北要塞と南要塞の配置

• 第51警備部隊（942名）
• 第52警備部隊（333名）
• シュムシュ通信部隊（42名）
• 第32高射砲防衛部隊（18名）
• 北千島鎮守府
• 北東方艦隊（柏原基地、片岡基地）
• 北東部隊（189名／中島B5N2「九七式艦上爆撃機」4機、およびおそらく愛知D3A2「九九式艦上爆撃機」または横須賀D4Y2「九七式艦上爆撃機」1機）
• 第12航空部隊（川西H6K2「メイビス」および三菱G4M2「ベティ」を装備）
• 海軍航空群第203部隊、志武州分遣隊（三菱A6M5「零戦」および中島J1N1-S「アービング」夜間戦闘機を装備）
• 北斗航空隊(第553航空隊) - B5N ケイト & B6N ジル
• 第203航空隊（A6M、J1N1）
• 武蔵海軍基地（武蔵飛行場）：パラムシロ島の南西端、カラブザキに位置するこの海軍基地と飛行場は、滑走路が4,300フィート×260フィートと4,200フィート×375フィートであった。近くの岬には対空砲が8門、トーチカが20基、多数の砲座が設置されていた。
• 三吉野飛行場は、秀武州島の中心部付近に位置する陸海軍の飛行場である。この飛行場には、B5N2「九七式艦上攻撃機」、G3M「九七式艦上攻撃機」 、Ki-43「オスカー」など、複数の部隊が配備されていた。
• 片岡海軍基地（今崎飛行場）：この基地には、長さ5,000フィート×幅250フィートと長さ4,000フィート×幅250フィートの2本の滑走路があった。基地には、13の屋根付き掩蔽壕と34の屋根なし掩蔽壕を備えた、長さ130フィート×幅165フィートの大型格納庫、3基の60フィート石油貯蔵タンク、その他の兵舎や補給施設があった。また、基地の港には水上機施設があり、第5艦隊司令部としてH6K2メイビス飛行艇が基地内で運用されていた。

こうした部隊は、水上機母艦「君川丸」（第452航空隊が乗艦し、中島A6M2-N「ルーフェ」水中戦闘機を装備）によって増強されることもあった。

また、パラムシロ島の南端、クラブザキには、種類は不明だが日本の航空早期警戒レーダーが設置されていたが、パラムシロ島中央にある標高5958フィートの火山（硫黄島の硫黄島と同じ名前の摺鉢山と思われる）によってシュムシュウの視界は遮られていた可能性が高い。

• 第41独立混成連隊（上田大佐）
• 第6独立戦車中隊
• 松和陸軍野戦大隊
• 松和航空情報部隊
• 第102飛行隊、第553航空隊（D3A2九九式22型を装備した航空海軍部隊）
• 島の南部地域に東西方向の滑走路が建設される可能性があり、 最大長さは1.33 kmを超える可能性がある^{[ 4 ]。}

ウルップには6000人の兵士が駐屯しており、その内訳は以下の通り。

• 第129独立混成旅団（ニホ少佐）
• 第53アンカレッジ部隊
• 第6上陸部隊（800名）
• 第80飛行場大隊
• ウルップ航空情報部隊（800名）
• 第5独立戦車中隊
• 第23独立対空砲中隊

シャシュコタン（大乙女基地^{[ 5 ] [ 6 ]}）とオンネコタン（トルシリ基地^{[ 7 ]} ）にもユニットが存在した可能性がある。

• 第4混成旅団（第89師団所属）
• 第23独立機関銃大隊
• 第1迫撃砲中隊／第15独立迫撃砲大隊

• 第421大隊（第89師団所属の第4混成旅団の一部）
• 第23特別警備中隊

歯舞群島には他にも別働隊（貝柄群島、水晶島、秋百合島、由利島、志物津島、多楽島）があったと思われる。