HDAC4 利用可能な構造 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2H8N、2O94、2VQJ、2VQM、2VQO、2VQQ、2VQV、2VQW、3UXG、3UZD、3V31、4CBT、4CBY、5A2S
識別子 エイリアス HDAC4 、AHO3、BDMR、HA6116、HD4、HDAC-4、HDAC-A、HDACA、ヒストン脱アセチル化酵素4、NEDCHID 外部ID オミム :605314; MGI : 3036234; ホモロジーン : 55946; ジーンカード :HDAC4; OMA :HDAC4 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体1(マウス) [2] バンド 1|1 D 始める 91,856,501 bp [2] 終わり 92,123,421 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 腓骨神経 臀筋 腓腹筋 前脛骨筋 太ももの筋肉 S状結腸の筋層 内皮細胞 三角筋 上腕二頭筋の骨格筋組織 血
トップの表現 耳小胞 顆粒球 原腸胚 吻側回遊流 海馬歯状回顆粒細胞 太ももの筋肉 リップ 心室中隔 筋肉組織 骨格筋組織
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
NAD依存性ヒストン脱アセチル化酵素活性(H3-K14特異的)
配列特異的DNA結合
DNA結合
転写コリプレッサー活性
ヒストン脱アセチル化酵素活性
亜鉛イオン結合
転写因子結合
ヒストン脱アセチル化酵素結合
カリウムイオン結合
クロマチン結合
金属イオン結合
タンパク質結合
タンパク質キナーゼ結合
加水分解酵素活性
タンパク質脱アセチル化酵素活性
同一のタンパク質結合
プロモーター特異的クロマチン結合
RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
SUMOトランスフェラーゼ活性
細胞成分
細胞質
ヒストン脱アセチル化酵素複合体
神経筋接合部
転写抑制複合体
筋節
Z ディスクドカック
バンド
アクトミオシン
核
細胞質
核質
タンパク質含有複合体
生物学的プロセス
活性酸素種の生合成過程の正の調節
ヒストンH3の脱アセチル化
骨格系の発達
クロマチンリモデリング
ペプチジルリジン脱アセチル化
カルシウムイオンシグナル伝達による心筋収縮の調節
解糖系の負の調節
インターロイキン-1に対する反応
転写の調節、DNAテンプレート
遺伝子発現の調節、エピジェネティック
腫瘍壊死因子に対する細胞反応
DNA結合転写因子活性の正の調節
RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
タンパク質SUMO化の正の制御
DNA結合転写因子活性の負の制御
骨芽細胞分化の抑制
転写、DNAテンプレート
神経系の発達
横紋筋細胞の分化の調節
転写の正の制御、DNAテンプレート
平滑筋細胞の移動の正の調節
B細胞の活性化
ヒストンH4の脱アセチル化
機械的刺激に対する細胞反応
ニューロンのアポトーシス過程の正の調節
ストレスに対する心筋肥大
細胞集団増殖の正の調節
筋管分化の負の調節
筋肉の適応の調節に関与する脱神経に対する反応
骨格筋線維の発達の調節
骨芽細胞の発達
B細胞の分化
副甲状腺ホルモン刺激に対する細胞反応
炎症反応
ラメリポディウム形成の正の調節
タンパク質結合の調節
転写の負の調節、DNAテンプレート
ヒストンの脱アセチル化
RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
細胞集団増殖の負の調節
平滑筋細胞の増殖の正の調節
クロマチン組織
RNAポリメラーゼIIによるプリmiRNA転写の負の制御
タンパク質の脱アセチル化
タンパク質SUMO化
雄の交尾行動の積極的な規制
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_006037 NM_001378414 NM_001378415 NM_001378416 NM_001378417
RefSeq (タンパク質) NP_006028 NP_001365343 NP_001365344 NP_001365345 NP_001365346
場所 (UCSC) 2 章: 239.05 – 239.4 Mb 1 章: 91.86 – 92.12 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ヒストン脱アセチル化酵素4は HDAC4 としても知られ 、 ヒトでは HDAC4 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6]
関数
ヒストンは 転写調節 、 細胞周期の 進行、発達の過程 で重要な役割を果たしている。ヒストン の アセチル化 /脱アセチル化は 染色体構造を変化させ、転写因子のDNAへのアクセスに影響を与える。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 ヒストン脱アセチル化酵素 /acuc/aphaファミリーのクラスIIに属する。ヒストン脱アセチル化酵素活性を有し、プロモーターに連結されると転写を抑制する。このタンパク質はDNAに直接結合せず、 転写因子 MEF2C および MEF2D を介して結合する。RbAp48およびHDAC3と多タンパク質複合体で相互作用すると思われる。 [7] さらに、HDAC4はTGFbeta1誘導性筋線維芽細胞分化に必要である。 [8]
臨床的意義
研究では、HDAC4が骨と筋肉の発達を制御することが示されています。 ハーバード大学の 研究者は、HDAC4が健康な視力を促進するとも結論付けています。タンパク質のレベルが低下すると、マウスの 網膜の桿体 光受容体 と双極細胞 が死滅しました。 [9] [10]
