Loading article…
| LDB3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | LDB3、CMD1C、CMPD3、CYPHER、LDB3Z1、LDB3Z4、LVNC3、MFM4、ORACLE、PDLIM6、ZASP、CMH24、LIMドメイン結合3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：605906; MGI : 1344412;ホモロジーン: 134626;ジーンカード：LDB3; OMA :LDB3 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LIMドメイン結合3（LDB3 ）は、 Zバンド選択的スプライシングPDZモチーフ（ZASP ）としても知られ、ヒトではLDB3遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6] ZASPはタンパク質のエニグマサブファミリーに属し、心筋と骨格筋のアクチンとの相互作用を通じて、収縮時にサルコメア（筋肉の基本単位）を安定化します。ZASP遺伝子の変異は、いくつかの筋肉疾患と関連しています。
構造
ZASP はPDZ ドメインを含むタンパク質です。PDZ モチーフは、80～120 個のアミノ酸残基からなるモジュール型タンパク質間相互作用ドメインです。PDZ ドメインを含むタンパク質は、細胞骨格の組み立てで互いに相互作用したり、膜タンパク質の標的化やクラスター化に関与する他のタンパク質と相互作用します。ZASP は、N 末端PDZ ドメインを介してアルファアクチニン2と相互作用し、C 末端LIM ドメインを介してタンパク質キナーゼ Cと相互作用します。LIM ドメインは、2 つの亜鉛結合モジュールを含む 50～60 個のアミノ酸で定義されるシステインに富んだモチーフです。このタンパク質は、ミオゼニンファミリーの 3 つのメンバーすべてとも相互作用します。[5]
ヒトZASPは、16のエクソンの選択的スプライシングに基づいて、心臓細胞と骨格細胞に6つの異なるアイソフォームとして存在することができます。[7] ZASPの短縮形は2つあります（Uniprot ID：O75112-6、31.0 kDa、283アミノ酸; [8]およびUniprot ID：O75112-5、35.6 kDa、330アミノ酸）。[9]および4つのZASPロングフォーム（Uniprot ID：O75112-4、42.8 kDa、398アミノ酸; [10] Uniprot ID：O75112-3、50.6 kDa、470アミノ酸; [11] Uniprot ID：O75112-2、66.6 kDa、617アミノ酸; [12]およびUniprot ID：O75112、77.1 kDa、727アミノ酸）。[13] [14] すべてのZASPアイソフォームはN末端PDZドメインと、ZASP様モチーフ（ZM）として知られる内部の保存された配列を持ち、4つの長いアイソフォームは3つのC末端 LIMドメインを持っています。[7]
関数
ZASPは収縮中にサルコメアの構造的完全性を維持する機能を持ち、タンパク質キナーゼAシグナル伝達に関与することが示されている。[15] ZASPはタンパク質TLN1とともにα5β1インテグリンを共活性化することも示されている。[16]
臨床的意義
ZASPの変異は、筋原線維性 ミオパチー[17] 、拡張型心筋症[18]、[19] 、 不整脈性右室心筋症[20] 、非緻密化心筋症[18]、[21] 、筋ジストロフィー[17]と関連している。
インタラクション
ZASPのPDZドメインはαアクチニン2のC末端に結合し[ 6 ] [ 22 ] 、 ZMはαアクチニン2のロッドドメインに結合します。[23] LIMドメインはタンパク質キナーゼCと相互作用することが示されている。[22] [24]エクソン4によってコードされるZASPの心臓特異的領域にはZPモチーフが含まれており、タンパク質キナーゼA の調節サブユニットに結合します。[15]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000122367 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000021798 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab "Entrez Gene: LDB3 LIM ドメイン結合 3"。
- ^ ab フォークナー G、パラヴィチーニ A、フォルメンチン E、コメリ A、イエヴォレラ C、トレヴィサン S、他。 (1999 年 7 月)。 「ZASP: 新しい Z バンド選択的にスプライシングされた PDZ モチーフタンパク質」。Jセルバイオル。146 (2): 465-75。土井：10.1083/jcb.146.2.465。PMC 3206570。PMID 10427098。
- ^ ab Sheikh F、Bang ML、Lange S、Chen J (2007 年 11 月)。「横紋筋の機能、シグナル伝達、およびヒト疾患における Cypher の役割の解明」。Trends in Cardiovascular Medicine。17 ( 8 ): 258–62。doi :10.1016/ j.tcm.2007.09.002。PMC 2134983。PMID 18021935。
