ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ＭＲＥ１１ 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス MRE11 、ATLD、HNGS1、MRE11B、MRE11A、MRE11 ホモログ A、二本鎖切断修復ヌクレアーゼ、MRE11 ホモログ、二本鎖切断修復ヌクレアーゼ 外部ID オミム ：600814; MGI : 1100512; ホモロジーン : 4083; ジーンカード ：MRE11; OMA :MRE11 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 9番染色体（マウス） [2] バンド 9|9 A2 始める 14,695,950 bp [2] 終わり 14,748,419 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 アキレス腱 卵母細胞 二次卵母細胞 睾丸 腓骨神経 生殖腺 結腸上皮 単球 直腸 心室帯
トップの表現 外胚葉 耳小胞 耳板 精子細胞 精母細胞 球形嚢 胚葉上層 胎児の尾 原始的な線 性器結節
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 マンガンイオン結合 DNAヘリカーゼ活性 一本鎖DNAエンドデオキシリボヌクレアーゼ活性 タンパク質C末端結合 タンパク質結合 3'-5'エキソヌクレアーゼ活性 ヌクレアーゼ活性 エンドヌクレアーゼ活性 二本鎖DNA結合 エンドデオキシリボヌクレアーゼ活性 エキソヌクレアーゼ活性 加水分解酵素活性 カドヘリン結合 同一のタンパク質結合 3'-5'-エキソデオキシリボヌクレアーゼ活性 5'-3'エキソヌクレアーゼ活性 細胞成分
二本鎖切断部位 細胞質 PML本体 核 細胞質 核質 テロメア 染色体 Mre11複合体 レプリケーションフォーク 生物学的プロセス
減数分裂相互組み換え DNA組み換え テロメラーゼによるテロメア維持 キナーゼ活性の正の調節 有糸分裂S細胞内DNA損傷チェックポイントシグナル伝達 テロメア3'オーバーハング形成 アポトーシス過程の負の調節 染色体の構成 姉妹染色分体凝集 DNA損傷刺激に対する細胞反応 テロメア維持の正の調節 DNA二重鎖の解離 減数分裂における相同染色体対合 DNAの重複に対する負の調節 二本鎖切断修復 減数分裂 相同組換えによる二本鎖切断の修復 タンパク質の自己リン酸化の正の制御 細胞集団の増殖 有糸分裂G2 DNA損傷チェックポイントシグナル伝達 ウイルスプロセス 非相同末端結合による二本鎖切断の修復 I型インターフェロン産生の正の調節 有糸分裂組換えの調節 DNA修復 核酸ホスホジエステル結合加水分解 DNA二本鎖切断処理 ストランド変位 DNA複製 DNA修復に関わるDNA合成 p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の調節 テロメア維持 減数分裂DNA二重鎖切断の形成 相同組換えによるミトコンドリア二重鎖切断の修復 複製フォーク処理に関与するDNA鎖切断 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_005590 NM_005591 NM_001330347
RefSeq (タンパク質) NP_001317276 NP_005581 NP_005582
場所 (UCSC) 11 章: 94.42 – 94.49 Mb 9 章: 14.7 – 14.75 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
二本鎖切断修復タンパク質MRE11 （ 減数分裂組換え11 ）は、ヒトでは MRE11 遺伝子 によってコードされる 酵素である。 [5] この遺伝子は、現在 MRE11P1と名付けられている疑似遺伝子 MRE11B と区別するために MRE11A と命名されている 。
関数 この遺伝子は、相同組換え 、 テロメア 長維持、および DNA 二本鎖切断 修復に関与する核タンパク質をコードしています 。このタンパク質は単独で、3' から 5' への エキソヌクレアーゼ 活性と エンドヌクレアーゼ活性を持っています。このタンパク質は RAD50 ホモログと複合体を形成します。この複合体は DNA 末端の 非相同結合 に必要であり 、一本鎖 DNA エンドヌクレアーゼ活性と 3' から 5' へのエキソヌクレアーゼ活性が増大しています。DNA リガーゼと連携して 、 このタンパク質は DNA 断片の末端近くの短い相同性を利用して、in vitro で非相補末端の結合を促進します。この遺伝子は 染色体 3 に 擬遺伝子 を持っています。この遺伝子の 選択的スプライシング により、異なるアイソフォームをコードする 2 つの転写バリアントが生成されます。 [6]
オルソログ ヒトMRE11の相同遺伝子であるMre11は、 原核生物古 細菌 Sulfolobus acidocaldarius に存在します。 [7] この生物では、Mre11タンパク質は Rad50タンパク質と相互作用し、ガンマ線照射によって実験的に誘発された DNA損傷 の修復に積極的な役割を果たしているようです 。 [7]同様に、 真核原生 生物 テトラヒメナ の減数分裂中、 Mre11はDNA損傷（この場合は 二本鎖切断 ）の修復に必要であり 、 [8] このプロセスには 相同組み換え が含まれる可能性があります。これらの観察から、ヒトMRE11は、DNA損傷の修復の初期プロセスで役割を果たした原核生物および原生生物の祖先Mre11タンパク質から派生したものであることが示唆されます。