インタラクション
HDAC4 は以下と相互作用する ことが示されています :
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000068024 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026313 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ ab Grozinger CM、Hassig CA 、 Schreiber SL (1999年4月)。「3つのタンパク質が酵母Hda1pに関連するヒトヒストン脱アセチル化酵素のクラスを定義する」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。96 ( 9): 4868–73。Bibcode :1999PNAS...96.4868G。doi : 10.1073 / pnas.96.9.4868。PMC 21783。PMID 10220385 。
^ Fischle W, Emiliani S, Hendzel MJ, Nagase T, Nomura N, Voelter W, Verdin E (1999年4月). 「Saccharomyces cerevisiae HDA1pに関連するヒトヒストン脱アセチル化酵素の新しいファミリー」. The Journal of Biological Chemistry . 274 (17): 11713– 20. doi : 10.1074/jbc.274.17.11713 . PMID 10206986.
^ 「Entrez Gene: HDAC4 ヒストン脱アセチル化酵素 4」。
^ Glenisson W、Castronovo V、 Waltregny D (2007 年 10 月)。「ヒストン脱アセチル化酵素 4 は TGFbeta1 誘導性筋線維芽細胞分化に必要である」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research。1773 ( 10): 1572– 82。doi : 10.1016/ j.bbamcr.2007.05.016。PMID 17610967 。
^ タンパク質と視力 、 サイエンティフィック・アメリカン 、 300、3 (2009年3月)、p.23
^ Chen B, Cepko CL (2009年1月). 「HDAC4は正常網膜と疾患網膜における神経細胞の生存を制御する」. Science . 323 (5911): 256–9 . doi :10.1126/science.1166226. PMC 3339762. PMID 19131628 .
^ ab Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (2002年6月). 「クラスIIヒストン脱アセチル化酵素はBCL6転写抑制因子によって直接リクルートされる」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (24): 22045– 52. doi : 10.1074/jbc.M201736200 . PMID 11929873.
^ ファリオーリ=ベッキオーリ S、タノーリ M、ミケーリ L、マンクーゾ M、レオナルディ L、サラン A、チョッティ MT、フェレッティ E、グリノ A、パッツァリア S、ティローネ F (2007 年 7 月)。 「抗増殖性および分化促進性遺伝子 PC3 による髄芽腫の腫瘍形成の阻害」。 FASEBジャーナル 。 21 (9): 2215–25 . 土井 : 10.1096/fj.06-7548com 。 PMID 17371797。S2CID 4974360 。
^ Micheli L、D'Andrea G、Leonardi L、Tirone F (2017 年 7 月)。「HDAC1、HDAC4、および HDAC9 は PC3/Tis21/Btg2 に結合し、細胞周期の進行とサイクリン D1 の発現の阻害に必要である」 ( PDF ) 。Journal of Cellular Physiology。232 ( 7): 1696– 1707。doi :10.1002/jcp.25467。PMID 27333946。S2CID 4070837。
^ Zhang CL、McKinsey TA、Olson EN(2002年10月)。「クラスIIヒストン脱アセチル化酵素とヘテロクロマチンタンパク質1の関連:筋肉分化の制御におけるヒストンメチル化の潜在的役割」。 分子細胞生物学。22 ( 20 ) : 7302-12。doi : 10.1128 / mcb.22.20.7302-7312.2002。PMC 139799。PMID 12242305 。
^ 綿本和也、戸渡正人、小澤裕也、宮田裕也、岡本正史、安部亜生、直江哲也、斉藤英史 (2003年12月)。 「MEL細胞分化中のHDAC5とGATA-1の相互作用の変化」。 がん遺伝子 。 22 (57): 9176–84 . 土井 : 10.1038/sj.onc.1206902 。 PMID 14668799。
^ abc Fischle W, Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W, Verdin E (2002年1月). 「クラスII HDACに関連する酵素活性は、HDAC3とSMRT/N-CoRを含む多タンパク質複合体に依存する」. Molecular Cell . 9 (1): 45– 57. doi :10.1016/s1097-2765(01)00429-4. hdl : 11858/00-001M-0000-002C-9FF9-9 . PMID 11804585.
