Loading article…
| アンケート | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | POLL、BETAN、POLKAPPA、ポリメラーゼ (DNA) ラムダ、DNA ポリメラーゼ ラムダ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：606343; MGI : 1889000;ホモロジーン: 40863;ジーンカード：ポーリング; OMA :POLL - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNAポリメラーゼラムダはPol λとも呼ばれ、すべての真核生物に存在する酵素です。ヒトではPOLL遺伝子によってコードされています。[5] [6]
関数
Pol λは、 DNAポリメラーゼのXファミリーのメンバーです。DNA二本鎖切断（DSB）修復経路である非相同末端結合（NHEJ）中に失われたヌクレオチドを再合成すると考えられています。[7] [8] NHEJは、高等真核生物におけるDNA DSB修復の主な経路です。染色体DSBは、最も深刻なタイプのDNA損傷です。NHEJ中、壊れたDNA末端の整列によって生成された二重鎖には通常、DNAポリメラーゼによって埋める必要がある小さなギャップが含まれます。DNAポリメラーゼラムダは、この機能を実行できます。[9]
pol λの結晶構造は、DNA複製を触媒するDNAポリメラーゼとは異なり、pol λは下流のDNA鎖の5'リン酸と広範囲に接触することを示しています。これにより、ポリメラーゼは二本鎖切断の両端を安定化することができ、pol λが非相同末端結合の役割に独自に適している理由を説明しています。[10]
NHEJに加えて、pol λは塩基除去修復（BER）にも関与し、 Pol βが存在しない場合にバックアップ活性を提供します。[11] [12] BERは、DNAのアルキル化、酸化、脱プリン化/脱ピリミジン化、脱アミノ化 によって生じる小さな塩基損傷を修復するための主要な経路です。
触媒ポリメラーゼドメインの他に、pol λには8 kDaのドメインとBRCTドメインがあります。8 kDaのドメインには、鎖切断の末端から5'デオキシリボースリン酸基を除去できるリアーゼ活性があります。[13] BRCTドメインは、DNA修復タンパク質に共通するリン酸化ペプチド結合ドメインであり、タンパク質間相互作用の調整に関与していると考えられます。[14] Pol λは、非相同末端結合にも関与するXファミリーの別のメンバーであるpol μ と構造的および機能的に関連しています。[15] pol μと同様に、pol λはV(D)J組換えに関与しており、このプロセスによって脊椎動物の免疫系でB細胞およびT細胞受容体の多様性が生み出されます。pol μは重鎖の再編成に重要ですが、pol λは軽鎖の再編成にさらに重要であるようです。[16] [17] 酵母サッカロミセス・セレビシエはpolλとpolμの両方の相同遺伝子であるPol4を持っている。[18]
トランスレジョン合成は、複製中にDNA損傷をコピーする際に、特殊なDNAポリメラーゼが複製ポリメラーゼの代わりに働く損傷耐性機構である。DNAポリメラーゼラムダは、脱塩基部位と8-oxodG損傷のトランスレジョン合成に関与していると思われる。[9] [19]
インタラクション
Pol λはPCNAと相互作用することが示されている。[20]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000166169 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025218 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: POLLポリメラーゼ（DNA指向）、ラムダ」。
- ^ Aoufouchi S、Flatter E、Dahan A、Faili A、Bertocci B、Storck S、Delbos F、Cocea L、Gupta N、Weill JC、Reynaud CA (2000 年 9 月)。「polX ファミリーの 2 つの新規ヒトおよびマウス DNA ポリメラーゼ」。Nucleic Acids Res . 28 (18): 3684–93. doi :10.1093/nar/28.18.3684. PMC 110747 . PMID 10982892。
- ^ Daley JM、Laan RL、Suresh A、Wilson TE (2005 年 8 月)。「非相同末端結合における pol X ファミリーポリメラーゼ作用の DNA 結合依存性」。J . Biol. Chem . 280 (32): 29030–7. doi : 10.1074/jbc.M505277200 . PMID 15964833。
- ^ Lee JW、Blanco L、Zhou T、Garcia-Diaz M、Bebenek K、Kunkel TA、Wang Z、Povirk LF (2004 年 1 月)。「ヒト核抽出物における非相同 DNA 末端結合のアラインメントベースのギャップ充填における DNA ポリメラーゼラムダの影響」。J . Biol. Chem . 279 (1): 805–11. doi : 10.1074/jbc.M307913200 . hdl : 10261/338875 . PMID 14561766。
- ^ ab Bebenek K, Pedersen LC, Kunkel TA (2014). 「DNAポリメラーゼλの構造機能研究」.生化学. 53 (17): 2781–92. doi : 10.1021/bi4017236. PMC 4018081. PMID 24716527.
