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酵母ミトコンドリアコード(翻訳表3)は、サッカロミセス・セレビシエ、カンジダ・グラブラータ、ハンゼヌラ・サトゥルヌス、クルイベロミセス・サーモトレランスなどの酵母のミトコンドリアゲノムで使用される遺伝コードである。[1]
コード
AAs = FFLLSSSSYY**CCWWTTTTPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGGStarts = ---M---------------M---------------M---------------M------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
塩基:アデニン(A)、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T) またはウラシル(U)。
アミノ酸:アラニン(Ala、A)、アルギニン(Arg、R)、アスパラギン(Asn、N)、アスパラギン酸(Asp、D)、システイン(Cys、C)、グルタミン酸(Glu、E)、グルタミン(Gln、Q)、グリシン(Gly、G)、ヒスチジン(His、H)、イソロイシン(Ile、I)、ロイシン(Leu、L)、リジン(Lys、K)、メチオニン(Met、M)、フェニルアラニン(Phe、F)、プロリン(Pro、P)、セリン(Ser、S)、トレオニン(Thr、T)、トリプトファン(Trp、W)、チロシン(Tyr、Y)、バリン(Val、V)。
標準コードとの違い
- 残りのCGNコドンはサッカロミセス・セレビシエ[2]では稀であり、カンジダ・グラブラータでは存在しない。
- AUA コドンは、単一のミトコンドリアリボソームタンパク質をコードする遺伝子var1では一般的ですが、酵素をコードする遺伝子ではまれです。
- Hansenula saturnusにおける AUA (Met または Ile) および CUU (Thr ではなく Leu である可能性あり) のコーディング割り当ては不明です。
- Kluyveromyces thermotoleransにおける Thr の CUN へのコーディング割り当ては不明です。
参照
参考文献
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。 [3]
- ^ Clark-Walker, GD; Weiller, GF (1994). 「 Kluyveromyces thermotoleransの小型ミトコンドリア DNA の構造は、真菌の祖先遺伝子の順序を反映している可能性が高い」。Journal of Molecular Evolution . 38 (6): 593– 601. Bibcode :1994JMolE..38..593C. doi :10.1007/bf00175879. PMID 8083884. S2CID 10510397.
- ^ Susan G. Bonitz、Roberta Berlani、Gloria Coruzzi、May Li、Giuseppe Macino、Francisco G. Nobrega、Marina P. Nobrega、Arbara E. Thalenfeld、Alexander Tzagoloff (1980 年 6 月)。「酵母ミトコンドリアにおけるコドン認識規則」( PDF)。Proc . Natl. Acad. Sci. USA。77 ( 6): 3167– 3170。Bibcode : 1980PNAS ... 77.3167B。doi : 10.1073 / pnas.77.6.3167。PMC 349575。PMID 6997870。
{{cite journal}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク) - ^ Elzanowski A、Ostell J、Leipe D、Soussov V.「遺伝コード」。分類ブラウザ。国立生物工学情報センター(NCBI)、米国国立医学図書館。2015年4月30日閲覧。
