ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
RAD18 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2MRE、2MRF、2Y43、2YBF
識別子 エイリアス RAD18 、RNF73、E3 ユビキチンタンパク質リガーゼ、RAD18 E3 ユビキチンタンパク質リガーゼ 外部ID オミム ：605256; MGI : 1890476; ホモロジーン : 48572; ジーンカード ：RAD18; OMA :RAD18 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体6（マウス） [2] バンド 6|6 E3 始める 112,596,811 bp [2] 終わり 112,673,647 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 睾丸 アキレス腱 心室帯 生殖腺 神経節隆起 小腸粘膜 子宮内膜間質細胞 結腸上皮 ランゲルハンス島 骨髄細胞
トップの表現 胎児の尾 受精卵 精母細胞 性器結節 精子細胞 二次卵母細胞 一次卵母細胞 胚葉上層 腰椎神経節 内腎髄質
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
金属イオン結合 ポリユビキチン修飾依存性タンパク質結合 Y型DNA結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 損傷したDNA結合 DNA結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 一本鎖DNAヘリカーゼ活性 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 トランスフェラーゼ活性 タンパク質含有複合体結合 一本鎖DNA結合 細胞成分
細胞質 二本鎖切断部位 微小管形成中心 核 レプリケーションフォーク 中心体 Rad6-Rad18複合体 核封入体 細胞骨格 核質 核体 生物学的プロセス
タンパク質モノユビキチン化 紫外線への反応 細胞死の負の調節 染色体分離の正の調節 DNA損傷刺激に対する細胞反応 複製後の修復 タンパク質の自己ユビキチン化 DNA修復 タンパク質のユビキチン化 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001167730 NM_021385 NM_001381931 NM_001381932 NM_001381933
RefSeq (タンパク質) NP_001161202 NP_067360 NP_001368860 NP_001368861 NP_001368862
場所 (UCSC) 3 章: 8.78 – 8.96 Mb 6 章: 112.6 – 112.67 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
E3ユビキチンタンパク質リガーゼRAD18は、ヒトでは RAD18 遺伝子 によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6] [7] ヒト大腸癌細胞株HCT116のノックアウトも作成されている。 [8]
関数 この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 S. cerevisiae DNA損傷修復タンパク質Rad18と非常に類似している。酵母Rad18は、損傷したDNAの複製後修復に必要なユビキチン結合酵素であるRad6との相互作用を介して機能する。酵母のRad18と同様に、このタンパク質は保存された リングフィンガーモチーフ を介して酵母Rad6タンパク質のヒトホモログと相互作用することができる。このモチーフの変異は、紫外線で損傷したDNAの複製に欠陥が生じ、複数の変異原に対する過敏症を引き起こす。 [7]
インタラクション RAD18はHLTF [9] 、 UBE2B [5] [6] 、 UBE2A [ 5 ]と 相互作用する ことが示されている 。 [6]
参考文献
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さらに読む
Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング: 真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Mulder LC、 Chakrabarti LA、Muesing MA (2002 年 7 月)。「HIV-1 インテグラーゼと DNA 修復 タンパク質 hRad18 の相互作用」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 30): 27489–93。doi : 10.1074/jbc.M203061200。PMID 12016221 。 Nikiforov AA、Sasina LK、Svetlova MP、Solovjeva LV、Oei SL、Bradbury EM、Tomilin NV (2004)。「哺乳類細胞におけるヌクレアーゼ FEN1 の早期固定化と停止した DNA 複製フォークでの hRAD18 タンパク質の蓄積」。Doklady 生化学 および 生物物理学 。389 : 122–5。doi : 10.1023 /A:1023696425171。PMID 12856420。S2CID 2646911。 Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004 年 8 月)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。101 (33): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073 / pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935 。 Watanabe K, Tateishi S, Kawasuji M, Tsurimoto T, Inoue H, Yamaizumi M (2004 年 10 月)。「Rad18 は物理的相互作用と PCNA モノユビキチン化を介してポレタを複製停止部位に誘導する」。The EMBO Journal。23 ( 19 ): 3886–96。doi :10.1038/ sj.emboj.7600383。PMC 522788。PMID 15359278 。 Nikiforov A、Svetlova M、Solovjeva L、Sasina L、Siino J、Nazarov I、Bradbury M、Tomilin N (2004 年 10 月)。「哺乳類細胞における停止した複製フォークでの Rad18 タンパク質の DNA 損傷誘導蓄積には、上流のタンパク質リン酸化が関与している」。 生化学 および生物物理学的研究通信 。323 (3): 831–7。doi : 10.1016/j.bbrc.2004.08.165。PMID 15381075 。 宮瀬 聡、立石 聡、渡辺 健、富田 健、鈴木 健、井上 秀、山泉 正 (2005 年 1 月)。「Rad6 依存性モノユビキチン化およびポリユビキチン化による Rad18 の異なる制御」。The Journal of Biological Chemistry . 280 (1): 515–24. doi : 10.1074/jbc.M409219200 . PMID 15509568。 Masuyama S, Tateishi S, Yomogida K, Nishimune Y, Suzuki K, Sakuraba Y, Inoue H, Ogawa M, Yamaizumi M (2005 年 8 月)。「正常および遺伝毒性条件下での哺乳類 Rad18 の調節発現と核内局在の動的変化」。Genes to Cells。10 ( 8 ) : 753–62。doi : 10.1111/j.1365-2443.2005.00874.x。PMID 16098139。S2CID 41733250 。 Nousiainen M、Silljé HH、Sauer G、Nigg EA、Körner R (2006 年 4 月)。「ヒト有糸分裂紡錘体のリン酸化プロテオーム解析」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。103 (14): 5391–6。Bibcode : 2006PNAS..103.5391N。doi : 10.1073 / pnas.0507066103。PMC 1459365。PMID 16565220 。 Bi X、Barkley LR、Slater DM、Tateishi S、Yamaizumi M、Ohmori H、Vaziri C (2006 年 5 月)。「Rad18 は DNA ポリメラーゼ カッパを制御し、S 期チェックポイントによる停止からの回復に必要である」。 分子 細胞 生物 学 。26 (9): 3527–40。doi : 10.1128 /MCB.26.9.3527-3540.2006。PMC 1447421。PMID 16611994 。 Lloyd AG、Tateishi S、 Bieniasz PD 、 Muesing MA、Yamaizumi M、Mulder LC (2006 年 5 月) 。 「DNA 修復 タンパク質 Rad18 のウイルス 感染に対する影響」。PLOS Pathogens。2 ( 5): e40。doi : 10.1371 /journal.ppat.0020040。PMC 1463017。PMID 16710452 。 Yuasa MS、Masutani C、Hirano A、Cohn MA、Yamaizumi M、Nakatani Y、Hanaoka F (2006 年 7 月)。「Rad18、Rad6、Rev1 を含むヒト DNA ポリメラーゼ η 複合体、プロテオーム解析、および複製フォーク停止中の細胞のクロマチン結合画分への複合体の標的化」。Genes to Cells。11 ( 7 ) : 731–44。doi : 10.1111/j.1365-2443.2006.00974.x。PMID 16824193。S2CID 32695133 。 Beausoleil SA、Villén J、Gerber SA、Rush J、 Gygi SP (2006 年 10 月)。「高スループットタンパク質リン酸化分析および部位局在化のための確率ベースのアプローチ」。Nature Biotechnology。24 ( 10 ): 1285–92。doi :10.1038/ nbt1240。PMID 16964243。S2CID 14294292 。 Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 ( 3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