^ abc Grozinger CM、Schreiber SL (2000 年 7 月)。「ヒストン脱アセチル化酵素 4 および 5 の調節と 14-3-3 依存性細胞局在による転写活性」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。97 ( 14): 7835–40。Bibcode :2000PNAS... 97.7835G。doi : 10.1073 / pnas.140199597。PMC 16631。PMID 10869435 。
^ Fischle W, Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W, Verdin E (2001 年 9 月). 「ヒト HDAC7 ヒストン脱アセチル化酵素活性は生体内で HDAC3 と関連している」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (38): 35826– 35. doi : 10.1074/jbc.M104935200 . PMID 11466315.
^ ab Zhou X, Richon VM, Wang AH, Yang XJ, Rifkind RA, Marks PA (2000 年 12 月). 「ヒストン脱アセチル化酵素 4 は細胞外シグナル制御キナーゼ 1 および 2 と関連し、その細胞内局在は発癌性 Ras によって制御される」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (26): 14329– 33. Bibcode :2000PNAS...9714329Z. doi : 10.1073/pnas.250494697 . PMC 18918 . PMID 11114188.
^ Wang AH、Bertos NR、Vezmar M、Pelletier N、Crosato M、Heng HH、Th'ng J、Han J、Yang XJ (1999 年 11 月)。「酵母 HDA1 に関連するヒトヒストン脱アセチル化酵素 HDAC4 は転写コリプレッサーである」。 分子 細胞 生物 学 。19 ( 11): 7816– 27。doi :10.1128/mcb.19.11.7816。PMC 84849。PMID 10523670 。
^ Wang AH、Yang XJ (2001 年 9 月)。「ヒストン脱アセチル化酵素 4 は核 へ の 固有の輸入および輸出シグナルを有する」。 分子細胞生物学 。21 (17): 5992– 6005。doi :10.1128/ mcb.21.17.5992-6005.2001。PMC 87317。PMID 11486037 。
^ Miska EA、Karlsson C、Langley E、Nielsen SJ、Pines J、Kouzarides T (1999 年 9 月)。「HDAC4 脱アセチル化酵素は MEF2 転写因子と関連し、それを抑制する」。The EMBO Journal。18 ( 18 ) : 5099– 107。doi :10.1093 / emboj/18.18.5099。PMC 1171580。PMID 10487761 。
^ Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (2000 年 5 月). 「mHDA1/HDAC5 ヒストン脱アセチル化酵素は MEF2A 転写活性と相互作用し、これを抑制する」 (PDF) . The Journal of Biological Chemistry . 275 (20): 15594– 9. doi : 10.1074/jbc.M908437199 . PMID 10748098. S2CID 39220205.
