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生物学において、タイプとは、生物の学名が正式に関連付けられている特定の標本（または場合によっては標本のグループ）のことである。言い換えれば、タイプとは、その特定の分類群の特徴を固定または中心化する役割を果たす例である。古い用法（1900年以前の植物学）では、タイプは標本ではなく分類群であった。[ 1 ]
分類群とは、詳細な公表された記述（例えば種の記述）と、通常、主要な博物館の研究コレクションや同様の機関で科学者が調査できるタイプ標本の提供に基づいて、類似の生物を含む生物の科学的に命名されたグループであり、一部の生物を含み、他の生物を除外する集合である。[ 1 ] [ 2 ]
国際動物命名規約（ICZN）および藻類、菌類、植物の国際命名規約（ICN）に定められた厳密な規則によれば、すべての分類群の学名は、ほぼ常に1つの特定の標本、または場合によっては複数の標本に基づいています。タイプは生物学者、特に分類学者にとって非常に重要です。タイプは通常、博物館や植物標本館の研究コレクションに保管されている実物標本ですが、それがない場合は、その分類群の個体の画像がタイプとして指定されることもあります。[ 3 ]種の記載とタイプ標本の指定は、科学的命名法とアルファ分類学の一部です。
標本を同定する際、科学者は、関連する分類群に関する自身の理解に基づき、標本または標本群に分類群名を適用しようと試みます。この際、少なくともタイプ標本の説明を読み、できれば関連するすべての分類群のタイプ標本をすべて検討することが推奨されます。もし、同じ分類群と思われる複数のタイプ標本が存在する場合、最も古い名前が優先され、手元の標本の正しい名前とみなされます。一方、その分類群がこれまで全く命名されたことがないと思われる場合は、科学者または他の資格のある専門家がタイプ標本を選び、新しい名前と公式な説明を発表します。
対象となる生物に適用される命名法コードによって、タイプは標本、培養物、図、または（細菌学コードの下では）記述となる。[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
例えば、ロンドンの自然史博物館の研究コレクションには、1886.6.24.20という番号の鳥類標本があります。これは、一般的にハイイロチュウヒとして知られる鳥の一種で、現在の学名はCircus assimilisです。この標本は、この種のホロタイプであり、 Circus assimilisという学名は、定義上、この標本が属する種を指します。この種は1828年にジャーディンとセルビーによって命名・記載され、ホロタイプは他の科学者が必要に応じて参照できるように博物館のコレクションに収蔵されました。
少なくともタイプ標本に関しては、「典型的な」個体を使用する必要はありません。属や科、特に初期の分類学者によって確立されたものは、その属や科にとってより「典型的」な種にちなんで命名される傾向がありますが、ここでも常にそうであるとは限らず、分類体系の変更によりそうすることはできません。したがって、生物学的タイプは「典型的な」個体や分類群を定義するのではなく、特定の操作的分類単位に学名を固定するという事実を示すために、命名タイプまたはオノマトフォアという用語が使用されることがあります。タイプ標本は理論的には異常または奇形個体または色変異であっても構いませんが、個体がどの集団に属していたかを判断するのが難しくなるため、そのような選択をされることはまれです。[ 1 ] [ 2 ] [ 7 ]
「タイプ」という用語の使い方は、植物学と動物学で若干異なる用法があるため、やや複雑です。PhyloCodeでは、タイプに基づく定義は系統発生に基づく定義に置き換えられています。
古い分類学の著作の中には、「タイプ」という言葉が異なる意味で使われているものもある。最初の植物命名法では意味が似ていたが、[ 8 ] [ 9 ]他の著作では分類群という用語に近い意味になっている。 [ 10 ]
セクションの種類を区別するための特徴を示します。 ... さまざまな形式の研究を行った後、具体的なタイプを検討してください。