- ^ “O75112-6”. 2015年6月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2015年6月11日閲覧。
- ^ “O75112-5”. 2015年6月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2015年6月11日閲覧。
- ^ “O75112-4”. 2015年6月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2015年6月11日閲覧。
- ^ “O75112-3”. 2015年6月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2015年6月11日閲覧。
- ^ “O75112-2”. 2015年6月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2015年6月11日閲覧。
- ^ “O75112”. 2015年6月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2015年6月11日閲覧。
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, et al. (2013年10月). 「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」. Circulation Research . 113 (9): 1043–53. doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ ab Lin C, Guo X, Lange S, Liu J, Ouyang K, Yin X, et al. (2013年10月). 「Cypher/ZASPは新しいAキナーゼアンカータンパク質です」. The Journal of Biological Chemistry . 288 (41): 29403–13. doi : 10.1074/jbc.M113.470708 . PMC 3795241. PMID 23996002 .
- ^ Bouaouina M, Jani K, Long JY, Czerniecki S, Morse EM, Ellis SJ, et al. (2012年12月). 「Zaspはインテグリンの活性化を制御する」. Journal of Cell Science . 125 (Pt 23): 5647–57. doi :10.1242/jcs.103291. PMC 3575701. PMID 22992465 .
- ^ ab Selcen D, Engel AG (2005年2月). 「ZASPの変異がヒトの筋ジストロフィーの新しい形を定義する」Annals of Neurology . 57 (2): 269–76. doi :10.1002/ana.20376. PMID 15668942. S2CID 25733755.
- ^ ab Vatta M、Mohapatra B、Jimenez S、Sanchez X、Faulkner G、Perles Z、他 (2003 年 12 月)。「拡張型心筋症および左室非緻密化患者における Cypher/ZASP の変異」。米国心臓病学会誌。42 (11): 2014–27。doi : 10.1016/ j.jacc.2003.10.021。PMID 14662268。
- ^ Arimura T, Hayashi T, Terada H, Lee SY, Zhou Q, Takahashi M, Ueda K, Nouchi T, Hohda S, Shibutani M, Hirose M, Chen J, Park JE, Yasunami M, Hayashi H, Kimura A (2004 年 2 月). 「拡張型心筋症に関連する Cypher/ZASP 変異はタンパク質キナーゼ C への結合親和性を変化させる」. The Journal of Biological Chemistry . 279 (8): 6746–52. doi : 10.1074/jbc.M311849200 . PMID 14660611.
- ^ Lopez-Ayala JM、Ortiz-Genga M、Gomez-Milanes I、Lopez-Cuenca D、Ruiz-Espejo F、Sanchez-Munoz JJ、et al. (2014 年 7 月)。「Z ライン Cypher/ZASP タンパク質の変異は不整脈原性右室心筋症と関連している」。臨床遺伝学。88 ( 2 ): 172–6。doi :10.1111 / cge.12458。PMID 25041374。S2CID 21822009。
- ^ Xi Y, Ai T, De Lange E, Li Z, Wu G, Brunelli L, et al. (2012年10月). 「左室非緻密化における心室内伝導障害に関連するZASP1変異によるhNav1.5の機能喪失」Circulation: 不整脈および電気生理学. 5 (5): 1017–26. doi :10.1161/CIRCEP.111.969220. PMC 4331025. PMID 22929165 .
