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| 塩性細菌科 | |
|---|---|
科学的分類 
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| ドメイン： | 古細菌 |
| 王国： | ユーリアキオータ |
| クラス： | ハロバクテリア |
| 注文： | ハロバクテリア |
| 家族： | 塩性細菌科 ギボンズ 1974 |
| 属 | |
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テキストを参照 | |
| 同義語 | |
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好塩性細菌科（Halobacteriaceae ）は、好塩性細菌目（Halobacteriales）の科で、古細菌ドメインに属します。[1]好塩性細菌科は、他の2つのメタン生成科であるMethanosarcinaceae科とMethanocalculaceae科とともに、好塩性古細菌の大部分を占めています。[2]この科は、極端な環境ニッチでも生き残ることができる多様な属で構成されています。[3]最も一般的には、好塩性細菌科は高塩湖で見つかり、重金属で汚染された場所でも耐えることができます。[4]これらには、好中球、好酸性細菌（例：Halarchaeum acidiphilum）、好アルカリ性細菌（例：Natronobacterium）が含まれ、耐冷性種も発見されています（例：Hrr. lacusprofundi）。[3]一部のメンバーは嫌気性だけでなく好気性でも生息することが知られており、さまざまな形態をしています。[3]多様な形態には、 Halobacterium属の桿菌、Halococcus属の球菌、Haloferax属の平らな円盤状またはカップ状、 Haloarcula属の平らな三角形からHaloquadratum属およびNatronorubrum属の正方形までの形状が含まれます。[5] [6] Halobacteriaceae科のほとんどの種は、高い耐塩性と赤ピンク色の色素を持つ種（バクテリオルベリンカロテノイドによる[5]）で最もよく知られていますが、色素を持たない種や中程度の塩分条件を必要とする種も存在します。[3] [7] Halobacteriaceae科のいくつかの種は、高塩分環境でのリン循環に寄与するリン可溶化活性を示すことが示されています。[8] 16S rRNA分析やDNA-DNAハイブリダイゼーションなどの技術は、好塩性古細菌の培養の難しさもあって、塩性細菌科の分類に大きく貢献してきました。[7] [3] [2]
概要
好塩細菌科は、塩分が飽和またはほぼ飽和した水の中に生息する。好塩菌とも呼ばれるが、この名称は、やや低濃度の塩水に生息する他の生物にも用いられる。塩分、水分、有機物が大量に存在するほとんどの環境でよく見られる。大きなブルームはバクテリオロドプシンという色素によって赤みがかっている。この色素は光を吸収するのに使用され、そのエネルギーがATP生成に使われる。また、好塩細菌には第2の色素であるハロロドプシンがあり、これが光子に反応して塩化物イオンを送り込み、電圧勾配を作り出して光からのエネルギー生成を助ける。このプロセスは、電子伝達を伴う他の形態の光合成とは無関係であり、好塩細菌は二酸化炭素から炭素を固定することができない。
好気性細菌であるにもかかわらず、光エネルギーを利用してエネルギーを生成する別の方法を持っているため、塩分の多い環境でも生存できます。好気性細菌の膜の一部は紫がかった色をしており、網膜色素を含んでいます。これにより、細胞膜全体にプロトン勾配を作り出し、それを利用して自らが使用する ATPを生成することができます。
塩分の多い環境で生きるために、ある種の適応性を持っています。たとえば、細胞機構は表面に荷電アミノ酸を持つことにより高塩分濃度に適応しており、細胞はこれらの成分の周囲に水分子を保持できます。浸透圧とこれらのアミノ酸は、細胞内の塩分量を制御します。しかし、これらの適応性のため、細胞が湿気のある塩分の少ない環境に置かれると、浸透圧によってすぐに破裂する可能性があります。
系統発生
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[9]と国立生物工学情報センター（NCBI） [1]に基づいています。
注1: 側系統の Halobacteriaceae
注2: 未分類の Halobacteriaceae
- 「アクチノアーケウム」タンら 2023
- 「ハロアルカロフィリウム」Lizama et al. 2000a
- 「ハロラリウス」サンら。 2023年
参照
参考文献
- ^ ab Sayers; et al. 「Halobacteriaceae」。国立生物工学情報センター（NCBI）分類データベース。 2023年8月15日閲覧。
- ^ ab Oren, Aharon (2014年9月). 「好塩性古細菌の分類：現状と今後の課題」.極限環境細菌. 18 (5): 825–834. doi :10.1007/s00792-014-0654-9. PMID 25102811. S2CID 5395569.
- ^ abcde Oren, Aharon (2012年2月1日). 「Halobacteriaceae科の分類学：原核生物系統学の概念を変えるパラダイム」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . PMID 22155757.
