人間の体内に存在するタンパク質
RP11 について 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4UG0、4V6X、4XXB、5AJ0、4V5Z、4UJD、4D67、4D5Y、4UJE、4UJC、%%s4UJE、4XXB、4UJD、4D67、4V5Z、4V6X、5AJ0、4UJC、4D5Y、4UG0
識別子 エイリアス RPL11 、DBA7、GIG34、L11、リボソームタンパク質L11、uL5 外部ID オミム ：604175; MGI : 1914275; ホモロジーン : 37376; ジーンカード ：RPL11; OMA :RPL11 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体4（マウス） [2] バンド 4|4 D3 始める 135,755,576 bp [2] 終わり 135,780,739 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 神経節隆起 単球 心室帯 顆粒球 左卵巣 ヒップの皮膚 右卵巣 右肺 胃の本体 リンパ節
トップの表現 卵黄嚢 胚 胚 リップ 胎児の尾 性器結節 心室帯 海馬歯状回顆粒細胞 桑実胚 胚盤胞
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
rRNA結合 タンパク質結合 RNA結合 リボソームの構造構成要素 5S rRNA結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 ユビキチンリガーゼ阻害活性 細胞成分
細胞質 リボソーム 膜 細胞内解剖構造 核小体 細胞質大リボソームサブユニット 細胞外エクソソーム 核 細胞外マトリックス 核質 細胞質 タンパク質含有複合体 ポリソームリボソーム 生物学的プロセス
タンパク質標的 ウイルス転写 SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化 リボソーム大サブユニットの生合成 翻訳開始 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解 rRNA処理 タンパク質生合成 リボソーム大サブユニットアセンブリ 遺伝子発現の正の調節 タンパク質結合の正の調節 タンパク質の安定化 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性の負の制御 ユビキチン依存性タンパク質分解過程の負の制御 タンパク質のネディレーションの負の制御 p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の調節 プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解過程の負の制御 核へのタンパク質の局在 p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の正の制御 p53クラスメディエーターによる内因性アポトーシスシグナル伝達経路の正の調節 細胞質翻訳 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) RefSeq (タンパク質) NP_000966 NP_001186731 NP_000966.2
場所 (UCSC) 1 章: 23.69 – 23.7 Mb 4 章: 135.76 – 135.78 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
60Sリボソームタンパク質L11 は、ヒトでは RPL11 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 リボソームは 、 タンパク質合成を 触媒する 細胞小器官 で、小さな 40S サブユニットと大きな 60S サブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、4種類の RNA と約 80 種類の構造的に異なるタンパク質で構成されています。この遺伝子は、 60S サブユニットの構成要素である リボソームタンパク質をコードしています。このタンパク質は、リボソームタンパク質の L5P ファミリーに属しています。 細胞質 にあります。このタンパク質は、おそらく 5S rRNA と関連しています。 異なる アイソフォームをコードする 選択的スプライス バリアントが存在する可能性がありますが、完全には特徴付けられていません。リボソームタンパク質をコードする遺伝子では一般的ですが、 この遺伝子には、ゲノム全体に分散した複数の処理された 擬似遺伝子があります。 [ 引用が必要 ]
インタラクション RPL11 は以下と相互作用する ことが示されています :
参考文献
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さらに読む
Wool IG、Chan YL、Glück A (1996)。「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」。Biochem . Cell Biol . 73 (11–12): 933–947. doi :10.1139/o95-101. PMID 8722009。 Mishin VP、Filipenko ML、Muravlev AI、Karpova GG、Mertvetsov NP (1995)。「[ヒトリボソームタンパク質L11のmRNAに相補的なDNAのクローニングと一次構造の決定]」。 Bioorg. Khim . 21 (2): 158–60。PMID 7748210 。 Kato S, Sekine S, Oh SW, Kim NS, Umezawa Y, Abe N, Yokoyama-Kobayashi M, Aoki T (1995). 