癌における過剰発現 MRE11は、二本鎖切断の マイクロホモロジー媒介末端結合 （MMEJ）修復に関与している。これは、このエラーを起こしやすいDNA修復経路に必要な6つの酵素のうちの1つである。 [9] MRE11は乳がんで過剰発現している。 [10]
がんでは 1 つ以上の DNA 修復遺伝子の発現が欠損していることが非常に多いが、がんにおける DNA 修復遺伝子の過剰発現はそれほど一般的ではない。例えば、少なくとも 36 個の DNA 修復酵素が生殖細胞で突然変異により欠損すると、がんのリスクが増加する (遺伝性 がん症候群 )。 [ 要出典 ] ( DNA 修復欠損症 も参照 )。同様に、少なくとも 12 個の DNA 修復遺伝子が 1 つ以上のがんにおいてエピジェネティックに抑制されていることが頻繁に確認されている。 [ 要出典 ] ( エピジェネティックに低下した DNA 修復と がんも参照 )。通常、DNA 修復酵素の発現が欠損すると修復されない DNA 損傷が増加し、これが複製エラー ( 損傷乗り越え合成 ) によって突然変異やがんにつながる。しかし、MRE11 を介した MMEJ 修復は非常に不正確であるため、この場合は発現不足ではなく過剰発現が明らかにがんにつながる。
インタラクション MRE11 は以下と相互作用する ことが示されています :
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000020922 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031928 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Petrini JH、Walsh ME、 DiMare C、Chen XN、Korenberg JR 、Weaver DT（1995年9月）。「ヒトMRE11ホモログの単離と特徴付け」。ゲノミクス。29 （ 1 ） ： 80-6。doi ： 10.1006 /geno.1995.1217。PMID 8530104。 ^ 「Entrez Gene: MRE11 MRE11 減数分裂組換え 11 ホモログ A (S. cerevisiae)」. ^ ab Quaiser A、Constantinesco F、White MF、Forterre P、Elie C (2008 年 2 月)。「Mre11 タンパク質は Rad50 と HerA 双極性ヘリカーゼの両方と相互作用し、ガンマ線照射後の古細菌 Sulfolobus acidocaldarius の DNA にリクルートされる 」 。BMC Molecular Biology。9 : 25。doi : 10.1186 / 1471-2199-9-25。PMC 2288612。PMID 18294364 。 ^ Lukaszewicz A、Howard-Till RA、Novatchkova M、Mochizuki K、Loidl J (2010 年 10 月)。「MRE11 と COM1/SAE2 は、原生生物テトラヒメナの減数分裂中の二本鎖切断修復と効率的な染色体対合に必要である」。Chromosoma . 119 ( 5): 505– 18. doi :10.1007/s00412-010-0274-9. PMID 20422424. S2CID 12642689. ^ Sharma S、Javadekar SM、Pandey M、Srivastava M、Kumari R、Raghavan SC (2015 年 3 月)。「マイクロホモロジー依存性代替末端結合の相同性と酵素要件」。Cell Death & Disease。6 ( 3 ) : e1697。doi :10.1038/cddis.2015.58。PMC 4385936。PMID 25789972 。 ^ Yuan SS、Hou MF、Hsieh YC、Huang CY、Lee YC、Chen YJ、Lo S (2012年10月)。「乳がんの細胞増殖、腫瘍浸潤、DNA修復におけるMRE11の役割」。 国立 がん 研究所誌 。104 (19): 1485– 502。doi : 10.1093/jnci/ djs355。PMID 22914783 。 ^ Kim ST、Lim DS、Canman CE、Kastan MB (1999 年 12 月)。「ATM キナーゼファミリーメンバーの基質特異性と推定基質の同定」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 53): 37538– 43。doi : 10.1074/jbc.274.53.37538。PMID 10608806 。 ^ abcd Wang Y, Cortez D, Yazdi P, Neff N, Elledge SJ, Qin J (2000 年 4 月). 「BASC、異常な DNA 構造の認識と修復に関与する BRCA1 関連タンパク質のスーパー複合体」. Genes & Development . 