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| KRT19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | KRT19、CK19、K19、K1CS、ケラチン19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：148020; MGI : 96693;ホモロジーン: 1713;ジーンカード：KRT19; OMA :KRT19 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ケラチン、タイプI細胞骨格19（ケラチン-19） ）は、サイトケラチン-19（CK-19）としても知られ、ヒトではKRT19遺伝子によってコードされる40 kDaのタンパク質です。[5] [6]ケラチン-19はI型ケラチンです。
関数
ケラチン 19 はケラチンファミリーの一員です。ケラチンは上皮細胞の構造的完全性を担う中間径フィラメントタンパク質であり、サイトケラチンと毛髪ケラチンに分類されます。
ケラチン 19 はI 型ケラチンです。I 型サイトケラチンは、異型ケラチン鎖のペアで配列された酸性タンパク質で構成されています。関連するファミリーのメンバーとは異なり、この最小の既知の酸性サイトケラチンは、上皮細胞で塩基性サイトケラチンとペアになっていません。これは、発達中の表皮を包む一時的に表面の層である胚周皮に特異的に見られます。I 型サイトケラチンは、染色体 17 (q12-q21)の領域に密集しています。 [6]
バイオマーカーとしての使用
KRT19の可溶性断片であるCYFRA 21-1は、肺、乳がん、胃、膵臓、卵巣など、さまざまな種類の癌の腫瘍マーカーです。KRT19はこれらの臓器の癌で一般的に発現しており、細胞のアポトーシス中にKRT19が切断されるとCYFRA 21-1が生成されます。[7] [8]
KRT19 は感度が高いため、乳がん患者のリンパ節、末梢血、骨髄に分布する腫瘍細胞のRT-PCRによる検出に最もよく使用されるマーカーです。アッセイに応じて、KRT19 は特異的マーカーと非特異的マーカーの両方であることが示されています。
CYFRA 21-1 / KRT19 RT-PCR 研究における偽陽性には以下が含まれます:
- 非合法な転写（実際の生理学的役割を持たない組織による少量の KRT19 mRNAの発現）
- 血液疾患（炎症状態および好中球減少症において高濃度で循環するサイトカインおよび成長因子による末梢血細胞中のKRT19誘導）
- 偽遺伝子の存在（KRT19 の 2 つの偽遺伝子、KRT19a と KRT19b が特定されており、これらは KRT19 mRNA と顕著な配列相同性を持っています。その後、本物の KRT19 の発現を検出しようとすると、これらの偽遺伝子のいずれかまたは両方が検出される可能性があります）
- サンプルの汚染（RT-PCR分析のための末梢血サンプル採取中に汚染上皮細胞が混入すること）[9]
- 外傷やストレス（せん断応力、熱ショック、毒素、感染、老化、喫煙などの酸化ストレスなど）はKRT19の発現と細胞のアポトーシスを増加させる[7]
- 体重減少と筋肉の消耗/アポトーシス（KRT19は筋肉で発現する）[7]
さらに、Ck-19は乳頭状甲状腺癌の術後診断マーカーとして広く応用されている。[10]
ケラチン19は、血液中の循環腫瘍細胞を数える検査において、上皮由来の細胞と造血細胞を区別するために、ケラチン8およびケラチン18と一緒に使用されることが多い。[11]
インタラクション
ケラチン19はピニンと相互作用することが示されている。[12]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000171345 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020911 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Schweizer J、Bowden PE、Coulombe PA、Langbein L、Lane EB、Magin TM、Maltais L、Omary MB、Parry DA、Rogers MA、Wright MW (2006 年 7 月)。「哺乳類ケラチンの新しいコンセンサス命名法」。The Journal of Cell Biology。174 ( 2): 169–74。doi : 10.1083 /jcb.200603161。PMC 2064177。PMID 16831889。
- ^ ab "Entrez Gene: KRT19 ケラチン 19".
- ^ abc 南端 明、河野 勇、有本 剛、丸中 勇、高山 功 (2023). 「癌のない個人における血清 CYFRA 21 − 1 の変動と臨床的特徴に対する感受性：4年間の回顧的分析」BMC Pulm Med . 23 (1): 344. doi : 10.1186/s12890-023-02650-x . PMC 10500899 . PMID 37705035.