「ヒト完全長cDNAバンクの構築」. Gene . 150 (2): 243–250. doi :10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID 7821789. Koldamova RP、Lefterov IM、DiSabella MT、Almonte C、Watkins SC、Lazo JS (1999)。「ヒトブレオマイシン加水分解酵素はリボソームタンパク質に結合する」。 生化学 。38 ( 22 ): 7111–7117。doi :10.1021/bi990135l。PMID 10353821 。 Andersen JS、Lyon CE、Fox AH、Leung AK、Lam YW、Steen H、Mann M、Lamond AI (2002)。「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」。Curr . Biol . 12 ( 1 ) : 1–11。Bibcode :2002CBio...12....1A。doi : 10.1016/S0960-9822(01) 00650-9。PMID 11790298。S2CID 14132033 。 ボロニナ EN、コロコルツォワ TD、ネチャエワ EA、フィリペンコ ML (2003)。 「[ヒトリボソームタンパク質L11遺伝子の構造と機能の解析]」。 モル。バイオル。 （モスク） 。 37 (3): 425-35。 PMID 12815950。 Lohrum MA、Ludwig RL、Kubbutat MH、 Hanlon M、Vousden KH (2004)。「リボソームタンパク質L11によるHDM2活性の調節」。Cancer Cell。3 ( 6 ): 577–587。doi : 10.1016/S1535-6108(03)00134- X。PMID 12842086 。 Odintsova TI、Müller EC、Ivanov AV、Egorov TA、Bienert R、Vladimirov SN、Kostka S、Otto A、Wittmann-Liebold B、Karpova GG (2004)。「質量分析法とエドマン配列決定法によるヒト大細胞質リボソームサブユニットタンパク質の翻訳後修飾の特性評価と分析」。J . Protein Chem . 22 (3): 249–258. doi :10.1023/A:1025068419698. PMID 12962325. S2CID 10710245. Zhang Y、Wolf GW、Bhat K、Jin A、Allio T、Burkhart WA、Xiong Y (2003)。「リボソームタンパク質 L11 は腫瘍タンパク質 MDM2 を負に制御し、p53 依存性リボソームストレスチェックポイント経路を媒介する」。Mol . Cell. Biol . 23 (23): 8902–8912. doi :10.1128/MCB.23.23.8902-8912.2003. PMC 262682. PMID 14612427 。 Bhat KP、Itahana K、Jin A、Zhang Y (2004)。「成長阻害誘導性p53活性化の媒介におけるリボソームタンパク質L11の重要な役割」。EMBO J. 23 ( 12): 2402–2412. doi :10.1038/sj.emboj.7600247. PMC 423289. PMID 15152193 。 Bernardi R、Scaglioni PP、Bergmann S、Horn HF、Vousden KH、Pandolfi PP (2004)。「PML は Mdm2 を核小体に隔離することで p53 の安定性を制御する」 Nat. Cell Biol . 6 (7): 665–672. doi :10.1038/ncb1147. PMID 15195100. S2CID 26281860. Dai MS、Lu H (2004)。「リボソームタンパク質L5によるMDM2媒介p53ユビキチン化および分解の阻害」。J . Biol. Chem . 279 (43): 44475–44482. doi : 10.1074/jbc.M403722200 . PMID 15308643。 ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、 ゾグビ HY 、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005）。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–1178. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Dai MS、Shi D、Jin Y、Sun XX、Zhang Y、Grossman SR、Lu H (2006)。「リボソームタンパク質L11によるMDM2-p53経路の調節には、ユビキチン化後のメカニズムが関与している」。J . Biol. Chem . 281 (34): 24304–24313. doi : 10.1074/jbc.M602596200 . PMC 1783840. PMID 16803902 。 Lindström MS、Jin A、Deisenroth C、White Wolf G、Zhang Y (2007)。「MDM2 ジンクフィンガードメインの癌関連変異はリボソームタンパク質の相互作用を阻害し、MDM2 誘導性 p53 分解を弱める」。Mol . Cell. Biol . 27 (3): 1056–1068. doi :10.1128/MCB.01307-06. PMC 1800693. PMID 17116689 。
外部リンク GeneReviews/NCBI/NIH/UW のダイアモンド・ブラックファン貧血に関するエントリ
