ミール338

ミール338
ミール338
	miR-338マイクロRNA前駆体の保存された二次構造
識別子
シンボル	ミール338
代替記号	ミル338
Rfam	RF00686
miRBase	MI0000814
miRBase ファミリー	ＭＩＰＦ０００００９７
NCBI遺伝子	442906
HGNC	31775
オミム	614059
参照シーケンス	NR_029897
その他のデータ
RNAタイプ	マイクロRNA
ドメイン	哺乳類
行く	0035195
それで	0001244
軌跡	第17章 25.3節
PDB構造	PDBe

miR-338は、ヒトを含む哺乳類に見られる脳特異的なマイクロRNA前駆体のファミリーです。^[1]約22 ヌクレオチドの成熟miRNA配列は、酵素ダイサーによって前駆体ヘアピンから切り出されます。^[2]この配列はその後、RNA干渉を引き起こすRISCと結合します。^[3]

miR-338は、アポトーシス関連チロシンキナーゼ（AATK ）遺伝子内のイントロン領域に位置している。AATK発現に下流の負の影響を及ぼす遺伝子をダウンレギュレーションする可能性があると予測されている。^[4]

関数

miR-338は脳特異的なmiRNAであり、シトクロムc酸化酵素IV（COX4）の発現を制御します。 ^[1]^{[5]成熟したmiR-338 miRNA配列は、COX4}mRNAの3'非翻訳領域の短いセクションと相補的です。このmRNA配列はステムループ構造の上に存在し、miRNA処理にアクセスできることを示しています。^[5]

アプリケーション

miR-338は神経芽腫で調節不全を起こしており、バイオマーカーや将来の治療薬として利用される可能性があります。^{[6] miR-338は}肝細胞癌とも関連付けられており、組織サンプル中のmiR-338発現の測定を含む大規模な診断検査が提案されています。^{[7]さらに、miR-338は、発現プロファイルを組み合わせることで}胃癌患者の生存確率を予測できる7つのマイクロRNAの1つです。^[8]

参考文献

^ ab Aschrafi A, Schwechter AD, Mameza MG, Natera-Naranjo O, Gioio AE, Kaplan BB (2008 年 11 月). 「MicroRNA-338 は交感神経ニューロンの軸索における局所シトクロム c オキシダーゼ IV mRNA レベルと酸化的リン酸化を制御する」The Journal of Neuroscience . 28 (47): 12581–90. doi :10.1523/JNEUROSCI.3338-08.2008. PMC 3496265. PMID 19020050 .
^ Ambros V (2001年12月). 「マイクロRNA：大きな可能性を秘めた小さな調節因子」. Cell . 107 (7): 823–6. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . PMID 11779458. S2CID 14574186.
^ Gregory RI、Chendrimada TP、Cooch N、Shiekhattar R (2005 年 11 月)。「ヒト RISC はマイクロ RNA の生合成と転写後遺伝子サイレンシングを結び付ける」。Cell . 123 (4): 631–40. doi : 10.1016/j.cell.2005.10.022 . PMID 16271387. S2CID 16973870。
^ Barik S (2008 年9月). 「イントロンマイクロRNAは、その宿主遺伝子に対して機能的に拮抗する遺伝子をサイレンシングする」。核酸研究。36 ( 16 ): 5232–41。doi :10.1093/nar/gkn513。PMC 2532712。PMID 18684991。
^ ab Kaplan BB、Gioio AE、Hillefors M、Aschrafi A (2009)。「軸索タンパク質合成とミトコンドリア局所機能の調節」。軸索の細胞生物学。細胞分化における結果と問題。第 48 巻。pp. 225–42。doi : 10.1007/ 400_2009_1。ISBN 978-3-642-03018-5. PMC 2786086 . PMID 19343315.
^ ラグーザ M、マジョラナ A、バネッリ B、バルバガッロ D、スタテッロ L、カシャーノ I、グリエルミーノ MR、ドゥーロ LR、スカリア M、マグロ G、ディピエトロ C、ロマーニ M、ピュレッロ M (2010 年 10 月)。「ヒトの位置的および機能的神経芽腫の候補である MIR152、MIR200B、および MIR338 は、神経芽細胞の分化とアポトーシスに関与しています。」分子医学ジャーナル。88 (10): 1041–53。土井：10.1007/s00109-010-0643-0。PMID 20574809。S2CID 22215883 。
^ Huang XH、Wang Q、Chen JS、Fu XH、Chen XL、Chen LZ、Li W、Bi J、Zhang LJ、Fu Q、Zeng WT、Cao LQ、Tan HX、Su Q (2009 年 8 月)。「肝細胞癌におけるマイクロ RNA 発現のビーズベースマイクロアレイ解析: miR-338 がダウンレギュレーションされる」。肝臓学研究。39 ( 8): 786–94。doi : 10.1111/ j.1872-034X.2009.00502.x。PMID 19473441。S2CID 11863697 。
^ Li X、Zhang Y、Zhang Y、Ding J、Wu K、Fan D (2010 年 5 月)。「7 つのマイクロ RNA シグネチャによる胃がんの生存予測」。Gut . 59 ( 5): 579–85. doi :10.1136/gut.2008.175497. PMID 19951901. S2CID 25196666.

