シュプリ

シュプリ
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2M85、4QN1
識別子
エイリアス	SHPRH、bA545I5.2、SNF2 ヒストンリンカー PHD RING ヘリカーゼ、RAD5
外部ID	オミム：608048; MGI : 1917581;ホモロジーン: 6489;ジーンカード：SHPRH; OMA :SHPRH - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体6（ヒト）
終わり	145,964,423 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体10（マウス）
終わり	11,093,339 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	アキレス腱; ; 睾丸; ; 膵臓上皮細胞; ; 腓骨神経; ; 網膜色素上皮; ; 胚上皮; ; 生殖腺; ; 脛骨; ; 太ももの皮; ; 骨髄細胞;
	トップの表現
	二次卵母細胞; ; 小脳葉; ; 小脳虫部; ; 一次卵母細胞; ; 受精卵; ; 性器結節; ; 脊髄の腰椎部分; ; 神経節隆起; ; 三叉神経節; ; 心室帯;
	参照表現データの詳細
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; ヌクレオチド結合; タンパク質結合; 加水分解酵素活性; ATP結合; ヘリカーゼ活性; 金属イオン結合; ユビキチンタンパク質転移酵素活性; ユビキチンタンパク質リガーゼ結合; トランスフェラーゼ活性; ユビキチンタンパク質リガーゼ活性;
細胞成分	ヌクレオソーム; 核; 核質;
生物学的プロセス	ヌクレオソームアセンブリ; タンパク質ポリユビキチン化; DNA修復; DNA損傷刺激に対する細胞反応; タンパク質のユビキチン化;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	257218
	268281
	ENSG00000146414
	ENSMUSG00000090112
	Q149N8
	Q7TPQ3
	NM_001042683 ; NM_173082 ; NM_001370327 ; NM_001370328
	NM_001077707 ; NM_001284354 ; NM_172937
	NP_001036148 ; NP_775105 ; NP_001357256 ; NP_001357257
	NP_001071175 ; NP_001271283 ; NP_766525
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

E3ユビキチンタンパク質リガーゼSHPRHは、ヒトではSHPRH遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]

関数

SHPRHは、いくつかのDNA修復タンパク質、転写因子、ヘリカーゼの特徴的なモチーフを含む、普遍的に発現するタンパク質です。[OMIM提供] ^[6] SHPRHは、ヌクレオソーム刺激ATPaseであり、ヌクレオソームE3ユビキチンリガーゼです。^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000146414 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000090112 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Sood R、Makalowska I、Galdzicki M、Hu P、Eddings E、Robbins CM、Moses T、Namkoong J、Chen S、Trent JM (2003 年 8 月)。「6q24 領域から SNF2/ヘリカーゼおよび PHD フィンガードメインを持つ保存された推定タンパク質をコードする新規遺伝子 SHPRH のクローニングと特性評価」。Genomics . 82 ( 2): 153–61. doi :10.1016/S0888-7543(03)00121-6. PMID 12837266。
^ ab 「Entrez Gene: SHPRH SNF2 ヒストンリンカー PHD RING ヘリカーゼ」。
^ Brühl, J; Trautwein, J; Schäfer, A; Linne, U; Bouazoune, K (2019年8月21日). 「DNA修復タンパク質SHPRHはヌクレオソーム刺激ATPaseであり、ヌクレオソームE3ユビキチンリガーゼである」.エピジェネティクス＆クロマチン. 12 (1): 52. doi : 10.1186/s13072-019-0294-5 . PMC 6702750. PMID 31434570 .

さらに読む

Motegi A、Sood R、 Moinova H 、 Markowitz SD、Liu PP、Myung K (2006 年 12 月)。「ヒト SHPRH は増殖細胞核抗原のポリユビキチン化を介してゲノム不安定性を抑制する」。The Journal of Cell Biology。175 ( 5): 703–8。doi :10.1083/jcb.200606145。PMC 2064669。PMID 17130289 。
Unk I、Hajdú I、Fátyol K、Szakál B、Blastyák A、Bermudez V、Hurwitz J、Prakash L、Prakash S、Haracska L (2006 年 11 月)。「ヒト SHPRH は、増殖細胞核抗原の Mms2-Ubc13 依存性ポリユビキチン化のためのユビキチンリガーゼである」。米国科学アカデミー紀要。103 ( 48): 18107–12。Bibcode :2006PNAS..10318107U。doi : 10.1073 / pnas.0608595103。PMC 1838714。PMID 17108083。
Jin J、Smith FD、Stark C、Wells CD、Fawcett JP、Kulkarni S、Metalnikov P、O'Donnell P、Taylor P、Taylor L、Zougman A、Woodgett JR、Langeberg LK、Scott JD、Pawson T (2004 年 8 月)。「細胞骨格調節と細胞組織化に関与する生体内 14-3-3 結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベースの分析」 ( PDF ) 。Current Biology。14 ( 16 ): 1436–50。doi : 10.1016 /j.cub.2004.07.051。PMID 15324660。S2CID 2371325。
Adams MD、Kerlavage AR、Fleischmann RD、Fuldner RA、Bult CJ、Lee NH、Kirkness EF、Weinstock KG、Gocayne JD、White O (1995 年 9 月)。「8,300 万ヌクレオチドの cDNA 配列に基づくヒト遺伝子の多様性と発現パターンの初期評価」( PDF )。Nature。377 ( 6547 Suppl): 3–174。PMID 7566098 。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000146414 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000090112 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid12837266-5] Sood R、Makalowska I、Galdzicki M、Hu P、Eddings E、Robbins CM、Moses T、Namkoong J、Chen S、Trent JM (2003 年 8 月)。「6q24 領域から SNF2/ヘリカーゼおよび PHD フィンガードメインを持つ保存された推定タンパク質をコードする新規遺伝子 SHPRH のクローニングと特性評価」。Genomics . 82 ( 2): 153–61. doi :10.1016/S0888-7543(03)00121-6. PMID 12837266。

[entrez-6] 「Entrez Gene: SHPRH SNF2 ヒストンリンカー PHD RING ヘリカーゼ」。

[7] Brühl, J; Trautwein, J; Schäfer, A; Linne, U; Bouazoune, K (2019年8月21日). 「DNA修復タンパク質SHPRHはヌクレオソーム刺激ATPaseであり、ヌクレオソームE3ユビキチンリガーゼである」.エピジェネティクス＆クロマチン. 12 (1): 52. doi : 10.1186/s13072-019-0294-5 . PMC 6702750. PMID 31434570 .