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| フィブロネクチンII型ドメイン | |||||||||
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 精漿タンパク質PDC-109のコラーゲン結合II型ドメイン。[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | 2 番目 | ||||||||
| パム | PF00040 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | SM00059 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00022 | ||||||||
| SCOP2 | 1pdc / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| OPMスーパーファミリー | 115 | ||||||||
| OPMタンパク質 | 1時間8分 | ||||||||
| 医療機器 | cd00062 | ||||||||
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フィブロネクチンタイプIIドメインは、コラーゲン結合タンパク質ドメインです。フィブロネクチンは、血漿中に可溶性の形で、疎性結合組織および基底膜中に不溶性の形で存在するマルチドメイン糖タンパク質であり、細胞表面やコラーゲン、フィブリン、ヘパリン、DNA、アクチンなどのさまざまな化合物と結合します。フィブロネクチンは、創傷治癒、細胞接着、血液凝固、細胞分化および移動、細胞骨格の維持、腫瘍転移など、多くの重要な機能に関与しています。[2]フィブロネクチンの配列の主要部分は、タイプI、II、IIIと呼ばれる3種類のドメインの繰り返しで構成されています。[3]
タイプ II ドメインはおよそ 60 アミノ酸から成り、[4]ジスルフィド結合に関与する 4 つの保存されたシステインを含み、フィブロネクチンのコラーゲン結合領域の一部です。タイプ II ドメインはフィブロネクチンに 2 回出現します。タイプ II ドメインは、血液凝固因子 XII、ウシ精漿タンパク質PDC-109 (BSP-A1/A2) および BSP-A3、[5]カチオン非依存性マンノース-6-リン酸受容体、[6]マクロファージのマンノース受容体、[7] 180 Kd 分泌型ホスホリパーゼ A2 受容体、[8] DEC-205 受容体、[9] 72 Kd および 92 Kd IV 型コラーゲナーゼ ( EC 3.4.24.24)、[10]肝細胞増殖因子活性化因子など、さまざまなタンパク質にも見つかっています。[11]
フィブロネクチンII型ドメインと脂質二重層の相互作用
フィブロネクチンタイプIIドメインは、EphA2受容体タンパク質の細胞外部分の一部です。EphA2受容体のFN2ドメインは、正に帯電した成分、すなわちK441とR443を有し、これらは陰イオン性膜脂質ホスファチジルグリセロールなどの陰イオン性脂質を引き付け、ほぼ排他的に結合します。[12] K441とR443は一緒になって膜結合モチーフを構成し、EphA2受容体が細胞膜に付着できるようにします。[12]
このドメインを含むヒトタンパク質
BSPH1; ELSPBP1; F12 ; FN1 ; HGFAC ; IGF2R ; LY75 ; MMP2 ; MMP9 ; MRC1 ; MRC1L1 ; MRC2 ; PLA2R1 ; SEL1L ;
参考文献
- ^ Wah DA、Fernández-Tornero C、Sanz L、Romero A、Calvete JJ (2002年4月)。「PDC-109-ホスホリルコリン複合体の1.8Å結晶構造からみた精子コーティング機構」。構造。10 ( 4 ): 505–14。doi : 10.1016/ S0969-2126 (02)00751-7。PMID 11937055。
- ^ Dean DC、Bowlus CL、Bourgeois S (1987)。「ヒトフィブロネクチン遺伝子のプロモーター領域のクローニングと分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 84 (7): 1876–1880. doi : 10.1073/pnas.84.7.1876 . PMC 304544 . PMID 3031656。
- ^ Skorstengaard K、Jensen MS、Sahl P、Petersen TE、Magnusson S (1986)。「ウシ血漿フィブロネクチンの完全な一次構造」。Eur . J. Biochem . 161 (2): 441–453. doi :10.1111/j.1432-1033.1986.tb10464.x. PMID 3780752。
- ^ Pankov R, Yamada KM (2002). 「フィブロネクチンの概要」J Cell Sci . 115 (20): 3861–3863. doi : 10.1242/jcs.00059 . PMID 12244123.
- ^ Chretien M, Seidah NG, Manjunath P, Rochemont J, Sairam MR (1987). 「ウシ精漿由来 BSP-A3 の完全なアミノ酸配列。PDC-109 およびフィブロネクチンのコラーゲン結合ドメインとの相同性」。Biochem . J. 243 ( 1): 195–203. doi :10.1042/bj2430195. PMC 1147832. PMID 3606570 .
- ^ Kornfeld S (1992). 「マンノース6リン酸/インスリン様成長因子II受容体の構造と機能」. Annu. Rev. Biochem . 61 (1): 307–330. doi :10.1146/annurev.bi.61.070192.001515. PMID 1323236.
- ^ Drickamer K, Taylor ME, Conary JT, Lennartz MR, Stahl PD (1990). 「マンノース受容体の一次構造には、炭水化物認識ドメインに似た複数のモチーフが含まれている」J. Biol. Chem . 265 (21): 12156–12162. doi : 10.1016/S0021-9258(19)38325-5 . PMID 2373685.
- ^ Lazdunski M, Barhanin J, Lambeau G, Ancian P (1994). 「分泌ホスホリパーゼA2の膜受容体のクローニングと発現」J. Biol. Chem . 269 (3): 1575–1578. doi : 10.1016/S0021-9258(17)42060-6 . PMID 8294398.
- ^ Jiang W, Swiggard WJ, Heufler C, Peng M, Mirza A, Steinman RM, Nussenzweig MC (1995). 「樹状細胞と胸腺上皮細胞によって発現される受容体 DEC-205 は抗原処理に関与している」. Nature . 375 (6527): 151–155. Bibcode :1995Natur.375..151J. doi :10.1038/375151a0. PMID 7753172. S2CID 4244472.
- ^ Grant GA、Collier IE、Wilhelm SM、Eisen AZ、Marmer BL、Seltzer JL、Kronberger A、Bauer EA、Goldberg GI、He CS (1988)。「H-ras 癌遺伝子を導入したヒト気管支上皮細胞 (TBE-1) は、基底膜コラーゲンを分解できる単一のメタロプロテアーゼを分泌する」。J . Biol. Chem . 263 (14): 6579–6587. doi : 10.1016/S0021-9258(18)68680-6 . PMID 2834383。
- ^ Miyazawa K, Shimomura T, Kitamura A, Kondo J, Morimoto Y, Kitamura N (1993). 「肝細胞増殖因子の活性化に関与するヒトセリンプロテアーゼのcDNAの分子クローニングと配列分析。血液凝固因子XIIに対するプロテアーゼ前駆体の構造類似性」。J . Biol. Chem . 268 (14): 10024–10028. doi : 10.1016/S0021-9258(18)82167-6 . PMID 7683665.
- ^ ab Chavent M、Seiradake E、Jones EY 、 Sansom MS（2016年2月）。「膜上のEphA2受容体の構造：脂質相互作用の役割」。 構造。24（2）：337–47。doi ： 10.1016 /j.str.2015.11.008。PMC 4744086。PMID 26724997。
外部リンク
- PROSITEのフィブロネクチン II 型コラーゲン結合ドメイン