14 (8): 927–39 . doi :10.1101/gad.14.8.927. PMC 316544. PMID 10783165. ^ ab Chiba N, Parvin JD (2001年10月). 「複製阻害後の4つの異なるタンパク質複合体間のBRCA1の再分布」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (42): 38549–54 . doi : 10.1074/jbc.M105227200 . PMID 11504724. ^ Paull TT、Cortez D、Bowers B、Elledge SJ、Gellert M (2001 年 5 月)。「Brca1 による直接 DNA 結合」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。98 ( 11 ): 6086–91。doi : 10.1073/ pnas.111125998。PMC 33426。PMID 11353843 。 ^ Zhong Q, Chen CF, Li S, Chen Y, Wang CC, Xiao J, et al. (1999年7月). 「BRCA1とhRad50-hMre11-p95複合体の関連およびDNA損傷応答」. Science . 285 (5428): 747–50 . doi :10.1126/science.285.5428.747. PMID 10426999. ^ ab Goedecke W, Eijpe M, Offenberg HH, van Aalderen M, Heyting C (1999年10月). 「Mre11とKu70は体細胞で相互作用するが、減数分裂初期には異なる発現を示す」. Nature Genetics . 23 (2): 194– 8. doi :10.1038/13821. PMID 10508516. S2CID 13443404. ^ Xu X、 Stern DF（2003年10月）。「 NFBD1 /MDC1は 、 DNAチェックポイント シグナル 伝達と修復因子によって電離放射線誘発性フォーカス形成を制御する」。FASEB ジャーナル 。17 （ 13）： 1842–8。doi ： 10.1096/fj.03-0310com。PMID 14519663。S2CID 24870579 。 ^ ab Trujillo KM、Yuan SS、 Lee EY 、Sung P（1998年8月）。「ヒト組換えおよびDNA修復因子Rad50、Mre11、およびp95の複合体におけるヌクレアーゼ活性」。The Journal of Biological Chemistry。273 （ 34）： 21447–50。doi ： 10.1074/ jbc.273.34.21447。PMID 9705271 。 ^ Cerosaletti KM、Concannon P (2003 年 6 月)。「ニブリンフォークヘッド関連ドメインと乳がん C 末端ドメインは、どちらも核フォーカスの形成とリン酸化に必要である」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 24): 21944– 51。doi : 10.1074/ jbc.M211689200。PMID 12679336 。 ^ Matsuzaki K, Shinohara A, Shinohara M (2008年5月). 「ヒトNbs1の相同遺伝子である酵母Xrs2のフォークヘッド関連ドメインは、リガーゼIVパートナータンパク質Lif1との相互作用を通じて非相同末端結合を促進する」. Genetics . 179 (1): 213– 25. doi :10.1534/genetics.107.079236. PMC 2390601. PMID 18458108 . ^ Desai-Mehta A、Cerosaletti KM、 Concannon P (2001 年3 月)。「ニブリンの異なる機能ドメインが Mre11 の結合、 フォーカス 形成、核局在を仲介する」。 分子 細胞 生物学 。21 (6): 2184–91。doi :10.1128/MCB.21.6.2184-2191.2001。PMC 86852。PMID 11238951 。 ^ Dolganov GM、Maser RS、Novikov A、Tosto L、Chong S、Bressan DA、Petrini JH (1996 年 9 月)。「ヒト Rad50 はヒト Mre11 と物理的に関連している: 組換え DNA 修復に関与する保存された多タンパク質複合体の特定」。 分子 細胞 生物 学 。16 (9): 4832– 41。doi :10.1128 / MCB.16.9.4832。PMC 231485。PMID 8756642 。 ^ Zhu XD、Küster B、Mann M、Petrini JH、de Lange T (2000 年 7 月)。「細胞周期によって制御される RAD50/MRE11/NBS1 と TRF2 およびヒトテロメアとの関連」。Nature Genetics . 25 (3): 347– 52. doi :10.1038/77139. PMID 10888888. S2CID 6689794.
