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| クリセオバクテリウム | |
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| 固形LB培地で増殖した Chryseobacterium oleae DSM25575細菌 | |
科学的分類 
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| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | バクテロイデス |
| クラス： | フラボバクテリア |
| 注文： | フラボバクテリア |
| 家族： | ツルニチニチソウ科 |
| 属: | クリセオバクテリ ウム・ヴァンダム他1994 |
| 種 | |
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テキストを参照 | |
| 同義語[1] | |
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クリセオバクテリウムはグラム陰性 細菌の属です。クリセオバクテリウム属は化学有機栄養性の桿菌です。クリセオバクテリウムはフレキシルビン型色素により典型的な黄橙色のコロニーを形成します。この属には淡水源、土壌、海水魚、ヒト宿主など多様な生息地に生息する100種以上の記載種が含まれます。 [2]
歴史
Chryseobacterium属は、もともと 1994 年に Vandammeら[3]によって、当時Flavobacterium属に分類されていた 6 つの細菌分類群、つまりF. balustinum、F. indologenes、F. gleum、F. meningosepticum、F. indoltheticum、およびF. scophthalmumに対して作成されました。2005 年には、 Chryseobacterium属内の 2 種、つまりC. meningosepticumとC. miricolaに対してElizabethkingia属が追加されました[4]。2002年には、 Flavobacteriaceae科の新分類群の記述に関する基準とガイドラインがBernardetらによって出版されました。[5] 2006年までにクリセオバクテリウム属は10種にまで拡大し、2014年までに60種を超え[6]、現在では100種を超えています。
エコロジー
クリセオバクテリウム属菌は、土壌、植物の根、花、腐敗した植物材料、カエデの樹液から回収されました。植物に関連するクリセオバクテリウム株の中には、植物病原菌を阻害できるものがあります。クリセオバクテリウム属菌は、淡水の小川、湖、その堆積物、水冷却システム、飲料水、乳酸飲料、ビール瓶詰め工場、バイオリアクターのスラッジ、汚染された土壌、海洋堆積物、永久凍土からも回収されました。[6]クリセオバクテリウム属菌は多くの動物と関連しており、蚊の中腸、ゴキブリの腸、ヤスデの糞、ペンギンのグアノ、淡水カイアシ類の腸ホモゲネート、鳥の羽、牛乳、生肉、鶏肉などから検出されています。一見健康な魚の粘液から検出されたが、腐敗菌とみなされることもある。[6]イスラエルの生乳から、耐寒性を有するクリセオバクテリウム属の3つの新種、C. oranimense 、 C. haifense、C. bovisが検出されている。[7]
病因
最も病原性の高い Flavobacterium 属のChryseobacterium meningosepticumは、数多くの感染症を引き起こしましたが、 Elizabethkingia属に再分類されました。[4] Chryseobacterium indologenes は自然界に遍在し、主に土壌と水中に見られますが、ヒトへの病原体としてはまれです。しかし、まれに、特に免疫不全患者では重篤な感染症を引き起こすことがあります。[8]感染症のほとんどは院内感染で、免疫抑制や留置カテーテルに関連していることが多いです。菌血症、腹膜炎、肺炎、膿胸、腎盂腎炎、膀胱炎、髄膜炎、中心静脈カテーテル関連感染症の原因物質として報告されています。C . indologenes感染症の報告数は増加しています。報告されている感染症の大部分は台湾で発生しており、アジア以外で発生したのはわずか 10% 程度です。オーストラリア、インド、ヨーロッパ、米国からいくつかの報告があります。[8] C. indologenesも軟ダニに病原性がありますが、他のChryseobacterium属細菌は病気のカメ、カエル、魚から検出されており、特にC. scophthalmum、C. joostei、C. piscicola、C. chaponense、C. viscerum、C. oncorhynchi、C. aahli、C. hominis、C. shigense が検出されたほか、ヒトの病気に関連するC. indologenesも検出されたことがあります。[6]
