キメン・ショーランダー

キメン・ショーランダー（旧姓ワルノウ）は、カリフォルニア大学バークレー校バイオエンジニアリング学部の名誉教授です。タンパク質配列解析に関する研究でよく知られています。

ショーランダーは、カリフォルニア大学サンタクルーズ校のコンピュータサイエンス学部で学部と大学院の両方の研究を行い、1993年に学士号を取得し、1997年にはデイビッド・ハウスラーの指導の下で博士号を取得した。^[1]彼女は、1997年から1999年まで分子応用グループ（マイケル・レビットが共同設立した会社）の主任科学者であり、その後1999年から2001年までセレラ・ゲノミクスのタンパク質情報科学の主任科学者であり、そこでは（ J・クレイグ・ベンターとジーン・マイヤーズとともに）ヒトゲノムの組み立てと注釈付けを行ったチームのメンバーであった。^[2] 彼女は、2001年にカリフォルニア大学バークレー校の生物工学部の助教授として教鞭を執った。彼女は2006年に終身在職権を取得し、2012年に教授に昇進した。^[1]

ショーランダーは2003年にNSFキャリア賞^[1]と科学者・技術者のための大統領若手キャリア賞を受賞した。 ^[3]

Sjölander 氏は、機能部位予測とオーソログ識別のための機械学習法、タンパク質構造予測、機能サブファミリーとオーソログ分類、リモートホモロジー検出、多重配列アラインメント、系統樹推定のための隠れマルコフモデル (HMM) 法など、タンパク質配列分析のための系統ゲノム学的手法の研究で最もよく知られています。彼女のアルゴリズムは、Celera Genomicsでのヒトゲノムの機能注釈、PhyloFacts バイオインフォマティクス データベースとポータルで使用され、 ModBaseデータベースにも貢献しました。

ショーランダー氏の双子の妹タンディ・ワーノウ氏はイリノイ大学アーバナ・シャンペーン校のコンピューターサイエンスの教授である。

• Venter, J Craig ; et al. (2001)、「ヒトゲノムの配列」、Science、291 (5507): 1304–1351、Bibcode :2001Sci...291.1304V、doi : 10.1126/science.1058040、PMID  11181995。

• Krogh, Anders ; Brown, Michael; Mian, Saira; Sjölander, Kimmen; Haussler, David (1994)、「計算生物学における隠れマルコフモデル: タンパク質モデリングへの応用」、Journal of Molecular Biology、235 (5): 1501–1531、doi :10.1006/jmbi.1994.1104、PMID  8107089。

• Sjolander, Kimmen; Karplus, Kevin ; Brown, Michael; Hughey, Richard; Krogh, Anders ; Mian, Saira; Haussler, David (1996)、「ディリクレ混合: 弱いが有意なタンパク質配列相同性の検出を改善するための方法」、Bioinformatics、12 (4): 327–345、doi : 10.1093/bioinformatics/12.4.327、PMID  8902360。