^ ab Huang EY、Zhang J、Miska EA、Guenther MG、Kouzarides T 、Lazar MA (2000 年 1 月)。「核受容体コリプレッサーは Sin3 非依存性抑制経路でクラス II ヒストン脱アセチル化酵素と連携する」。 遺伝子 と 発達 。14 ( 1): 45– 54。doi :10.1101/gad.14.1.45。PMC 316335。PMID 10640275 。
^ Franco PJ、Li G、 Wei LN(2003年8月)。「核内受容体ジンクフィンガーDNA結合ドメインとヒストン脱アセチル化酵素との相互作用」。分子細胞内分泌学。206 ( 1-2 ) : 1-12。doi : 10.1016 / s0303-7207 ( 03)00254-5。PMID 12943985。S2CID 19487189 。
^ Franco PJ、Farooqui M、 Seto E、Wei LN(2001年8月)。「オーファン核受容体TR2はクラスIおよびクラスIIヒストン脱アセチル化酵素と直接相互作用する」。 分子 内分泌 学 。15 ( 8): 1318–28。doi : 10.1210/mend.15.8.0682。PMID 11463856 。
^ Miska EA、Langley E、Wolf D、Karlsson C、Pines J、Kouzarides T (2001 年 8 月)。「HDAC4 の異なる局在が筋肉の分化を調整する」。 核酸研究。29 ( 16 ) : 3439– 47。doi : 10.1093/ nar /29.16.3439。PMC 55849。PMID 11504882 。
^ Chauchereau A、Mathieu M、de Saintignon J、Ferreira R、Pritchard LL、Mishal Z、Dejean A、Harel-Bellan A (2004 年 11 月)。「HDAC4 は急性前骨髄球性白血病関連タンパク質 PLZF による転写抑制を媒介する」。Oncogene . 23 ( 54): 8777– 84. doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . PMID 15467736。
さらに読む
Pazin MJ、Kadonaga JT (1997 年 5 月)。「ヒストンの脱アセチル化と転写の浮き沈みは?」。 Cell . 89 (3): 325–8 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80211-1 . PMID 9150131. S2CID 11488594。
Verdin E、Dequiedt F、Kasler HG (2003 年 5 月)。「クラス II ヒストン脱アセチル化酵素: 多用途の調節因子」。 遺伝学の動向 。19 (5): 286– 93。doi : 10.1016 /S0168-9525(03)00073-8。hdl : 2268 / 80861。PMID 12711221 。
Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W 、 Gibbs RA (1996 年 4 月)。「改良されたショットガン ライブラリ構築のための「ダブル アダプター」法」。Analytical Biochemistry。236 ( 1): 107– 13。doi :10.1006/ abio.1996.0138。PMID 8619474 。
Yu W、Andersson B、Worley KC、Muzny DM、Ding Y、Liu W、Ricafrente JY、Wentland MA、Lennon G、Gibbs RA (1997 年 4 月)。「大規模連結 cDNA シーケンシング」。 ゲノム 研究 。7 ( 4 ): 353– 8。doi :10.1101/ gr.7.4.353。PMC 139146。PMID 9110174 。
Wolffe AP (1997 年 5 月)。「転写制御。罪深い抑制」。Nature。387 ( 6628 ) : 16– 7。doi : 10.1038 / 387016a0。PMID 9139815。S2CID 29803420 。
Ohara O, Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Nomura N (1997年2月). 「比較的大きなタンパク質をコードするcDNAクローンの解析に適したヒト脳cDNAライブラリーの構築と特性評価」. DNA Research . 4 (1): 53– 9. doi : 10.1093/dnares/4.1.53 . PMID 9179496.
