タンディ・ウォーノウ

タンディ・ウォーノウ
タンディ・ワーノウが2018年に分子生物学のためのインテリジェントシステム（ISMB）会議で講演
生まれる	タンディ・ジョー・ウォーノウ
母校	カリフォルニア大学バークレー校（学士、博士）
配偶者	ジョージ・チャッコ
子供たち	2
受賞歴	デビッド・アンド・ルシール・パッカード財団フェロー（1996） ラドクリフ高等研究所フェロー（2003） ジョン・サイモン・グッゲンハイム財団フェロー（2010） ACMフェロー（2015） ISCBフェロー（2017） AAASフェロー（2021）
科学者としてのキャリア
フィールド	コンピュータサイエンス 計算生物学 系統学 メタゲノミクス 多重配列アライメント[1]
機関	イリノイ大学アーバナ・シャンペーン 校 ペンシルバニア大学 テキサス大学
論文	系統樹を構築するための組み合わせアルゴリズム (1991)
博士課程の指導教員	ユージン・ローラー[2]
その他の学術アドバイザー	マイケル・ウォーターマン サイモン・タヴァレ[要出典]
博士課程の学生	ルアイ・ナクレ[3]
Webサイト	tandy.cs.illinois.edu

タンディ・ウォーノウはアメリカのコンピュータ科学者であり、イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校のグレインジャー工学特別教授である。^{[4] [5]}彼女は生物学と歴史言語学の両方における進化樹の再構築に関する研究と、多重配列アライメント法で知られている。^[6]

ウォーノウはカリフォルニア大学バークレー校で数学の学部と大学院の両方の研究を行い、1984年に学士号を取得し、 1991年にユージン・ローラーの指導の下で博士号^[2]を取得した。彼女の論文審査委員会の他のメンバーはリチャード・カープ、マヌエル・ブラム、ダン・ガスフィールド、デビッド・ゲイルであった^[2]。

1991年から1992年にかけて南カリフォルニア大学（ポスドク指導教官はマイケル・ウォーターマンとサイモン・タヴァレ）で、また1992年から1993年にかけてアルバカーキのサンディア国立研究所でポスドク研究を行った後、ペンシルベニア大学で教員となり、1999年にテキサス大学に移るまでその職に留まった。2014年、ウォーノウはイリノイ大学アーバナ・シャンペーン校（UIUC）の教員となり、同校のグレインジャー工学特別教授およびコンピュータサイエンス学部の副学部長を務めている。ウォーノウは、動物生物学、生物工学、電気・コンピュータ工学、昆虫学、数学、植物生物学、および統計学部に儀礼的任命を受けている。^{[5] [7]}

1995年、ペンシルバニア大学のウォーノウ、ドナルド・リンゲ、アン・テイラーによる完全系統樹計算に基づく研究により、インド・ヨーロッパ語族の初期の細分化の時期に関する包括的な理論が提示された。彼らの計算は、インド・ヒッタイト仮説を支持するものであり、それによれば、インド・ヨーロッパ語族の他の言語から最初に分かれた細分化はアナトリア語族であったとされている。彼らの結果はまた、アルメニア語とギリシア語がインド・ヨーロッパ語族のサブファミリーを形成するとするグレコ・アルメニア語仮説を支持するものである。彼らは、ゲルマン祖語はバルト・スラヴ語族と近縁であったが、ゲルマン部族の西方への移動により変化し、イタリック語族やケルト語族と接触したという仮説を立てることで、以前は問題があると考えられていたインド・ヨーロッパ語族の進化系統樹にゲルマン語族を当てはめた。^[8]この完全系統発生アプローチは後にワーノウとその同僚によって拡張され、言語間の検出されない借用を許容するようになり、言語の進化はツリーではなくネットワークでモデル化されるようになりました。^[9]

2009年、ワーノウとその同僚は、生物学的多重配列アラインメントと進化樹を共同推定するためのSATéソフトウェアをリリースした。^{[10]このソフトウェアは、以前の共同推定方法（BAli-Phy [11]}など）ほど確固とした数学的原理に基づいていないが、大幅に高速化されており、数千種の高精度な樹とアラインメントを迅速に構築できる。これに比べると、以前の方法はパフォーマンスが低かったため、一度に数十種しか比較できなかった。^{[12] [13]}

2014年以来の彼女の研究は、3つのトピックに焦点を当ててきました。それは、多重配列アライメントを超大規模データセットにスケーリングすること、複数の遺伝子を使用した種樹の推定（および不完全な系統分類による遺伝子樹の異質性への対処）、およびメタゲノミクスです。これらのトピックにおける彼女の主な貢献には、アライメントとツリーの共推定のためのPASTA法が含まれます。これはSATéを改良し、最大1,000,000の配列で非常に正確なアライメントを生成できます。^[14]彼女はまた、不完全な系統分類がある場合に種樹を構築するための統計的に一貫した方法である種樹の推定のためのASTRAL法を開発しました。^[15]

ワーノウは、2020年にグレインジャー工学特別教授、2014年に工学創設教授（ともにイリノイ大学）に任命され、2010年にはテキサス大学オースティン校のコンピュータサイエンスのデイビッド・ブルトン・ジュニア100周年記念教授に任命された。 ^[5] ワーノウは、2011年にジョン・サイモン・グッゲンハイム財団フェローシップ、2003年にラドクリフ研究所フェローシップ、1996年にデイビッド・アンド・ルシール・パッカード財団フェローシップ、1994年にNSF若手研究者賞を受賞した。^{[5] 2015年には、「大規模分子系統学と歴史言語学のための数学理論、アルゴリズム、ソフトウェアへの貢献」により}、計算機協会（ACM）のフェロー に任命された。^[16] 2017年、彼女は国際計算生物学会（ISCB）のフェローに選出されました。^{[17]彼女は2021年度の}アメリカ科学振興協会 フェローに指名されました。^[18]

ウォーノウの母親は著名なアーキビストのジョーン・ウォーノウ・ブリューエット、父親はバンドリーダーのマーク・ウォーノウの息子で作曲家レイモンド・スコットの甥であるモートン・ウォーノウである。^[19]双子の妹はカリフォルニア大学のバイオインフォマティクス研究者で名誉教授のキメン・ショーランダーである。彼女はイリノイ大学グレンジャー工学部コンピュータサイエンス研究准教授のジョージ・チャッコと結婚している。^[20]ウォーノウにはクリスティンとメナカという2人の子供がいる。^[19]

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