]ウイルスの侵入は、ウイルス粒子が細胞に付着して内部化することで開始され、脱殻して複製と増殖のために遺伝物質を放出します。[7]したがって、アルファピトウイルスは、宿主の核を乗っ取るというより一般的な方法ではなく、宿主の細胞質内で複製サイクル全体を実行します。 [2] [10] [14]
発見
アルファピトウイルス・シベリカムは、エクス＝マルセイユ大学のシャンタル・アベルジェルとジャン＝ミシェル・クラヴェリーによって、シベリアの永久 凍土の3万年前のサンプルから発見された。[2] [15]このウイルスは、後期更新世の堆積物の地表から30メートル（100フィート）下に埋もれた状態で発見された。[3] [10]ピトウイルス・シベリカムと呼ばれるこのウイルスは、10年前に発見された巨大ウイルスの一種である。[16]このウイルスは、2000年に採取された川岸のサンプルがアメーバにさらされた際に発見された。[17]アメーバは死に始め、調べたところ、巨大ウイルスの標本を含んでいることがわかった。著者らは、2年前に同様の年齢のシレネ・ステノフィラの種子を蘇らせた実験について読んだことが、永久凍土のサンプルで新しいウイルスを調べるというアイデアを思いついたという。[2]アルファピトウイルスに関する研究結果は、 2014年3月に米国科学アカデミー紀要に掲載されました。[8] [11]
このウイルスは人間には無害だが、何千年も凍結された後も生存可能であることから、地球規模の気候変動やツンドラの掘削作業により、これまで発見されていなかった潜在的に病原性のあるウイルスが発掘される可能性があるという懸念が生じている。[8]しかし、他の科学者は、このシナリオが本当の脅威をもたらすかどうかに異議を唱えている。[2]
この属の現代種であるアルファピトウイルス・マッシリエンセは2016年に分離されました。ORFの順序や孤児遺伝子（ORFans）などのコア特徴は、既知の2種間でよく保存されています。[4]
進化
ゲノムの変異率は、 1サイトあたり年間2.23 × 10 −6置換と推定されている。 [18]著者らは、既知の2つのアルファピトウイルスが約20万年前に分岐したと示唆している。最近特定された魚類アルファウイルスであるサケ膵臓病ウイルスと睡眠病ウイルスは、新しいアルファウイルス種の変異体またはサブタイプであると思われる。[12]
参照
参考文献
- ^ 「ウイルス分類：2023年版」。国際ウイルス分類委員会。 2024年8月17日閲覧。
- ^ abcdef Yong, Ed (2014年3月3日). 「69,000年前の氷から復活した巨大ウイルス」. Nature . doi :10.1038/nature.2014.14801. S2CID 87146458.
- ^ ab モレル、レベッカ（2014年3月3日）。「3万年前の巨大ウイルスが復活」BBCニュース。
- ^ ab Levasseur A、Andreani J、Delerce J、Bou Khalil J、Robert C、La Scola B、Raoult D (2016年7月)。「現代と化石のピソウイルスの比較により、その遺伝的保全と進化が明らかになった」。Genome Biol Evol . 8 (8): 2333–9. doi :10.1093/gbe/evw153. PMC 5010891 . PMID 27389688.
- ^ ab シュマルジョン、アラン L.;デビッド・マクレーン (1996)。 「アルファウイルス（トガウイルス科）とフラビウイルス（フラビウイルス科）」。医学微生物学 (第 4 版)。テキサス大学ガルベストン医学部。ISBN 978-0-9631172-1-2. PMID 21413253。
- ^ デ・マトス、アントニオ・ペドロ・アウベス;ゼゼ、リビア。アマロ、ファティマ。アウベス、マリア・ジョアン（2021）。 「ジカウイルスに感染したマウス組織におけるウイルス抗原の位置」。ジカウイルスの生物学、伝播、および病理学。 431–441ページ。土井：10.1016/B978-0-12-820268-5.00040-7。ISBN 978-0-12-820268-5。
- ^ ab Rigou, Sofia; Schmitt, Alain; Alempic, Jean-Marie; Lartigue, Audrey; Vendloczki, Peter; Abergel, Chantal; Claverie, Jean-Michel; Legendre, Matthieu (2023年11月3日). 「ピソウイルスは、セドラトウイルスからの進化と分岐に寄与する反復配列によって侵入される」。分子生物学と進化。40 (11). doi :10.1093/molbev/msad244。
- ^ abcd Sirucek, Stefan (2014年3月3日). 「シベリアの永久凍土から蘇った古代の「巨大ウイルス」」ナショナルジオグラフィック。2014年3月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ Brumfiel, Geoff (2013年7月18日). 「世界最大のウイルスは古代に起源を持つ可能性がある」National Public Radio。
- ^ abcd Racaniello, Vincent (2014年3月4日). 「ピソウイルス：パンドラウイルスより大きく、ゲノムは小さい」Virology Blog。
- ^ ab Legendre, M.; Bartoli, J.; Shmakova, L.; Jeudy, S.; Labadie, K.; Adrait, A.; Lescot, M.; Poirot, O.; Bertaux, L.; Bruley, C.; Coute, Y.; Rivkina, E.; Abergel, C.; Claverie, J.-M. (2014 年 3 月)。「パンドラウイルス形態を持つ巨大 20 面体 DNA ウイルスの 3 万年前の遠縁種」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA 111 ( 11): 4274–9。Bibcode :2014PNAS..111.4274L。doi : 10.1073 / pnas.1320670111。PMC 3964051。PMID 24591590。
- ^ ab ケイロス、ビクトリア F.;ロドリゲス、アラバマ州ロドリゴ。アブラハオ、ジョナタス・サントス（2024年6月）。 「セドラトウイルス、オルフェオウイルス、ピトウイルスの分類学的提案」。ウイルス学のアーカイブ。169 (6): 132.土井: 10.1007/s00705-024-06055-x。PMID 38822903。
- ^ 「Pithovirus sibericum」。スイスバイオインフォマティクス研究所 (SIB) 。 2014年3月10日閲覧。
- ^ Coghlan, Andy (2014年3月3日). 「史上最大のウイルスが石器時代の永久凍土から復活」. NewScientist . 2014年3月5日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ パパス、ステファニー（2015年9月16日）。「凍結した巨大ウイルス、3万年後も感染力あり」Yahooニュース。 2015年9月20日閲覧。
- ^ 「3万年前の巨大ウイルスが復活」BBCニュース。2014年3月4日。2024年9月27日閲覧。
- ^ カール・ジマー（2014年3月3日）「シベリアの氷からウイルスが復活」ニューヨーク・タイムズ。
- ^ Duchêne, S; Holmes, EC (2018). 「古代ゲノムを用いた巨大ウイルスの進化速度の推定」. Virus Evol . 4 (1): vey006. doi : 10.1093/ve/vey006 . PMC 5829572. PMID 29511572 .
外部リンク
- ウイルスゾーン: ピソウイルス
- 「ピソウイルス シベリカム」。NCBIタクソノミー ブラウザー。1450746。