ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
HLTF 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2MZN、4HRE、4HRH、4S0N、4XZF、4XZG、5BNH、5K5F
識別子 エイリアス HLTF 、HIP116、HIP116A、HLTF1、RNF80、SMARCA3、SNF2L3、ZBU1、ヘリカーゼ様転写因子、ヘリカーゼ様転写因子 外部ID OMIM : 603257; MGI : 1196437; HomoloGene : 30136; GeneCards : HLTF; OMA :HLTF - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体3（マウス） [2] バンド 3 A2|3 6.15 cM 始める 20,111,975 bp [2] 終わり 20,172,654 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 睾丸 ポンス 視床の外側核群 緻密部 脈絡叢上皮 網状部 視床下核 上前庭核 外淡蒼球 小脳虫部
トップの表現 球形嚢 耳板 耳小胞 ハベヌラ 房室弁 膀胱移行上皮 腸間膜リンパ節 網膜色素上皮 血 原始的な線
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 ヌクレオチド結合 ヘリカーゼ活性 亜鉛イオン結合 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 金属イオン結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 リン酸無水物中の酸無水物に作用する加水分解酵素活性 ATPase活性 タンパク質結合 触媒活性 核酸結合 加水分解酵素活性 ATP結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 トランスフェラーゼ活性 RNA結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 細胞成分 生物学的プロセス
転写の調節、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写 転写、DNAテンプレート 代謝 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 タンパク質のユビキチン化 クロマチン組織 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_003071 NM_139048 NM_001318934 NM_001318935
NM_009210 NM_144959 NM_001355097
RefSeq (タンパク質) NP_001305863 NP_001305864 NP_003062 NP_620636
場所 (UCSC) 3 章: 149.03 – 149.09 Mb 3 章: 20.11 – 20.17 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ヘリカーゼ様転写因子 は、ヒトではHLTF 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6]
関数 この遺伝子は、 SWI/SNF ファミリーのメンバーをコードします 。このファミリーのメンバーは ヘリカーゼ と ATPase活性を持ち、遺伝子の周囲の クロマチン 構造を変更することで特定の遺伝子の転写を制御すると考えられています 。コードされているタンパク質には、 RING フィンガー DNA 結合モチーフが含まれています。この遺伝子には、同じタンパク質をコードする 2 つの転写バリアントが見つかっています。ただし、代替の翻訳開始部位を使用すると、全長タンパク質と比較して N 末端が切断されたアイソフォームが生成されます。 [6]
HLTFは二本鎖DNAトランスロカーゼであり、 SHPRH （SNF2ヒストンリンカーPHD RINGヘリカーゼ）に加えて サッカロミセス・セレビシエRAD5の2つのヒトホモログのうちの1つであり、Rad5と同様に フォーク 退行を行うことができます 。 [7]
インタラクション HLTFはUBE2N [8] 、 RAD18 [8] 、 UBE2V2 [8] と 相互作用する ことが示されている（STRINGの機能的および物理的関連ネットワークも参照： 「名前で検索」 オプションで興味のある 「タンパク質名」 にHLTFと入力し 、 「GO! 」をクリックし、 「生物」を選択して、 「続行 ->」 をクリックする ）。
参考文献
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さらに読む
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