さらに読む
Dolganov GM、Maser RS、Novikov A、Tosto L、Chong S、Bressan DA、Petrini JH (1996 年 9 月)。「ヒト Rad50 はヒト Mre11 と物理的に関連している: 組換え DNA 修復に関与する保存された多タンパク質複合体の特定」。 分子 細胞 生物 学 。16 (9): 4832– 41。doi : 10.1128/MCB.16.9.4832。PMC 231485。PMID 8756642 。 Carney JP、Maser RS、Olivares H、Davis EM、Le Beau M、Yates JR、他 (1998 年 5 月)。「hMre11/hRad50 タンパク質複合体とナイメーヘン切断症候群: 二本鎖切断修復と細胞 DNA 損傷応答の関連性」 。Cell。93 ( 3 ) : 477– 86。doi : 10.1016 / S0092-8674 (00)81175-7。PMID 9590181。S2CID 14548642 。 Paull TT、Gellert M (1998 年 6 月)。「Mre 11 の 3' から 5' へのエキソヌクレアーゼ活性は DNA 二本鎖切断の修復を促進する」。Molecular Cell . 1 (7): 969– 79. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80097-0 . PMID 9651580。 Trujillo KM、Yuan SS、Lee EY 、 Sung P (1998 年 8 月)。「ヒト組換えおよび DNA 修復因子 Rad50、Mre11、p95 の複合体におけるヌクレアーゼ活性」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 34): 21447– 50。doi : 10.1074/jbc.273.34.21447。PMID 9705271 。 Chamankhah M、Wei YF 、Xiao W (1998 年 12 月)。「hMRE11B の分離: 種特異的なタンパク質相互作用による酵母 mre11 欠陥の補完の失敗」。Gene . 225 ( 1– 2 ) : 107– 16。doi :10.1016/S0378-1119(98)00530-7。PMID 9931460。 Zhong Q、Chen CF、Li S、Chen Y、Wang CC、Xiao J、他 (1999 年 7 月)。「BRCA1 と hRad50-hMre11-p95 複合体および DNA 損傷応答との関連」。Science。285 ( 5428 ) : 747–50。doi : 10.1126 /science.285.5428.747。PMID 10426999 。 Goedecke W、Eijpe M、Offenberg HH、van Aalderen M、Heyting C (1999 年 10 月)。「Mre11 と Ku70 は体細胞で相互作用するが、減数分裂初期には異なる発現を示す」。Nature Genetics。23 ( 2 ) : 194– 8。doi : 10.1038/13821。PMID 10508516。S2CID 13443404 。 Kim ST、Lim DS、Canman CE、Kastan MB (1999 年 12 月)。「ATM キナーゼ ファミリー メンバーの基質特異性と推定基質の同定」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 53): 37538– 43。doi : 10.1074/jbc.274.53.37538。PMID 10608806 。 Stewart GS、Maser RS、Stankovic T、Bressan DA、Kaplan MI、Jaspers NG、他 (1999 年 12 月)。「DNA 二本鎖切断修復遺伝子 hMRE11 は、毛細血管拡張性運動失調症様疾患の患者で変異している」。Cell . 99 ( 6): 577– 87. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81547-0 . PMID 10612394. S2CID 14434655. Wang Y、Cortez D、Yazdi P、Neff N、Elledge SJ、Qin J (2000 年 4 月)。「BASC、異常な DNA 構造の認識と修復に関与する BRCA1 関連タンパク質のスーパー複合体」。 遺伝子 と 発達 。14 ( 8 ): 927– 39。