特定のクリセオバクテリウム種は、羽毛や外骨格など、最も分解が難しいコラーゲンマトリックスを分解できるという、珍しいマトリックス分解特性を持つことが報告されている。これらの特性は、特定のキチナーゼやコラーゲナーゼ様メタロプロテアーゼの作用を介している可能性が高い。クリセオバクテリウム・ネマトファガムなどの種は、通常は非常に不溶性のクチクラ外骨格を含むすべての線虫組織に感染し、殺し、最終的には消費できることが示された。[9]キチナーゼ、ゼラチナーゼ、コラーゲナーゼメタロプロテアーゼの活性は、タイプIX分泌システムを介して発揮されるクリセオバクテリウムの滑走運動に関連している。実際、これらの酵素のいくつかは、C末端にタイプIX分泌シグナルを持っている。[10] クリセオバクテリウム自体は、コラーゲンもキチンタンパク質や構造も持っていない。クリセオバクテリウム属はバクテロイデス門に属し、そのメンバーは異常に連動した運動性と分泌システムを持つとますます説明されるようになっている。[9] [10]
ボツリヌス神経毒素様（BoNT様）毒素がクリセオバクテリウム・ピペリ菌株CTMのゲノムから検出され、BoNT様毒素の非常に多様なグループを形成している。予測されたC. ピペリのBoNT様毒素の1つは、ヒトの腎臓細胞で壊死性細胞死を誘発したが、BoNTの一般的なSNARE基質を切断することは確認されなかった。[11]
抗生物質耐性
クリセオバクテリウム属菌は、テトラサイクリン、エリスロマイシン、リネゾリド、ポリミキシン、アミノグリコシド、クロラムフェニコール、多くのベータラクタムを含む広範囲の抗生物質に対して本質的に耐性があり、バンコマイシンとクリンダマイシンに対しては中程度の感受性を示し、トリメトプリム-スルファメトキサゾールに対しては感受性が異なります。[6]
種
種には以下が含まれる: [1]
- クリセオバクテリウム・アーリ・ ロッホ・アンド・ファイサル 2014
- クリセオバクテリウム・ アングスタディカークら2013
- Chryseobacterium antarcticum (Yi et al . 2005) Kämpfer et al . 2005 2009年
- Chryseobacterium anthropi Kämpfer et al . 2009年
- 「Chryseobacterium antibioticum」Dahal et al . 2021年
- クリセオバクテリ ウム・アクアティカムキムら2008
- クリセオバクテリウム・アキフリギデンセ パーク他2008
- クリセオバクテリウム・アラキディラディ シス ケンファーら2015
- クリセオバクテリウム・アラキディス ケンファーら2014
- クリセオバクテリウム アルスロスファエ ラエ ケンファーら2010
- Chryseobacterium artocarpi Venil et al . 2014年
- Chryseobacterium aurantiacum Luo et al . 2018年
- クリセオバクテリウム・アウレウム Lee et al . 2019年
- クリセオバクテリウム・バルスティナム （ハリソン 1929）ヴァンダムら1994
- クリセオバクテリウム・ベルナルデティ ・ホームズら2013
- クリセオバクテリウム・ビンゾウエンセ ・メン他2020
- Chryseobacterium bovis Hantsis-Zacharov et al . 2008年
- Chryseobacterium buanense (Joung et al . 2010) García-López et al . 2010 2020年
- クリセオバクテリ ウムカエニ クアン他2007
- クリセオバクテリウム・ カメリアエクックら2014
- Chryseobacterium candidae Indu et al . 2020年
- Chryseobacterium carnipullorum Charimba et al . 2013年
- クリセオバクテリウム・ カーニス・ホームズら。 2013年
- クリセオバクテリウム・ シャポネンセ・ケンプファーら。 2011年
- 「クリセオバクテリウム・チェンデュエンシス」ウェン他2016
- 「クリセオバクテリウム・チョンジエンセ」チャウダリー他2021
- 「クリセオバクテリウム・チュンガンゲンシス」ハク 2018
- クリセオバクテリウム・コンタミナンス ケンファーら2014
- Chryseobacterium cucumeris Jeong et al . 2017年
- Chryseobacterium culicis Kämpferら。 2010年
- クリセオバクテリウム・ダエチョンセ キム他2005
- Chryseobacterium daeguense Yoon et al . 2007年
- クリセオバクテリウム・デフルビイ ケンファーら2003