- ^ Nakata B, Takashima T, Ogawa Y, Ishikawa T, Hirakawa K (2004). 「血清 CYFRA 21-1 (サイトケラチン-19 フラグメント) は乳がんの再発を検出し治療効果を評価するための有用な腫瘍マーカーである」Br J Cancer . 91 (5): 873–8. doi :10.1038/sj.bjc.6602074. PMC 2409884. PMID 15280913 .
- ^ Lacroix M (2006年12月). 「乳がん細胞の播種性、検出、マーカー」(PDF) .内分泌関連がん. 13 (4): 1033–67. doi :10.1677/ERC-06-0001. PMID 17158753. S2CID 10708900.
- ^ Dinets A, Pernemalm M, Kjellin H, Sviatoha V, Sofiadis A, Juhlin CC, Zedenius J, Larsson C, Lehtiö J, Höög A (2015年5月). 「乳頭状甲状腺癌および良性甲状腺病変の嚢胞液の異なるタンパク質発現プロファイル」. PLOS ONE . 10 (5): e0126472. Bibcode :2015PLoSO..1026472D. doi : 10.1371/journal.pone.0126472 . PMC 4433121. PMID 25978681 .
- ^ Allard WJ、Matera J、Miller MC、Repollet M、Connelly MC、Rao C、Tibbe AG、Uhr JW、Terstappen LW (2004 年 10 月)。「腫瘍細胞は、すべての主要な癌腫の末梢血中を循環しますが、健康な被験者や非悪性疾患の患者では循環しません」( PDF)。臨床癌研究。10 (20): 6897–904。doi : 10.1158 /1078-0432.CCR- 04-0378。PMID 15501967。
- ^ Shi J, Sugrue SP (2000 年 5 月). 「ケラチンとピニン間のタンパク質結合の解明。ピニンはデスモソーム中間径フィラメント複合体と核の両方に存在するタンパク質です」。The Journal of Biological Chemistry . 275 (20): 14910–5. doi : 10.1074/jbc.275.20.14910 . PMID 10809736.
さらに読む
- 大塚 勇、市川 勇、國崎 千恵、松田 剛、秋山 浩、野村 正、東郷 聡、林崎 勇、島田 秀 (2007)。「胃癌組織におけるマイクロダイセクションによる純度と遺伝子発現の相関」。スカンジナビア臨床検査研究ジャーナル。67 (4): 367–79。doi : 10.1080 /00365510601046334。PMID 17558891。S2CID 36635804 。
- Rasmussen HH、van Damme J、Puype M、Gesser B、Celis JE、Vandekerckhove J (1992 年 12 月)。「正常なヒト表皮角化細胞の 2 次元ゲルタンパク質データベースに記録された 145 個のタンパク質のマイクロシーケンス」。電気泳動。13 ( 12 ): 960–9。doi : 10.1002 /elps.11501301199。PMID 1286667。S2CID 41855774。
- Bader BL、Magin TM、Hatzfeld M、Franke WW (1986 年 8 月)。「例外的な尾部のない中間径フィラメントタンパク質であるサイトケラチン No. 19 のアミノ酸配列と遺伝子構成」。EMBOジャーナル 。5 ( 8 ) : 1865–75。doi :10.1002/j.1460-2075.1986.tb04438.x。PMC 1167052。PMID 2428612。
- Stasiak PC、 Lane EB (1987年12 月) 。「ヒトケラチン 19 をコードする cDNA の配列」。核酸研究。15 (23): 10058。doi :10.1093 / nar/15.23.10058。PMC 306562。PMID 2447559 。
- Eckert RL (1988 年 2 月)。「ヒト 40 kDa ケラチンの配列は、対応するウシケラチンと非常に高い配列同一性を持つ異常な構造を明らかにした」。米国科学アカデミー紀要。85 (4): 1114–8。Bibcode :1988PNAS... 85.1114E。doi : 10.1073 / pnas.85.4.1114。PMC 279716。PMID 2448790。
- Blumenberg M (1988). 「2つのケラチン遺伝子ファミリーにおける協調遺伝子重複」。Journal of Molecular Evolution . 27 (3): 203–11. Bibcode :1988JMolE..27..203B. doi :10.1007/BF02100075. PMID 2458477. S2CID 5606956.
- Bader BL、Jahn L、Franke WW (1988 年 12 月)。「ヒト臍帯の血管平滑筋細胞およびそこから得られた培養細胞におけるサイトケラチン 8、18、19 の低レベル発現、およびサイトケラチン 19 遺伝子を含む染色体座の分析」。European Journal of Cell Biology。47 ( 2) : 300–19。PMID 2468493。
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