Fischle W、Emiliani S、 Hendzel MJ、Nagase T、Nomura N、Voelter W、Verdin E (1999 年 4 月)。「Saccharomyces cerevisiae HDA1p に関連するヒトヒストン脱アセチル化酵素の新しいファミリー」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 17): 11713– 20。doi : 10.1074/jbc.274.17.11713。PMID 10206986 。
Grozinger CM、Hassig CA 、 Schreiber SL (1999 年 4 月)。「3 つのタンパク質が酵母 Hda1p に関連するヒトヒストン脱アセチル化酵素のクラスを定義する」。 米国 科学 アカデミー紀要 。96 ( 9): 4868– 73。Bibcode :1999PNAS ... 96.4868G。doi : 10.1073/ pnas.96.9.4868。PMC 21783。PMID 10220385 。
Miska EA、Karlsson C、Langley E、Nielsen SJ、Pines J、Kouzarides T (1999 年 9 月)。「HDAC4 脱アセチル化酵素は MEF2 転写因子と関連し、これを抑制する」。EMBO ジャーナル 。18 ( 18 ) : 5099– 107。doi : 10.1093/emboj/18.18.5099。PMC 1171580。PMID 10487761 。
Wang AH、Bertos NR、Vezmar M、Pelletier N、Crosato M、Heng HH、Th'ng J、Han J、Yang XJ (1999 年 11 月)。「酵母 HDA1 に関連するヒトヒストン脱アセチル化酵素 HDAC4 は転写コリプレッサーである」。 分子 細胞 生物 学 。19 ( 11): 7816– 27。doi :10.1128/mcb.19.11.7816。PMC 84849。PMID 10523670 。
Youn HD、Grozinger CM、Liu JO (2000 年 7 月)。「カルシウムはヒストン脱アセチル化酵素4 による筋細胞エンハンサー 因子 2 の転写抑制を制御する」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 29): 22563– 7。doi : 10.1074/ jbc.C000304200。PMID 10825153 。
Grozinger CM、Schreiber SL (2000 年 7 月)。「14-3-3 依存性細胞局在によるヒストン脱アセチル化酵素 4 および 5 と転写活性の調節」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。97 ( 14 ): 7835–40。Bibcode : 2000PNAS ...97.7835G。doi : 10.1073/ pnas.140199597。PMC 16631。PMID 10869435 。
Huynh KD、Fischle W、 Verdin E、 Bardwell VJ (2000 年 7 月)。「BCL-6 抑制 に 関与する新規コリプレッサー、BCoR」。 遺伝子と発達 。14 (14): 1810– 23。doi : 10.1101/gad.14.14.1810。PMC 316791。PMID 10898795 。
Li J、Wang J、Wang J、Nawaz Z、Liu JM、Qin J、Wong J (2000 年 8 月)。「コリプレッサータンパク質 SMRT と N-CoR はどちらも HDAC3 を含む大きなタンパク質複合体内に存在する」。EMBO Journal。19 ( 16 ) : 4342–50。doi : 10.1093 / emboj/19.16.4342。PMC 302030。PMID 10944117 。
Wang AH、Kruhlak MJ、Wu J、Bertos NR、Vezmar M、Posner BI、Bazett-Jones DP、Yang XJ (2000 年 9 月)。「14-3-3 タンパク質の結合によるヒストン脱アセチル化酵素 4 の調節」。 分子 細胞 生物 学 。20 ( 18 ): 6904–12。doi :10.1128/MCB.20.18.6904-6912.2000。PMC 88766。PMID 10958686 。
Zhang CL、McKinsey TA、Lu JR、Olson EN (2001 年 1 月)。「COOH 末端結合タンパク質 (CtBP) と MEF2 相互作用転写リプレッサー (MITR) の結合は、MEF2 転写因子の転写抑制に寄与する」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 1): 35– 9。doi : 10.1074/ jbc.M007364200。PMID 11022042 。
McKinsey TA、 Zhang CL、Lu J、Olson EN (2000 年 11 月)。「ヒストン脱アセチル化酵素のシグナル依存性核輸出が筋肉分化を制御する」。Nature . 408 ( 6808 ) : 106– 11。Bibcode :2000Natur.408..106M。doi : 10.1038/35040593。PMC 4459600。PMID 11081517 。
Zhou X、Richon VM、Wang AH、Yang XJ、Rifkind RA、Marks PA (2000 年 12 月)。「ヒストン脱アセチル化酵素 4 は細胞外シグナル制御キナーゼ 1 および 2 と関連し、その細胞内局在は発癌性 Ras によって制御される」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。97 (26): 14329– 33。Bibcode : 2000PNAS ... 9714329Z。doi : 10.1073/ pnas.250494697。PMC 18918。PMID 11114188 。
McKinsey TA、Zhang CL、Olson EN (2000 年 12 月)。「カルシウム/カルモジュリン依存性タンパク質キナーゼ刺激による 14-3-3 のヒストン脱アセチル化酵素 5 への結合による筋細胞エンハンサー因子 2 転写因子の活性化」。 米国 科学アカデミー紀要。97 ( 26 ) : 14400–5。Bibcode : 2000PNAS ...9714400M。doi : 10.1073 / pnas.260501497。PMC 18930。PMID 11114197 。
外部リンク
米国国立医学図書館の 医学主題標目表 (MeSH)における HDAC4+タンパク質、+ヒト
この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。