- ^ ab Zhou Q, Ruiz-Lozano P, Martone ME, Chen J (1999 年 7 月). 「Cypher は横紋筋に限定された PDZ および LIM ドメイン含有タンパク質で、α-アクチニン-2 およびタンパク質キナーゼ C に結合する」. The Journal of Biological Chemistry . 274 (28): 19807–13. doi : 10.1074/jbc.274.28.19807 . PMID 10391924.
- ^ Klaavuniemi T、Ylänne J (2006 年 5 月)。「Zasp/Cypher 内部 ZM モチーフ含有フラグメントは、α-アクチニンと共局在するのに十分である - 患者の突然変異の分析」。実験細胞研究。312 (8): 1299–311。doi :10.1016/ j.yexcr.2005.12.036。PMID 16476425 。
- ^ 黒田 誠、徳永 千恵、清原 勇、樋口 修、小西 秀、水野 健、他 (1996 年 12 月)。「ジンクフィンガー LIM ドメインとプロテインキナーゼ C のタンパク質間相互作用」。The Journal of Biological Chemistry . 271 (49): 31029–32. doi : 10.1074/jbc.271.49.31029 . PMID 8940095。
さらに読む
- Marziliano N、Mannarino S、Nespoli L、Diegoli M、Pasotti M、Malattia C、他 (2007 年 5 月)。「TAZ 遺伝子と LDB3 遺伝子の複合ヘミ接合性とヘテロ接合性に関連する Barth 症候群」。American Journal of Medical Genetics Part A。143A ( 9): 907–15。doi : 10.1002 /ajmg.a.31653。hdl : 2434 /45968。PMID 17394203。S2CID 20328643。
- Klaavuniemi T、Ylänne J (2006 年 5 月)。「Zasp/Cypher 内部 ZM モチーフ含有フラグメントは、α-アクチニンと共局在するのに十分である - 患者の突然変異の分析」。実験細胞研究。312 (8): 1299–311。doi :10.1016/ j.yexcr.2005.12.036。PMID 16476425 。
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, et al. (2006年1月). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特徴付け」. Genome Research . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
- Frey N、Olson EN (2002 年 4 月)。「カルサルシン ファミリーの骨格筋特異的な新規メンバーであるカルサルシン 3 は、複数の Z ディスク タンパク質と相互作用します」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 16): 13998–4004。doi : 10.1074/ jbc.M200712200。PMID 11842093。
- Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。ゲノム研究。10 ( 11): 1788–95。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863。
- Passier R、Richardson JA、Olson EN (2000 年 4 月)。「Oracle、心臓と骨格筋で発現する新規 PDZ-LIM ドメインタンパク質」。発達のメカニズム。92 ( 2 ): 277–84。doi : 10.1016/S0925-4773(99) 00330-5。PMID 10727866。S2CID 18254892 。
- 石川 健、永瀬 剛、須山 正之、宮島 直、田中 明、小谷 秀、野村 直、小原 修 (1998 年 6 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。X. 試験管内で大きなタンパク質をコードできる脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全な配列」。DNA研究。5 ( 3): 169–76。doi : 10.1093/dnares/ 5.3.169。PMID 9734811。
- Lanfranchi G、Muraro T、Caldara F、Pacchioni B、Pallavicini A、Pandolfo D、他 (1996 年 1 月)。「DNA シーケンシングとフィルター ハイブリダイゼーションによるヒト骨格筋の 3' 末端特異的 cDNA ライブラリからの 4370 個の発現配列タグの識別」。ゲノム研究。6 ( 1): 35–42。doi : 10.1101/ gr.6.1.35。PMID 8681137 。
外部リンク
- 筋原線維性ミオパチーに関する GeneReviews/NIH/NCBI/UW のエントリ
- PDBe-KBのUniProt : O75112 (ヒト LIM ドメイン結合タンパク質 3)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。
- PDBe-KBのUniProt : Q9JKS4 (マウス LIM ドメイン結合タンパク質 3)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。