軟骨魚類

骨格は軟骨性である。脊索は発生の過程で徐々に脊柱に置き換わるが、全頭類では脊索はそのまま残る。一部の深海ザメでは脊柱が縮小している。^{[ 9 ]}

骨髄を持たないため、赤血球は脾臓と生殖腺周囲組織（生殖腺の周囲にある特殊な組織で、免疫系にも関与していると考えられている）で産生される。また、特定の軟骨魚類にのみ見られるライディッヒ器官でも産生される。非常に特殊化したグループである全頭亜綱には、ライディッヒ器官も生殖腺周囲組織も存在しない。

デンキエイ類は、厚くてたるんだ体と柔らかく緩い皮膚を持つが、軟骨魚類は、皮膚歯で覆われた丈夫な皮膚を持つ（ただし、全頭類は例外で、成体では歯は失われ、雄の尾部腹面にある把持器官にのみ残る）。この皮膚歯は板状鱗（または皮膚歯状突起）とも呼ばれ、サンドペーパーのような感触である。ほとんどの種では、すべての皮膚歯状突起が一方向に並んでいるため、一方向にこすると非常に滑らかに、反対方向にこすると非常に粗く感じる。

元々、皮膚要素を含まない胸帯と骨盤帯は繋がっていませんでした。後の形態では、肩甲烏口骨と恥骨坐骨骨が発達するにつれて、それぞれの鰭の対が腹側で中央部で繋がるようになりました。エイ類では、胸鰭は頭部に繋がっており、非常に柔軟です。

ほとんどのサメに見られる主な特徴の一つは、移動を助ける異尾類の尾である。^{[ 10 ]}

軟骨魚類は、歯のような鱗状構造を持つ。これは皮膚歯状突起または板状鱗と呼ばれる。歯状突起は通常、保護の役割を果たし、多くの場合、流線型の形状を保つのにも役立つ。一部の種には粘液腺も存在する。

彼らの口の中の歯は、皮膚の歯状突起が口の中に移動して進化したと考えられているが、逆の可能性もある。硬骨魚類のDenticeps clupeoidesは頭部の大部分が皮膚の歯で覆われている（おそらく別の硬骨魚類であるAtherion elymusも同様である）。これはおそらく二次的に進化した特徴であり、歯と元の皮膚の鱗との間に必ずしも関連性があるとは限らないことを意味する。

古代の板皮類には歯は全くなく、口の中に鋭い骨板があった。そのため、皮膚歯と口腔歯のどちらが先に進化したのかは不明である。すべての脊椎動物の本来の骨板は今では失われており、現在の鱗は単に変形した歯に過ぎないという説さえ提唱されている。たとえ歯と体表の装甲がはるか昔に共通の起源を持っていたとしても、である。しかし、今のところこれを裏付ける証拠はない。

軟骨魚類は種によって5～7対の鰓で呼吸する。一般的に、外洋性の種は酸素を含んだ水を鰓に循環させるために泳ぎ続けなければならないが、底生性の種は噴水孔から水を取り込み、鰓から水を排出することができる。^{[ 11 ]}ただし、これは一般的な規則にすぎず、多くの種で異なる。

噴水孔は、両目の後ろにある小さな穴です。ネコザメ（Ginglymostoma cirratum）に見られるような小さくて円形のものから、オオセ科のサメ（Orectolobidae）に見られるような細長くスリット状のものまで様々です。ネズミザメ科（Lamnidae）やオナガザメ科（Alopiidae）など、多くの大型の外洋性種は、もはや噴水孔を持っていません。

軟骨魚類では、神経系は小さな脳、8〜10 対の脳神経、および脊髄と脊髄神経から構成されています。^{[ 12 ]}処理される情報を提供する感覚器官がいくつかあります。ロレンツィーニ器官は、電気受容器と呼ばれる小さなゼリー状の孔のネットワークで、魚が水中の電場を感知するのに役立ちます。これは、獲物を見つけたり、航行したり、温度を感知したりするのに役立ちます。側線系には、周囲の水中の動き、振動、圧力を感知する、外部に位置する変形した上皮細胞があります。ほとんどの種は、大きく発達した目を持っています。また、非常に強力な鼻孔と嗅覚器官を持っています。内耳は、バランスと方向感覚を助ける 3 つの大きな半規管から構成されています。音検出器官は範囲が限られており、通常は低周波数でより強力です。一部の種は、防御や捕食に使用できる電気器官を持っています。脳は比較的単純で、前脳はそれほど大きくありません。軟骨魚類の神経系におけるミエリンの構造と形成は四肢動物のそれとほぼ同一であるため、進化生物学者は軟骨魚類がミエリン発達の進化のタイムラインにおける基礎的なグループであったと考えている。^{[ 13 ]}

他の顎を持つ脊椎動物と同様に、軟骨魚類は適応免疫系を持っている。^{[ 14 ]}