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| ハロクアドラタム | |
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| 属: | ハロクアドラタム バーンズら2007
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| タイプ種 | |
| ハロクアドラタム・ウォルスビイ バーンズら 2007
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| 種 | |
ハロクアドラタム（一般略称： Hqr.）は、ハロフェラ科に属する古細菌の属である。 [1]このグループで最初に特定された種であるハロクアドラタム・ウォルスビーは、その細胞が四角い平らな箱のような形をしている点で珍しい。 [2]
この好塩性 古細菌は、1980年にエジプトのシナイ半島にあるガヴィッシュサブカ[3]の高塩分湖（サブカ）でAEウォルズビーによって発見されましたが、2004年まで培養されていませんでした。[4]
細胞には通常、ポリヒドロキシアルカン酸（PHA）顆粒と、水環境で浮力を提供し、集光を最大限にするために細胞を配置するのに役立つ、屈折性のガス充填 液胞が多数含まれています。[5]細胞は他の細胞と結合して、最大40マイクロメートル幅の脆弱なシートを形成することがあります。
H. walsbyi は高塩分水域のどこにでも生息します。[6]海水が蒸発すると、炭酸カルシウムと硫酸カルシウムが高濃度に沈殿し、高塩分で塩化ナトリウムを多く含む塩水になります。さらに蒸発すると塩化ナトリウムまたは岩塩が沈殿し、にがりと呼ばれる濃縮塩化マグネシウム塩水になります。岩塩形成の最終段階では、塩化マグネシウムの濃縮により塩水が不毛になる前に、H. walsbyi が繁殖し、塩水のバイオマスの 80% を占めることがあります。
説明と意義
H. walsbyiは1980年にAE Walsbyによってエジプトのシナイ半島の沿岸塩水プールであるガビッシュサブカで初めて発見され、 2007年にBurnsらによって正式に記載されました。[4]この生物は、非常に薄い（約0.15μm）四角い構造で有名でした。2004年まで研究室で培養されていませんでした。
ゲノム構造
H. walsbyiのゲノムマッピングが完了し、この生物の系譜と分類、そして生態系で果たす役割についての理解が深まりました。[7]スペインとオーストラリアの分離株（HBSQ001株とC23 T株）のゲノム比較では、非常に類似しており遺伝子の順序（シンテニー）が保持されていることから、急速に世界的に拡散したことを強く示唆しています。[8]
細胞構造と代謝
H.walsbyi は独特な細胞形状をしており、その最もよく知られた特徴は、極めて薄い四角形であることです。細胞には、ガス液胞と呼ばれる細胞内屈折体が多数存在しています。ガス液胞は浮力をもたらすガスで満たされており、水柱内で上方の位置を維持します。個々の四角形細胞は他の細胞と結合して大きなシートを形成し、その大きさは 40 μm にもなります。これらのシートは非常に壊れやすく、細胞間の接続は簡単に壊れます。
その代謝様式は完全には分かっていませんが、完全な遺伝情報が研究者に必要な洞察を与えるでしょう。
エコロジー
H. walsbyi はエジプトの塩水プールで最初に発見され、採取されましたが、世界中の高塩分水域で見つかっています。これらのプールの水が蒸発すると高濃度の塩分が残り、最適な成長環境が整います。Bolhuis らによると、「この意味で、マグネシウム塩 (苦汁) のさらなる濃縮は塩水の不毛化につながるため、この生物は知られている中で最も好塩性が高い生物です」とのことです。生態系におけるその正確な役割は不明ですが、その独特な形態のため、この生物についてさらに学ぶことで、古細菌の進化と形態的適応に関する情報が得られることは間違いありません。
参照
参考文献
- ^ Haloquadratum に関する NCBIウェブページを参照してください。データは「NCBI 分類リソース」から抽出されました。国立生物工学情報センター。2007年 3 月 19 日閲覧。
- ^ Stoeckenius W (1981年10月1日). 「ウォルズビーの正方形細菌：直交原核生物の微細構造」. J. Bacteriol . 148 (1): 352–60. doi : 10.1128/JB.148.1.352-360.1981. PMC 216199. PMID 7287626.
- ^ Walsby, AE (1980). 「四角い細菌」. Nature . 283 (5742): 69–71. Bibcode :1980Natur.283...69W. doi :10.1038/283069a0. S2CID 4341717.
- ^ ab Burns, DG; Janssen, PH; Itoh, T.; Kamekura, M.; Li, Z.; Jensen, G.; Rodriguez-Valera, F.; Bolhuis, H.; Dyall-Smith, ML (2007). 「オーストラリアとスペインの塩田結晶化装置から分離された、ウォルズビーの四角いハロアーキア、Haloquadratum walsbyi gen. nov., sp. nov.」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 57 (2): 387–392. doi : 10.1099/ijs.0.64690-0 . PMID 17267984.
- ^ オーレン A、プリエル N、シャピロ O、シボニ N (2006)。 「塩田晶析池における正方形のガス空胞古細菌の自然群集における浮力の研究」。生理食塩水システム。2 : 4.土井: 10.1186/1746-1448-2-4。PMC 1459177。PMID 16613609。
- ^ Bolhuis H, Martín-Cuadrado AB, Rosselli R, Pašić L, Rodriguez-Valera F (2017年7月). 「Haloquadratum walsbyiのトランスクリプトーム解析：虚栄心は表面だけ」BMC Genomics . 18 (1) 510. doi : 10.1186/s12864-017-3892-2 . PMC 5496347. PMID 28673248 .
- ^ J. Craig Venter Instituteの情報、2014-02-23 archive.todayにアーカイブ
- ^ Dyall-Smith, ML; Pfeiffer, F.; Klee, K.; Palm, P.; Gross, K.; Schuster, SC; Rampp, M.; Oesterhelt, D. (2011). Lopez-Garcia, Purification (ed.). 「Haloquadratum walsbyi : 地球規模の池における限られた多様性」. PLOS ONE . 6 (6): e20968. Bibcode :2011PLoSO...620968D. doi : 10.1371/journal.pone.0020968 . PMC 3119063 . PMID 21701686.
さらに読む
- Burns DG、Camakaris HM、Janssen PH、Dyall-Smith ML (2004)。「Walsby's square haloarchaeon の培養」。FEMS Microbiol. Lett . 238 (2): 469–73. doi :10.1016/j.femsle.2004.08.016. PMID 15358434。
- Oren A、Ventosa A (2000)。「国際細菌分類学委員会 塩性細菌科の分類に関する小委員会。会議議事録、1999 年 8 月 16 日、オーストラリア、シドニー」。Int . J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–7. doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089。
- ギボンズ、NE (1974)。「ファミリー V. ハロバクテリア科新族」。RE ブキャナン、NE ギボンズ (編)。バーギーの決定的細菌学マニュアル(第 8 版)。ボルチモア: ウィリアムズ & ウィルキンス社ISBN 0-683-01117-0。
外部リンク
- ゲノム配列