- ^ Garcia-Diaz M、Bebenek K、Krahn JM、Blanco L、Kunkel TA、Pedersen LC (2004 年 2 月)。「最小限の相同性を持つ DNA ギャップの DNA ポリメラーゼ ラムダ依存性修復の構造的ソリューション」。Mol . Cell . 13 (4): 561–72. doi : 10.1016/S1097-2765(04)00061-9 . PMID 14992725。
- ^ Tano K, Nakamura J, Asagoshi K, Arakawa H, Sonoda E, Braithwaite EK, Prasad R, Buerstedde JM, Takeda S, Watanabe M, Wilson SH (2007 年 6 月). 「ニワトリ DT40 細胞における酸化 DNA 損傷の修復における DNA ポリメラーゼ β とλ の相互作用」. DNA Repair (Amst.) . 6 (6): 869–75. doi :10.1016/j.dnarep.2007.01.011. PMC 2080795 . PMID 17363341.
- ^ Braithwaite EK、Prasad R、Shock DD、Hou EW、Beard WA、Wilson SH (2005 年 5 月)。「DNA ポリメラーゼ ラムダはマウス胎児線維芽細胞抽出物中のバックアップ塩基除去修復活性を媒介する」。J . Biol. Chem . 280 (18): 18469–75. doi : 10.1074/jbc.M411864200 . PMID 15749700。
- ^ García-Díaz M、Bebenek K、Kunkel TA、Blanco L (2001 年 9 月)。「ヒト DNA ポリメラーゼラムダにおける固有の 5'-デオキシリボース-5-リン酸リアーゼ活性の特定: 塩基除去修復における役割の可能性」。J . Biol. Chem . 276 (37): 34659–63. doi : 10.1074/jbc.M106336200 . hdl : 10261/338865 . PMID 11457865.
- ^ Yu X、Chini CC、He M、Mer G 、 Chen J (2003 年 10 月)。「 BRCTドメイン はリン酸化タンパク質結合ドメインである」。Science。302 ( 5645): 639–42。Bibcode : 2003Sci ...302..639Y。doi : 10.1126/science.1088753。PMID 14576433。S2CID 29407635 。
- ^ Nick McElhinny SA、Ramsden DA (2004 年 8 月)。「兄弟間の競争: V(D)J 組み換えと一般的な二本鎖切断修復における Pol X ファミリー メンバー間の競争」。Immunol . Rev. 200 : 156–64。doi :10.1111 / j.0105-2896.2004.00160.x。PMID 15242403。S2CID 36516952 。
- ^ Bertocci B、De Smet A、Berek C、Weill JC、Reynaud CA (2003 年 8 月)。「DNA ポリメラーゼ mu 欠損マウスでは免疫グロブリン κ 軽鎖遺伝子の再配列が損なわれる」。免疫。19 ( 2): 203–11。doi : 10.1016 /S1074-7613( 03 )00203-6。PMID 12932354。
- ^ Bertocci B、De Smet A、Weill JC、Reynaud CA (2006 年 7 月)。「生体内での免疫グロブリン V(D)J 組み換え中の DNA ポリメラーゼ mu、lambda、および末端デオキシヌクレオチド転移酵素の非重複機能」。 免疫。25 ( 1): 31–41。doi : 10.1016/ j.immuni.2006.04.013。PMID 16860755。
- ^ Lieber MR (2006年7月). 「V(D)J組換えのためのポリメラーゼ」.免疫. 25 (1): 7–9. doi : 10.1016/j.immuni.2006.07.007 . PMID 16860749.
- ^ Burak MJ、Guja KE、Hambardjieva E、Derkunt B、Garcia-Diaz M (2016)。 「DNA ポリメラーゼ ラムダの忠実度メカニズムは、8-oxo-dG のエラーのないバイパスを促進します。」エンボ J . 35 (18): 2045 ～ 59 年。土井：10.15252/embj.201694332。PMC 5282837。PMID 27481934。
- ^ Maga G、Villani G、Ramadan K、Shevelev I、Tanguy Le Gac N、Blanco L、Blanca G、Spadari S、Hübscher U (2002 年 12 月)。「ヒト DNA ポリメラーゼ ラムダは、正常および病変通過 DNA 合成において増殖細胞核抗原と機能的かつ物理的に相互作用する」。J . Biol. Chem . 277 ( 50): 48434–40。doi : 10.1074/jbc.M206889200。hdl : 10261 / 338844。PMID 12368291。