さらに読む

He QY、Peng GP、Liu WX、Luo BY (2010 年 11 月)。「[microRNA-338 とその潜在的標的タンパク質 eiF4E3 の相互作用]」。浙江大学学報。易学班 = 浙江大学医学誌。39 (6): 583–8。doi :10.3785/ j.issn.1008-9292.2010.06.006。PMID 21166051 。（中国語）
Saba R、Goodman CD、Huzarewich RL、Robertson C、Booth SA (2008)。Akbarian S (編)。「プリオン誘発性神経変性の miRNA シグネチャ」。PLOS ONE。3 ( 11 ) : e3652。Bibcode : 2008PLoSO...3.3652S。doi : 10.1371 / journal.pone.0003652。PMC 2575400。PMID 18987751。

外部リンク

Rfamの microRNA mir-338 のページ

[Asc08-1] Aschrafi A, Schwechter AD, Mameza MG, Natera-Naranjo O, Gioio AE, Kaplan BB (2008 年 11 月). 「MicroRNA-338 は交感神経ニューロンの軸索における局所シトクロム c オキシダーゼ IV mRNA レベルと酸化的リン酸化を制御する」The Journal of Neuroscience . 28 (47): 12581–90. doi :10.1523/JNEUROSCI.3338-08.2008. PMC 3496265. PMID 19020050 .

[2] Ambros V (2001年12月). 「マイクロRNA：大きな可能性を秘めた小さな調節因子」. Cell . 107 (7): 823–6. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . PMID 11779458. S2CID 14574186.

[3] ^ Gregory RI、Chendrimada TP、Cooch N、Shiekhattar R (2005 年 11 月)。「ヒト RISC はマイクロ RNA の生合成と転写後遺伝子サイレンシングを結び付ける」。Cell . 123 (4): 631–40. doi : 10.1016/j.cell.2005.10.022 . PMID 16271387. S2CID 16973870。

[4] ^ Barik S (2008 年9月). 「イントロンマイクロRNAは、その宿主遺伝子に対して機能的に拮抗する遺伝子をサイレンシングする」。核酸研究。36 ( 16 ): 5232–41。doi :10.1093/nar/gkn513。PMC 2532712。PMID 18684991。

[Kap09-5] Kaplan BB、Gioio AE、Hillefors M、Aschrafi A (2009)。「軸索タンパク質合成とミトコンドリア局所機能の調節」。軸索の細胞生物学。細胞分化における結果と問題。第 48 巻。pp. 225–42。doi : 10.1007/ 400_2009_1。ISBN 978-3-642-03018-5. PMC 2786086 . PMID 19343315.

[6] ラグーザ M、マジョラナ A、バネッリ B、バルバガッロ D、スタテッロ L、カシャーノ I、グリエルミーノ MR、ドゥーロ LR、スカリア M、マグロ G、ディピエトロ C、ロマーニ M、ピュレッロ M (2010 年 10 月)。「ヒトの位置的および機能的神経芽腫の候補である MIR152、MIR200B、および MIR338 は、神経芽細胞の分化とアポトーシスに関与しています。」分子医学ジャーナル。88 (10): 1041–53。土井：10.1007/s00109-010-0643-0。PMID 20574809。S2CID 22215883 。

[7] Huang XH、Wang Q、Chen JS、Fu XH、Chen XL、Chen LZ、Li W、Bi J、Zhang LJ、Fu Q、Zeng WT、Cao LQ、Tan HX、Su Q (2009 年 8 月)。「肝細胞癌におけるマイクロ RNA 発現のビーズベースマイクロアレイ解析: miR-338 がダウンレギュレーションされる」。肝臓学研究。39 ( 8): 786–94。doi : 10.1111/ j.1872-034X.2009.00502.x。PMID 19473441。S2CID 11863697 。

[8] Li X、Zhang Y、Zhang Y、Ding J、Wu K、Fan D (2010 年 5 月)。「7 つのマイクロ RNA シグネチャによる胃がんの生存予測」。Gut . 59 ( 5): 579–85. doi :10.1136/gut.2008.175497. PMID 19951901. S2CID 25196666.