翻訳：この単一の特徴により、このタイプをこの節の他のすべての種から区別することができます...さまざまな形態を研究した後、私はそれらが同一の特定のタイプに属すると考えるようになりました。
植物命名法において、タイプ（タイプ、命名タイプ）とは、「分類群の名前が永久に付随する要素」である（第7.2条）[ 11 ]。植物学において、タイプは標本または図のいずれかである。標本とは、実際の植物（または植物の1つ以上の部分、あるいは多数の小さな植物）であり、死んで安全に保管され、標本館（または菌類の場合はそれに相当するもの）に「キュレーション」されている。図がタイプとして使用される例には、次のものがある。
タイプは分類群の範囲を決定するものではありません。例えば、一般的なタンポポは議論の多い分類群です。100種以上から成ると考える植物学者もいれば、単一の種と考える植物学者もいます。タンポポ（ Taraxacum officinale）という名前のタイプは、その種の範囲にすべての小さな種が含まれる場合（タンポポは「大きな」種）でも、100種のうちの1つの小さな種のみに限定される場合（タンポポは「小さな」種）でも同じです。タンポポ（ Taraxacum officinale）という名前は同じで、名前のタイプも同じですが、実際にその名前が適用される範囲は大きく異なります。分類群の範囲を設定するのは、分類学者が出版物の中で行います。
雑記：
ICNは様々な種類のタイプの一覧を提供している（第9条および用語集）[ 11 ] 。その中で最も重要なのはホロタイプである。これらは
「タイプ」という言葉は、植物学文献において、国際植物命名規則（ICN）の下では地位を持たない古い用語の一部として登場する。例えば、クローンタイプなどである。
動物命名法において、種または亜種のタイプ標本とは、標本または標本群のことである。属または亜属のタイプ標本とは、種である。上位分類群（科など）のタイプ標本とは、属である。上科より上位の分類群にはタイプ標本は存在しない。「命名タイプ標本」とは、「分類群名の適用を決定できる客観的な基準を提供する」標本または画像のことである。
実際には、生物学者は（入手可能な場合）新種の標本を多数調べてから正式な種の説明を公表することもあるが、それでもなお、種の命名に関する正式な規則（国際動物命名規約）の下では、公表される説明の一部として、単一のタイプ標本を指定しなければならない。
タイプ記載には診断（通常、近縁種との類似点と相違点についての考察）と、タイプ標本が検査のために保管されている場所を示す記述を含めなければならない。タイプ標本が最初に発見された地理的な場所は、タイプ産地として知られている。寄生虫の場合、この用語はタイプ宿主（または共生型）は、タイプ標本が採取された宿主生物を示すために使用されます。 [ 12 ]
動物標本コレクションは大学や博物館によって維持管理されています。標本を良好な状態で保管し、分類学者が調査できるようにすることは、こうしたコレクションの重要な機能の2つです。ホロタイプは1つしか指定されていませんが、他にも「タイプ」標本が存在する可能性があり、それらは以下のように正式に定義されています。
原記載で単一の標本が明確に指定されている場合、その標本はその種のホロタイプとして知られています。 [ 13 ]ホロタイプは通常、主要な博物館または同様の有名な公共コレクションに保管され、他の生物学者が後で自由に調査できるようにします。
原記載でホロタイプが指定されている場合、著者が同じ種の追加の代表標本として指定する標本が存在することがあり、これらはパラタイプと呼ばれます。これらは学名を付けるタイプではありません。
アロタイプとは、パラタイプの中から指定される、ホロタイプとは反対の性別の標本のことである。この言葉はかつて、化石のホロタイプには見られない特徴を示す標本にも使われていた。[ 14 ]この用語は国際動物命名規約（ICZN）によって規制されていない。
ネオタイプとは、元のホロタイプが紛失または破壊された場合、あるいは原著者が標本を引用しなかった場合などに、後から唯一のタイプ標本として選定された標本のことである。
