FCN1

FCN1
利用可能な構造物
PDB	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコード一覧
	2D39、2JHH、2JHI、2JHK、2JHL、2JHM、2WNP
識別子
別名	FCN1、FCNM、フィコリン1
外部ID	オミム: 601252 ; MGI : 1341158 ;ホモロジーン: 1518 ;ジーンカード: FCN1 ; OMA : FCN1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クリスチャン	染色体9（ヒト）
終わり	134,917,912 bp
遺伝子の位置（マウス）
クリスチャン	染色体2（マウス）
終わり	27,974,897 bp
RNA発現パターン
	トップは
	単球; 顆粒球; 海綿骨; 骨髄; 血; 骨髄細胞; 頬粘膜細胞; 付録; 脾臓; 歯周繊維;
	トップは
	顆粒球; 桑実胚; 骨髄; 大腿骨体; 脊髄の腰部亜節; 蝸牛; 蝸牛管の前庭膜; 脾臓; 上腕三頭筋; 顎下腺;
	より多くの参照発現データ
	より多くの参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	シアル酸結合; タンパク質結合; Gタンパク質共役型受容体結合; 金属イオン結合; 炭水化物結合; パターン認識受容体活性; セリン型エンドペプチダーゼ活性; 炭水化物誘導体結合;
細胞成分	細胞外領域; 細胞膜; コラーゲン; 細胞膜の外側の外部成分; 膜; 分泌顆粒内腔; フィコリン-1リッチ顆粒内腔; コラーゲン含有細胞外マトリックス;
生物学的プロセス	補体活性化、レクチン経路; 補体活性化; Gタンパク質共役型受容体シグナル伝達経路; アポトーシス細胞の認識; タンパク質の細胞表面への局在化; 細胞表面パターン認識受容体シグナル伝達経路; 免疫系のプロセス; タンパク質分解; 自然免疫応答; 好中球の脱顆粒;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	2219
	14134
	ENSG00000085265
	ENSMUSG00000026835
	O00602
	O70497
	NM_002003
	NM_010190
	NP_001994
	NP_034320
	ウィキデータ
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フィコリン-1、または一般的にM-フィコリンとも呼ばれるタンパク質は、ヒトではFCN1遺伝子によってコードされています。^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

フィコリンファミリーのタンパク質は、リーダーペプチド、短いN末端セグメント、それに続くコラーゲン様ドメイン、およびC末端フィブリノーゲン様ドメインから構成されます。フィコリンという名前は、後者の2つのドメインに由来しています。コラーゲン様ドメインとフィブリノーゲン様ドメインは、テネイシンなどの他のタンパク質にも見られますが、前者は補体タンパク質C1qや、マンノース結合レクチンや肺サーファクタントタンパク質を含むコレクチンにも見られます。フィコリンは、アセチル化化合物を選択的に認識します。FCN1によってコードされるM-フィコリンは、主に末梢血白血球で発現し、エラスチン結合活性を持つ血漿タンパク質として機能すると考えられています。FCN1遺伝子には、M-フィコリンの血清濃度とリガンド結合能に影響を与えるいくつかのSNPが報告されています。M-フィコリン濃度は疾患活動性を反映し、早期関節リウマチの寛解を予測します。

参考文献

1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000085265 – Ensembl、2017年5月
1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026835 – Ensembl、2017年5月
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↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
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↑ "Entrez Gene: FCN1 フィコリン（コラーゲン/フィブリノーゲンドメイン含有）1"。

さらに読む

Lu J, Le Y (1999). "フィコリンとフィブリノーゲン様ドメイン". Immunobiology . 199 (2): 190–9 . doi : 10.1016/s0171-2985(98)80026-0 . PMID 9777405 .
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[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000085265 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026835 – Ensembl、2017年5月

[3] 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid8573080-5] Lu J 、Tay PN、Kon OL、Reid KB (1996 年 3 月)。「ヒトフィコリン: cDNA クローニング、末梢血白血球が主要な合成部位であることの証明、および遺伝子の 9 番染色体への割り当て」。Biochem J。313 ( 2 ) : 473–8。doi : 10.1042 / bj3130473。PMC 1216931。PMID 8573080。

[pmid8884275-6] 遠藤裕、佐藤裕、松下正、藤田哲也 (1997年2月)。「ヒトレクチン P35 遺伝子および関連遺伝子のクローニングと特性解析」。Genomics。36 ( 3 ) : 515–21。doi : 10.1006 / geno.1996.0497。PMID 8884275。

[entrez-7] "Entrez Gene: FCN1 フィコリン（コラーゲン/フィブリノーゲンドメイン含有）1"。

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参考文献

さらに読む

関連するトピック

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オミム

MGI