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宮古湾海戦（みやこわんかいせん）は、 1869年5月6日に行われた海戦で、新しく成立した蝦夷共和国の旗の下、旧徳川幕府に忠誠を誓う武士たちが、明治政府軍の旗艦である皇鉄の拿捕に失敗した戦いである。戊辰戦争末期の函館攻防戦の一部であった。
江戸城が明治政府に降伏し、上野の戦いと会津の戦いで大きな損害を被ったにもかかわらず、旧徳川幕府に忠誠を誓う多くの軍人や指導者は敗北を認めようとしなかった。大上越列盤同明が崩壊する中、榎本武昭提督率いる徳川海軍の一部は、数千人の兵士と少数のフランス人軍事顧問とともに北の島、北海道に逃れ、蝦夷共和国を建国した。[ 1 ]
新たに創設された大日本帝国海軍は、1869年3月9日に東京湾を出港し、3月20日に岩手県中部の宮古市にあたる宮古湾に到着した。帝国艦隊は、米国から購入したフランス製の装甲艦「光鉄」を中心に急速に編成された。その他の艦艇には、 「春日」「飛龍」「第一亭坊」「陽春」「茂春」などがあり、これらは1868年に佐賀、長州、薩摩の各藩から新中央政府に提供されたものであった。帝国艦艇は全部で8隻あり、 「光鉄」「春日」、小型コルベット3隻、輸送船3隻であった。後に大日本帝国海軍総司令官となる東郷平八郎は、この時「春日」の士官であった。
帝国艦隊が蝦夷侵攻に向かっていることを予期した榎本武明は、海軍奉行新井育之 助の指揮下にある3隻の軍艦を派遣し、革新的な新型軍艦「甲鉄」を奪取する臨検作戦を決行した。これにより帝国軍は甚大な損害を受け、蝦夷共和国は侵攻の準備をする時間、あるいは佐朝連合とのより有利な条件での交渉を行う時間を稼ぐことができると考えた。
蝦夷軍は新井育之助指揮下の回天（蝦夷共和国海軍旗艦）を先頭とし、精鋭部隊である新選組の隊長土方歳三、そして元フランス海軍の軍事顧問アンリ・ニコルが同行した。ニコルはボルドー出身であり、同市で建造された戦艦甲鉄の特性や構造を熟知していたため、この攻撃に選ばれた。全体の戦略は、同じくフランス人顧問のウジェーヌ・コラシュが立案し、精鋭部隊である神木隊とともに高雄（旧名アシュエロット）に乗船して作戦に同行した。蝦夷艦隊の3番艦は万龍で、精鋭部隊である遊撃隊と、大砲を担当する元フランス海軍の補給係将クラトーが乗艦していた。
奇襲をかけるため、飛行隊は偽旗作戦を計画し、回天はアメリカ国旗を掲げて宮古湾に進入した。しかし、作戦は目的地に到着する前に問題に見舞われた。飛行隊は航行中に悪天候に見舞われ、高雄はエンジン故障を起こし、万龍は離脱した。万龍は結局戦闘に参加することなく北海道に帰還した。高雄 はエンジン故障のため3ノット（5.6km /h）以上の速度を出すことができず、回天が攻撃を開始した時にははるか後方にいた。
回転は停泊中の帝国海軍艦艇に接近し、甲鉄に乗り込む直前に蝦夷共和国の旗を掲げた。回転は艦首を甲鉄の側面にぶつけ、砲撃を開始した。しかし、回転の甲板は甲鉄の甲板より3メートル近く高かったため、乗り込もうとした侍たちは一人ずつ飛び降りるしかなかった。最初の奇襲が収まった後、甲鉄はガトリング砲で攻撃を撃退し、攻撃側に大きな損害を与えた。攻撃してきた侍のほとんどが死亡し、ニコルは2発の銃弾を受け、乗船部隊の指揮官である甲賀源吾は戦死し、その地位は新井育之助提督が引き継いだ。この戦闘で回転は帝国軍艦3隻に損害を与えたが、甲鉄を捕獲することなく撤退した。
回天は宮古湾を出港したが、高雄が入港するのとほぼ同時刻に、帝国艦隊（攻撃開始前からエンジンを暖めていた）に追われていた。回天は最終的に北海道へ逃れたが、高雄は追跡者を振り切るには速度が遅すぎ、宮古湾からほど近い場所で座礁し、乗組員が内陸へ逃げる間、自沈した。乗組員40名（侍30名と元フランス軍将校ウジェーヌ・コラシュを含む）は数日間逃亡したが、最終的に政府軍に投降した。彼らは裁判のため東京へ連行された。日本の反乱者たちのその後の運命は不明だが、コラシュは最終的に恩赦を受け、フランスへ送還された。
宮古海戦は、蝦夷共和国軍が強力な艦「甲鉄」を無力化しようとした大胆かつ決死の試みであった。これは日本における装甲蒸気船への臨検（乗船）作戦の最初の事例となった。試みは失敗に終わったものの、「高雄」の喪失は軽微なものであった。帝国海軍は妨害を受けることなく北進を続け、函館の戦いにおいて数千人の政府軍の上陸作戦と戦闘を支援した。