シンタイプとは、ホロタイプが指定されていない種の説明において、記載されている2つ以上の標本のうちのいずれかを指します。歴史的には、シンタイプは明示的に指定されることが多かったのですが、現在の国際動物命名規約（ICZN）では、これは必須事項となっています。しかし、シンタイプに基づいて種の説明を発表しようとする現代の試みは、分類学者の間では概して好ましくないものとみなされており、そのほとんどは徐々にレクトタイプに置き換えられつつあります。現在も存在するシンタイプは、依然として命名基準標本とみなされています。
レクトタイプとは、複数のシンタイプ標本から最初に記載された種の唯一のタイプ標本として後に選定された標本のことです。動物学において、レクトタイプは一種の命名タイプ標本です。ある種が複数の標本からなる命名タイプ標本に基づいて最初に記載された場合、そのうちの1つがレクトタイプとして指定されることがあります。命名タイプ標本が1つだけであれば、特に一連のシンタイプ標本に複数の種の標本が含まれることが珍しくないことを考えると、混乱の可能性を減らすことができます。
正式には、カール・リンネは1959年にホモ・サピエンスのレクトタイプに指定されました。 [ 15 ] [ 16 ]彼は動物命名法の一部とみなされる最初の本である『自然の体系』第10版を出版し、その中にホモ・サピエンスの最初の記述と、この種の有効なシンタイプをすべて決定しました。[ 15 ]重要なことに、1959年にウィリアム・スターン教授はリンネの貢献についてさりげなく、「リンネ自身が、彼のホモ・サピエンスのタイプとして立つべきである」と書いています。 [ 15 ] [ 17 ]彼は、自伝を5回も書いたリンネが最も研究した標本はおそらく彼自身であったと指摘することで、その選択を正当化しました。[ 16 ]これにより、リンネはホモ・サピエンスのレクトタイプとして十分かつ正しく指定されました。[ 15 ]
エドワード・コープがホモ・サピエンスのレクトタイプであるという提案もなされているが、これは1994年にルイ・プシホヨスがボブ・バッカーによる未発表の提案を報告したことに基づくものである。[ 15 ]しかし、この指定は、エドワード・コープが『Systema Naturae』第10版に記載されている標本の1つではないため、シンタイプではないという理由で不適格であること、および1959年のスターンの指定が優先権を持ち、将来の指定を無効にするという理由の両方で無効である。[ 15 ]
パラレクトタイプとは、レクトタイプが指定された後、シンタイプのセットから追加される標本のことである。これらは命名タイプではない。[ 18 ]
原生生物における特殊なケースで、タイプ標本は血液塗抹標本などの調製媒体内の「直接関連する個体」の 2 つ以上の標本から構成される。パラハパントタイプおよびレクトハパントタイプという用語は、ハパントタイプに追加され、記載著者によって指定されたタイプ標本を指す。[ 19 ]他のタイプ指定と同様に、ネオハパントタイプのように「ネオ-」の接頭辞の使用は、元のハパントタイプの代替が指定された場合、または元の記載に指定されたタイプ標本が含まれていない場合に使用される。[ 20 ]
新種または新亜種の基となったイラスト。例えば、ビルマニシキヘビ（Python bivittatus ）は、アルベルトゥス・セバ（1734）のイラストに基づいている多くの種のうちの1つである。[ 21 ] [ 22 ]
エルガトタイプとは、多型階級を持つ膜翅目昆虫において、働きアリを代表する標本として選ばれたものである。[ 14 ]
ハイポタイプとは、以前に詳細が発表された標本で、種の補足図や説明に使用されているものです。[ 23 ]
「クレプトタイプ」という用語は、盗まれた、または不適切に移動されたタイプ標本またはその一部を非公式に指します。[ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] [ 27 ]
動物学者もタイプ図版を利用しており、例えばレユニオンインコは歴史的な図版や記述からしか知られていない。[ 28 ]： 24