- クリセオバクテリウム・エキノイデオラムリンら2015
- クリセオバクテリウム・エリミ Cho et al . 2011
- Chryseobacterium endophyticum Lin et al . 2017年
- Chryseobacterium flavum Zhou et al . 2007年
- クリセオバクテリウム・フォルモセンスヤングら2005
- 「クリセオバクテリウム・フォルモス」Akter et al . 2015年
- Chryseobacterium frigidisoli Bajerski et al . 2013年
- クリセオバクテリウム・フリジダム・キムら。 2016年
- Chryseobacterium gallinarum Kämpfer et al . 2014年
- クリセオバクテリウム・ガンブリニ ヘルツォークら2008
- クリセオバクテリウム・ジオカルポ スファエラエ ケンファーら2014
- Chryseobacterium ginsengisoli Nguyen et al . 2013年
- 「クリセオバクテリウム・ジンセンギテラエ」能他2017
- クリセオバクテリウム・ジンセンギテラエ ・ハーンケら2017
- クリセオバクテリウム・ジンセノシディミュータンス イム他2011
- クリセオバクテリウム・グラシエイ ・パルら。 2018年
- Chryseobacterium gleum (Holmes et al . 1984) Vandamme et al . 1984 1994年
- クリセオバクテリウム・グレガリウム ベーレンドら2008
- クリセオバクテリウム・グァンジュエンス ・パーク他2013
- クリセオバクテリウム・ハガメンセ Cho et al . 2011
- クリセオバクテリウム ハイフェンセ ハンシス・ザカロフとハルパーン 2007
- クリセオバクテリウム・ハルペルニアエハーンケら2017
- クリセオバクテリウム・ヒスパレンセ モンテロ・カラサンツ他2013
- Chryseobacterium hispanicum Gallego et al . 2006年
- Chryseobacterium hominis Vaneechoutte et al . 2007年
- クリセオバクテリウム・ フミ・ピレスら。 2010年
- Chryseobacterium hungaricum Szoboszlay et al . 2008年
- クリセオバクテリウム・インドロゲネス （藪内ら1983）ヴァンダムら1994
- クリセオバクテリウム・インドルテティカム （キャンベルとウィリアムズ 1951）ヴァンダムら1994
- クリセオバクテリウム・ジェジュ エンス・ウェンら2008
- Chryseobacterium jeonii (Yi et al . 2005) Kämpfer et al . 2005 2009年
- クリセオバクテリウム・ ヨーステイ・ヒューゴら。 2003年
- クリセオバクテリウム・コレンセ (Kim et al . 2004) Kämpfer et al . 2009
- Chryseobacterium kwangjuense Sangら。 2013年
- クリセオバクテリウム・ラクティス ・ホームズら2013
- Chryseobacterium lacus Zhang et al . 2020年
- クリセオバクテリウム・ラシリ Cho et al . 2011
- Chryseobacterium limigenitum Kämpfer et al . 2015年
- クリセオバクテリウム・リネア・ チャオら2017
- クリセオバクテリウム・ルテウム ・ベーレンドら2007
- 「クリセオバクテリウム・マノスクエンス」ボックスバーガー他2020
- Chryseobacterium marinum (Lee et al . 2007) Kämpfer et al . 2007 2009年
- 「カンジダトゥス・クリセオバクテリウム・マッシリエンス」コリッグ。グルーブら。 2004年
- クリセオバクテリウム・モール Herzog et al . 2008
- Chryseobacterium montanum Guo et al . 2016年
- 「クリセオバクテリウム・ムコビスシドーシス」テッツとテッツ 2018
- Chryseobacterium mulctrae Yoon et al . 2019年
- クリセオバクテリウム・ナカガワイ ・ホームズら2013
- 「クリセオバクテリウム・ネマトファガム」Page et al . 2019
- クリセオバクテリウム・ネパレンセ チャウダリーとキム 2017
- Chryseobacterium oleae Montero-Calasanz et al . 2014年
- クリセオバクテリウム・オンコルリンチ・ ザモラら。 2012年
- Chryseobacterium oranimense Hantsis-Zacharov et al . 2008年