doi :10.1101/gad.14.8.927。PMC 316544。PMID 10783165 。 Gatei M、Young D、Cerosaletti KM、Desai- Mehta A、Spring K、Kozlov S、他 (2000 年 5 月)。「放射線被曝に対するニブリンの ATM 依存性リン酸化」。Nature Genetics。25 ( 1 ) : 115– 9。doi : 10.1038/75508。PMID 10802669。S2CID 23521589。 Zhu XD、Küster B、Mann M、Petrini JH、de Lange T (2000 年 7 月)。「細胞周期によって制御される RAD50/MRE11/NBS1 と TRF2 およびヒトテロメアとの関連」。Nature Genetics。25 ( 3 ) : 347– 52。doi : 10.1038/77139。PMID 10888888。S2CID 6689794 。 de Vries H、Rüegsegger U、Hübner W、Friedlein A、Langen H、Keller W (2000 年 11 月)。「ヒトの pre-mRNA 切断因子 II(m) には酵母タンパク質の相同体が含まれており、他の 2 つの切断因子を橋渡しする」。EMBO Journal。19 ( 21 ) : 5895– 904。doi : 10.1093 /emboj/19.21.5895。PMC 305781。PMID 11060040 。 Fukuda T, Sumiyoshi T, Takahashi M, Kataoka T, Asahara T, Inui H, et al. (2001年1月). 「癌における二本鎖切断修復遺伝子MRE11の変異」. Cancer Research . 61 (1): 23– 6. PMID 11196167. Desai-Mehta A、Cerosaletti KM 、 Concannon P (2001 年 3 月)。「ニブリンの異なる機能ドメインが Mre11 の 結合、フォーカス形成、核局在を仲介する」。 分子 細胞生物学 。21 (6): 2184–91。doi : 10.1128/ MCB.21.6.2184-2191.2001。PMC 86852。PMID 11238951 。 Paull TT、Cortez D、Bowers B、Elledge SJ、Gellert M (2001 年 5 月)。「Brca1 による直接 DNA 結合」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。98 ( 11 ): 6086–91。doi : 10.1073/ pnas.111125998。PMC 33426。PMID 11353843 。 Hopfner KP、Karcher A、Craig L、Woo TT、Carney JP、Tainer JA (2001 年 5 月)。「DNA 二本鎖切断修復 Mre11 ヌクレアーゼと Rad50-ATPase の構造生化学と相互作用アーキテクチャ」。Cell . 105 (4): 473– 85. doi : 10.1016/S0092-8674 ( 01)00335-X . PMID 11371344. S2CID 15913630。 Pitts SA、Kullar HS、Stankovic T、Stewart GS、Last JI、Bedenham T、他 (2001 年 5 月)。「hMRE11: ゲノム構造と、ナンセンス変異による mRNA の崩壊から保護された転写産物で特定されたヌル変異」。 ヒト 分子 遺伝学 。10 (11): 1155– 62。doi : 10.1093/ hmg /10.11.1155。PMID 11371508 。 千葉 N、 Parvin JD (2001 年 10 月)。「複製阻害 後 の BRCA1 の 4 つの異なるタンパク質複合体への再分布」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 42): 38549– 54。doi : 10.1074/jbc.M105227200。PMID 11504724 。 Beikzadeh M、Latham MP (2020年 10月)。 「 Mre11-Rad50 DNA切断修復複合体の動的性質」。 生物 物理 学と分子生物学の進歩 。163 ： 14〜22。doi ： 10.1016/ j.pbiomolbio.2020.10.007。PMC 8065065。PMID 33121960 。