近年、タイプ標本が生きたまま野生に放たれた種が記載された例がいくつかある。例えば、Bulo Burti boubou（ブッシュシュライク）はLaniarius liberatusとして記載され、その記載には血液と羽毛のサンプルから得られたDNA配列が含まれていた。このような種の地位について将来疑問が生じないと仮定すれば、タイプ標本がないことはその名称を無効にするものではないが、将来疑問が生じた場合に備えて、そのような分類群のネオタイプを指定する必要が生じるかもしれない。しかし、ブッシュシュライクの場合、鳥類学者は入手可能な血液と羽毛のサンプルのみを用いて、その標本は古くから知られている種の、これまで知られていなかった珍しい色彩変異体であると主張した。実際に殺された個体をタイプ標本として保管する必要性についてはまだ議論があるが、適切な証拠保管と保存を行えば、種の有効性について論争が生じた場合、組織サンプルも同様に価値があることがわかる。
上記に挙げた様々なタイプ標本が必要なのは、多くの種が1世紀か2世紀前に記載された当時、単一のタイプ標本（ホロタイプ）が指定されていなかったことが多いためです。また、タイプ標本は必ずしも丁寧に保存されていたわけではなく、戦争や火災などの出来事によって元のタイプ標本が失われてしまったケースもあります。種の学名の正当性は、多くの場合、元のタイプ標本の存在にかかっています。タイプ標本が見つからない場合、あるいはそもそも存在しなかった場合は、記載内容の明確さにかかっています。
ICZNは、規約の初版が発行された1961年以降に設立された組織です。ICZNは、種の歴史的有効性を証明するために必ずしもタイプ標本を要求するわけではなく、タイプ標本を持たない種も数多く存在します。現行版の規約第75.3条では、種の「分類学的地位を明確にする」ための「特別な必要性」がない限り、ネオタイプの指定を禁止しています（第75.2条）。
接尾辞「-type」を使用する用語には、他にも多くの順列やバリエーションがあります（例：allotype、cotype、topotype、generitype、isotype、isoneotype、isolectotypeなど）が、これらは規約で正式に規制されておらず、その多くは廃止または特異なものです。ただし、これらのカテゴリの一部は、ネオタイプなどの真正のタイプ標本に適用できる可能性があります。たとえば、ネオタイプが選択される時点で入手可能な場合、アイソタイプ/トポタイプ標本は他の標本よりも優先されます（元のタイプと同じ時期および/または場所からのものであるため）。 トポタイプは、元のタイプ標本と同じ場所から得られた標本です。[ 29 ]
規約では、「固定」という用語は、当初の指定によるか後続の指定によるかを問わず、名称を付した型式を宣言することを意味する。
各属には、指定されたタイプ種が必要です（かつては「遺伝子型」という用語が使われていましたが、遺伝学における別の概念を表す用語として広く知られるようになったため、現在は使われていません）。属の記載は通常、主にそのタイプ種に基づいて行われ、他の属種の特徴によって修正・拡張されます。属名は、その属名を冠するタイプ種と永続的に結び付けられます。
理想的には、タイプ種は属の本質的な特徴を最もよく体現しているべきであるが、これは主観的なものであり、最終的には規約の要件ではないため、技術的には無関係である。タイプ種が詳細な調査の結果、既存の属に属することが判明した場合（よくあることである）、構成種はすべて既存の属に移されるか、元のタイプ種から切り離されて新しい属名が与えられる必要がある。古い属名は同義語となり、例外を設ける緊急の必要性がない限り放棄される（例外は国際動物命名委員会への請願により個別に決定される）。
模式属とは、科または亜科の名称の基となる属のことです。模式種と同様に、模式属は必ずしも最も代表的な属とは限りませんが、通常は最も早く記載された属、最も大きい属、または最もよく知られている属です。科の名称が、シノニムとなった模式属の名称に基づいていることは珍しくありません。そのような場合でも、科の名称を変更する必要はありません。