遺伝子型は、 タイプ標本 からの遺伝子配列 を記述するために 2010 年に提案された分類学的概念です。[ 1 ] [ 2 ] 分子系統学 と生物分類学 で使用される用語を統合しています。この命名法は、タイプ標本から採取された遺伝子配列にラベルを付けたり、フラグを付けたりするように設計されています。遺伝子型の命名法では、ホロタイプからの遺伝子配列は「 ホロ遺伝子型」（「ホロタイプ」と「遺伝子型」から）、トポタイプからの配列は「トポ遺伝子型」などと呼ばれるべきであると提案されています。さらに、使用された遺伝子マーカー も命名法に組み込む必要があります（例：パラ遺伝子型 ND2）。
遺伝子型の命名システムは、タイプ標本に直接関連しているため、種の同定に問題がある可能性のある標準配列よりも信頼性が高い「ゴールドスタンダード」配列を識別できるようにするために使用できます。GenBank 上の多くの配列は誤同定に悩まされており、タイプ標本にリンクされた配列があれば、誤同定の特定と管理、および比較に利用できる確実に同定された「ゴールドスタンダード」配列の作成に役立ちます。この命名法は、タイプ標本からの配列を表示または議論する出版物やデータベースで使用することが推奨されます。[ 3 ] [ 2 ]
遺伝子型の例としては、以下のようなものがあります。
遺伝子型の概念は、遺伝子型が名前を持つ型 と同等であるという研究者間の混乱のため、2013年に提案されたGenSeqの 概念に取って代わられた。[ 6 ]
参考文献 ↑ Chakrabarty, Prosanta (2010). "Genetypes: a concept to help integration molecular systematics and traditional taxonomy" (PDF) . Zootaxa . 2632 : 67– 68. doi : 10.11646/zootaxa.2632.1.4 . 1 2 Harrison, IJ; Chakrabarty, P.; Freyhof, J.; Craig, JF (2011 年 5 月). 「標本および遺伝子配列の保存と目録作成に関する正しい命名法と推奨事項」 . Journal of Fish Biology . 78 (5): 1283– 1290. doi : 10.1111/j.1095-8649.2011.02979.x . PMID 21539541 . ↑ 「JFB著者向けガイドライン」 。魚類生物学ジャーナル。 ↑ イングヴァールのビルジェダル。ヤン・イデ・ポールセン。ジョン・ガルブレイス (2011)。 「 中部大西洋海嶺産の新種の平滑頭（オトセファラ：アレポセファリ科）の新種、 レプトデルマ・マクロフタルマム n.sp.」 （PDF） 。 ズータキサ 。 2876 : 49–56 . 土井 : 10.11646/zootaxa.2876.1.5 。 1 2 チャクラバーティ、プロサンタ（2010）。 「オーストラリア産の新しい盲目の洞窟魚、 Milyeringa brooksi , n. sp の説明を含む、Milyeringidae (Teleosti: Gobiiformes) の状態と系統発生」 (PDF) 。 ズータキサ 。 2557 : 19–28 . 土井 : 10.11646/zootaxa.2557.1.2 。 ↑ Chakrabarty, Prosanta; Warren, Melanie; Page, Lawrence; Baldwin, Carole (2013). "GenSeq: タイプおよび非タイプソースからの遺伝子配列の更新された命名法とランキング" . ZooKeys (346): 29– 41. doi : 10.3897/zookeys.346.5753 . PMC 3821064 . PMID 24223486 . 