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| ハロフェラックス | |
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| Haloferax mediterraneiのSEM画像。 | |
科学的分類 
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| ドメイン： | 古細菌 |
| 王国： | ユーリアキオータ |
| クラス： | ハロバクテリア |
| 注文： | ハロフェラ目 |
| 家族： | ハロフェラ科 |
| 属: | Haloferax Torreblanca et al. 1986年[1] |
| タイプ種 | |
| ハロフェラックス・ボルカニ (Mulakhanbhai & Larsen 1975) Torreblanca et al. 1986年
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| 種 | |
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テキストを参照 | |
ハロフェラックス（一般略称： Hfx. ）は、ハロフェラ目（Haloferacaceae）に属する塩性細菌の属である。 [2]
遺伝子交換
H. mediterraneiの細胞と関連種であるH. volcaniiの細胞は、細胞融合を伴う 2 つの細胞間の遺伝子交換の過程を経て、ヘテロ二倍体細胞 (1 つの細胞に 2 つの異なる染色体を含む) が生じることがあります。[3]この遺伝子交換は通常、同じ種の 2 つの細胞間で発生しますが、 H. mediterraneiとH. volcani の細胞 間でも低頻度で発生することがあります。これら 2 つの種は、平均して 86.6% のヌクレオチド配列同一性を持っています。[3] この交換過程において、両方の親細胞の完全な遺伝子レパートリーを含む二倍体細胞が形成され、遺伝子組み換えが促進されます。その後、細胞は分離し、組み換え細胞が生じます。
分類
2022年現在、 Haloferax属には13種が有効に掲載されている。[1]
- 提案された種
いくつかの種と新しい二名法が提案されていますが、有効に公表されていません。
- 「Haloferax antrum」Enache et al. 2006、[4]「Haloferax opilio」Enache et al. 2006、「Haloferax rutilus」Enache et al. 2006 、および「Haloferax viridis」Enache et al. 2006はルーマニアの塩湖から分離され、2006年に初めて新種として提案されました。[5]それらに沿って提案されたH. prahovenseのみがそれ以来有効に公開されています。
- 「Haloferax berberensis」Kharroub et al. 2005eはアルジェリアで分離され、2005年に新種として提案されました。[6]
- Haloferax litoreum、Haloferax marinisediminisおよびHaloferax marinum は2021 年に初めて出版されましたが、2022 年の時点では受け入れられていません。[7]
- Haloferax marisrubriとHaloferax profundiは2020年に初めて出版されましたが、2022年現在では受け入れられていません。[8]
- Haloferax massilisiensisまたはHaloferax massilienseは、2016年に初めて発表され、2018年にヒト関連の好塩性古細菌として再発表されました。2022年現在、この種は受け入れられていません。[9]
系統発生
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[1]と国立生物工学情報センター（NCBI） [2]に基づいています。
参照
参考文献
- ^ abc JP Euzéby. 「Haloferax」。命名法で定められた原核生物名のリスト（LPSN） 。 2023年10月10日閲覧。
- ^ ab Sayers; et al. 「Haloferax」。国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース。 2023年10月10日閲覧。
- ^ ab Naor A、Lapierre P、Mevarech M、Papke RT、Gophna U (2012 年 8 月)。「好塩性古細菌における低い種障壁と組み換え雑種の形成」。Curr . Biol . 22 (15): 1444–8. doi : 10.1016/j.cub.2012.05.056 . PMID 22748314。
- ^ EBA - 欧州ヌクレオチドアーカイブ、 2022年7月14日閲覧
- ^ NCBI Taxonomy browser (Haloferax antrum) 、2022-07-14取得
- ^ NCBI 分類ブラウザ (Haloferax berberensis) 、 2022 年 7 月 14 日取得
- ^ "LPSN - 命名法に定められた原核生物の名前のリスト". Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen 。2022-07-14に取得。
- ^ "LPSN - 命名法に定められた原核生物の名前のリスト". Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen 。2022-07-14に取得。
- ^ "LPSN - 命名法に定められた原核生物の名前のリスト". Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen 。2022-07-14に取得。
- ^ 「The LTP」 。 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年5月10日閲覧。
- ^ 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) 。 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
さらに読む
- Oren A、Ventosa A (2000)。「国際細菌分類学委員会 塩性細菌科の分類に関する小委員会。会議議事録、1999 年 8 月 16 日、オーストラリア、シドニー」。Int . J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–1407. doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089。
- Torreblanca M, Rodriquez-Valera F, Juez G, Ventosa A, Kamekura M, Kates M (1986). 「数値分類と極性脂質組成に基づく非アルカリ好塩性細菌の分類、および新属Haloarculaと新属Haloferaxの説明」. Syst. Appl. Microbiol . 8 (1–2): 89–99. doi :10.1016/s0723-2020(86)80155-2.
- ギボンズ、NE (1974)。「ファミリー V. ハロバクテリア科新族」。RE ブキャナン、NE ギボンズ (編)。バーギーの決定的細菌学マニュアル(第 8 版)。ボルチモア: ウィリアムズ & ウィルキンス社ISBN 0-683-01117-0。
外部リンク
- BacDive の Haloferax - 細菌多様性メタデータ
- NCBI タクソノミー ブラウザ