| ハロコッカス | |
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| 属: | ハロコッカス シュープ 1935 [1]
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| ハロコッカス・リトラリス (ポールセン 1879)シュープ 1935
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| 種 | |
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ハロコッカス(一般略称: Hcc.)は、ハロコッカス科の属です。
エコロジー
ハロコッカスは高度好塩性古細菌の属で、最適な成長には高い塩分濃度、時には 32% の NaCl を必要とする。好塩菌は主に塩分濃度の高い内陸水域に生息し、その色素 (ロドプシンタンパク質と呼ばれるタンパク質由来) が堆積物を鮮やかな色に染める。ロドプシンタンパク質やその他のタンパク質は、ハロコッカスを環境の極端な塩分濃度から保護する役割を果たす。このような高塩分条件下でも機能できるため、ハロコッカスや類似の好塩性生物は食品業界やスキンケア製品にも使用されている。
ハロコッカスは塩分濃度の高い環境、主に内陸の塩水域に生息していますが、一部は塩分濃度の高い土壌や食品に生息していることもあります。一部の種の色素タンパク質は、特に生育期の終わりに、死海やグレートソルトレイクの一部の地域で見られる赤みがかった色合いを引き起こします。栽培中、この生物は塩分濃度の高い条件下で最もよく成長しました。[2]
ゲノム構造
複数のハロコッカス種のゲノムが配列決定されている。[3]ある種[どの種か? ]の16s rDNAは、系統樹上の位置を示している。この生物は長寿である可能性があるため、ハロコッカスは宇宙で発見された生命との分類学上の類似点を探るのに適した候補となる可能性がある。
細胞構造と代謝
ハロコッカス属の菌類は、生息環境の塩分濃度と浸透圧バランスを維持し、細胞質の脱水を防ぐ塩素ポンプのおかげで、塩分濃度の高い生息地でも生存することができます。
細胞は球菌で、長さは 0.6~1.5 マイクロメートル、硫酸化多糖類の壁を持ちます。細胞は器官栄養性で、アミノ酸、有機酸、炭水化物をエネルギー源とします。場合によっては、光合成も行えます。
系統発生
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト(LPSN)[1]と国立生物工学情報センター(NCBI) [2]に基づいています。
参照
参考文献
- ^ ab JP Euzéby. 「Halococcus」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2021年11月17日閲覧。
- ^ ab Sayers; et al. 「Halococcus」。国立生物工学情報センター(NCBI)分類データベース。 2022年6月5日閲覧。
- ^ 「完全なゲノム:Halococcus」。
- ^ 「The LTP」 。 2024年12月10日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。2024年12月10日閲覧。
- ^ 「LTP_10_2024 リリースノート」(PDF) 。 2024年12月10日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース09-RS220」。ゲノム分類データベース。 2024年5月10日閲覧。
- ^ "ar53_r220.sp_label".ゲノム分類データベース. 2024年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2024年5月10日閲覧。
さらに読む
科学雑誌
- Oren A, Ventosa A (2000). 「国際細菌分類学委員会 塩性細菌科の分類に関する小委員会。会議議事録、1999 年 8 月 16 日、オーストラリア、シドニー」。Int . J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405– 1407. doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089。
- スクープ、G (1935)。 「Halococcus litoralis、ein obligat halophiler Farbstofflbildner」。Deutsche Tierärztliche Wochenschrift。43 : 817–820 .
科学書
- ギボンズ、NE (1974)。「ファミリー V. ハロバクテリア科新族」。RE ブキャナン、NE ギボンズ (編)。バーギーの決定的細菌学マニュアル(第 8 版)。ボルチモア: ウィリアムズ & ウィルキンス社ISBN 0-683-01117-0。