- クリセオバクテリウム・パリダム ヘルツォークら2008
- クリセオバクテリウム・パルストレ ピレスら2010
- 「クリセオバクテリウム・パナシス」Singh et al . 2016年
- クリセオバクテリウム・ペニプルロラム・ オーストハイゼンら。 2019年
- 「クリセオバクテリウム・フォカエンセ」Abou Abdallah et al . 2019年
- クリセオバクテリウム・ホスファティリティ カム ジョンら2019
- クリセオバクテリウム・ピペリ ストラハンら2011
- Chryseobacterium piscicola Ilardi et al . 2009年
- クリセオバクテリウム・ ピシウム・デ・ビールら。 2006年
- クリセオバクテリウム・ポリトリカストリ チェンら2015
- クリセオバクテリウム・ポプリ Bortniak et al . 2019
- Chryseobacterium profundimaris Xuら。 2015年
- 「クリセオバクテリウム・プロテオリチカム」山口・横江 2000
- クリセオバクテリウム・サイクロトレランス (Ge et al . 2015) Hahnke et al . 2017
- クリセオバクテリウム・レティキュリテミティス Zhao et al . 2017
- クリセオバクテリウム・リゾプラナエ ケンファーら2015
- クリセオバクテリウム・リゾスファエラエ Cho et al . 2011
- クリセオバクテリウム・リギイ パーク他2013
- Chryseobacterium salipaludis Divyasree et al . 2018年
- クリセオバクテリウム・サリビクター キム・ユウ 2020
- クリセオバクテリウム・スコフタルムム （ムダリスら1994）ヴァンダムら1994
- Chryseobacterium sediminis Kämpfer et al . 2015年
- 「クリセオバクテリウム・セネガレンセ」ロー他2016
- Chryseobacterium shandongense Yang et al . 2015年
- クリセオバクテリウム・ シゲンセ 下村ら2005
- 「クリセオバクテリウム・シルリ」オーら。 2020年
- Chryseobacterium solani Du et al . 2015年
- クリセオバクテリウム・ソルダネリコラ パーク他2006
- クリセオバクテリウム・ ソリ・ウェンら2008
- クリセオバクテリウム・ソリンコラ ベンマレクら2010
- クリセオバクテリウム・タアエンセ パーク他2006
- クリセオバクテリウム・タイチュンゲンセシェンら2005
- クリセオバクテリウム・タイフエンセ Wu et al . 2013
- クリセオバクテリウム・ タイワネンセタイら2006
- クリセオバクテリウムタカキ アエ趙ら2015
- Chryseobacterium taklimakanense (Peng et al . 2009) Holmes et al . 2009 2013年
- クリセオバクテリウム・テナックス (O'Sullivan et al . 2006) Hahnke et al . 2006 2017年
- 「カンジダトゥス・クリセオバクテリウム・ティモネンセ」コリッグ。ドランクールら。 2004年
- 「クリセオバクテリウム・ティモニアヌム」アブー・アブダラ他2017
- Chryseobacterium treverense Yassin et al . 2010年
- Chryseobacterium tructae Zamora et al . 2013年
- クリセオバクテリウム・ ウレイリチカム ヘルツォークら2008
- Chryseobacterium vaccae Lee et al . 2020年
- クリセオバクテリウム・ベトナムンセ・ リーとチュー 2012
- Chryseobacterium viscerum Zamora et al . 2012年
- Chryseobacterium vrystaatense de Beerら。 2005年
- クリセオバクテリウム・ワンジュエンス・ウェンら2006
- クリセオバクテリウム・シンジアンセンス Zhao et al . 2011
- Chryseobacterium xixisoli (Feng et al . 2014) Hahnke et al . 2014 2017年
- 「クリセオバクテリウム・ヨンチョネンセ」ホアン他2013
- クリセオバクテリウム・ヨンギネンセ ジョウンとジョ 2011
- Chryseobacterium zeae Kämpfer et al . 2014年
- 「クリセオバクテリウム・ジェンゾウエンセ」王ら2016
参考文献
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