- ^ Naik, Sanika; Furtado, Irene (2017).海洋汚染と微生物修復シンガポール: Springer Nature. pp. 143–152. ISBN 978-981-10-1044-6。
- ^ ab Oren, Aharon; Arahal, David; Ventosa, Antonio (2009). 「Halobacteriaceae科の属の修正された記述」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 59 (3): 637–642. doi : 10.1099/ijs.0.008904-0 . PMID 19244452.
- ^ Tully, Benjamin; Emerson, Joanne; Andrade, Karen; Brocks, Jochen; Allen, Eric; Banfield, Jillian; Heidelberg, Karla (2014 年 9 月 16 日)。「オーストラリアのティレル湖に生息する Haloquadratum walsbyi の De novo 配列から、多様なゲノムランドスケープが明らかになる」。Archaea . 2015 : 875784. doi : 10.1155/2015/875784 . PMC 4330952 . PMID 25709557。
- ^ アブ ・ヴェントーサ、A.;マルケス、M.サンチェス・ポロ、C.幅、R. (2012)。好塩性微生物の生物学の理解の進歩([最新版]. ed.)。ドルドレヒト: スプリンガー、ドルドレヒト。土井：10.1007/978-94-007-5539-0_3。ISBN 978-94-007-5538-3。
- ^ Yadav, Ajar Nath; Sharma, Divya; Gulati, Sneha; Singh, Surender; Dey, Rinku; Pal, Kamal Krishna; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil Kumar (2015 年 7 月 28 日)。「リンサイクルに関与するリン可溶化特性を持つ Haloarchaea」。Scientific Reports。5 ( 1 ): 12293。Bibcode : 2015NatSR ...512293Y。doi : 10.1038 /srep12293。PMC 4516986。PMID 26216440。
- ^ JP Euzéby. 「Halobacteriaceae」。命名法で定められた原核生物名のリスト（LPSN） 。 2023年8月15日閲覧。
- ^ 「The LTP」 。 2023年11月20日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年11月20日閲覧。
- ^ 「LTP_08_2023 リリースノート」(PDF) 。 2023年11月20日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
さらに読む
科学雑誌
- Wright, A-DG (2006). 「16S rRNA 遺伝子配列から推定した Halobacteriales 目内の系統関係」. Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 56 (Pt 6): 1223–1227. doi : 10.1099/ijs.0.63776-0 . PMID 16738095.
- 国際原核生物分類委員会の司法委員会 (2005)。「Acholeplasmatales、Halanaerobiales、Halobacteriales、Methanobacteriales、Methanococcales、Methanomicrobiales、Planctomycetales、Prochlorales、Sulfolobales、Thermococcales、Thermoproteales、および Verrucomicrobiales の命名上の型は、それぞれ Acholeplasma、Halanaerobias、Halobacterium、Methanobacterium、Methanococcus、Methanomicrobium、Planctomyces、Prochloron、Sulfolobus、Thermococcus、Thermoproteus、および Verrucomicrobium 属である。意見 79」。Int . J. Syst. Evol. Microbiol . 55 (Pt 1): 517–518。土井: 10.1099/ijs.0.63548-0。PMID 15653928。
- Euzeby JP、Tindall BJ (2001)。「命名法上の分類: 細菌学規約 (1990 年改訂版) の規則 15 および 21a に従って必要な修正、およびクラスとサブクラスの適切な命名法上の分類の指定。意見の要請」。Int . J. Syst. Evol. Microbiol . 51 (Pt 2): 725–727. doi : 10.1099/00207713-51-2-725 . PMID 11321122。
- Oren A、Ventosa A (2000)。「国際細菌分類学委員会 塩性細菌科の分類に関する小委員会。会議議事録、1999 年 8 月 16 日、オーストラリア、シドニー」。Int . J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–1407. doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089。
科学書
- Grant WD、Larsen H (1989)。「グループ III。高度好塩性古細菌。Halobacteriales 目新族目。」JT Staley、MP Bryant、N Pfennig、JG Holt (編)。Bergey 's Manual of Systematic Bacteriology、第 3 巻(第 1 版)。ボルチモア: The Williams & Wilkins Co.、p. 169。
- ギボンズ、NE (1974)。「ファミリー V. Halobacteriaceae fam. nov.」。RE Buchanan および NE Gibbons (編) 。Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (第 8 版)。ボルチモア: The Williams & Wilkins Co.
- Blum P編 (2008)。『古細菌：原核生物生物学の新しいモデル』Caister Academic Press。ISBN 978-1-904455-27-1[1]。
外部リンク
- 塩性細菌科の分類群の正しい名前