ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
BPIFB2 識別子 エイリアス BPIFB2 、BPIL1、C20orf184、LPLUNC2、RYSR、dJ726C3.2、ファミリーBメンバー2を含むBPIフォールド 外部ID オミム ：614108; MGI : 1913807; ホモロジーン : 11884; ジーンカード : BPIFB2; OMA :BPIFB2 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体2（マウス） [2] バンド 2|2 H1 始める 153,716,965 bp [2] 終わり 153,737,190 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 気管 鼻粘膜の嗅覚領域 小唾液腺 咽頭粘膜 尿道 口腔 舌 耳下腺 舌の上側 舌の体
トップの表現 気管 精細管 精子細胞 脳の核 終脳核 前脳基底部 大脳半球 隔膜核 分界条核
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分
細胞外エクソソーム 細胞外領域 細胞外空間 小胞体腔 生物学的プロセス 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
BPIフォールド含有ファミリーBメンバー2 （BPIFB2）は、 殺菌性/透過性増加タンパク質様1 （BPI様1） としても知られ、ヒトでは BPIFB2 遺伝子 によってコードされる タンパク質 です。 [5] [6]
スーパーファミリー BPIFB2は、2つの類似したドメインが「ブーメラン」形状で形成する殺菌性/透過性増加タンパク質フォールド（BPIフォールド）の存在によって定義されるBPIフォールド タンパク質スーパーファミリー
のメンバーです。 [7]このスーパーファミリーは、 BPI/LBP/PLUNC ファミリーまたは BPI / LPB / CETP ファミリー としても知られています 。 [8] BPIフォールドは、 グラム陰性細菌 に見られる リポ多糖 のアシル炭素鎖などの疎水性および 両親媒性 分子と相互作用できる非極性結合ポケットを作成します が、このファミリーのメンバーは他にも多くの機能を持っている可能性があります。
BPIFB2はBPIフォールド遺伝子ファミリーおよびBPI/LBP/PLUNCタンパク質スーパーファミリーのメンバーである。 BPI/LBP/PLUNC スーパーファミリーの遺伝子は、 昆虫、軟体動物、回虫などの非脊椎動物の遠い 相同遺伝子を含むすべての脊椎動物種に見られます。 [9] [10] その広範なグループには、BPI フォールド 構造モチーフ をコードし、単一の染色体上に密集している BPIF 遺伝子ファミリーが含まれます。たとえば、ヒトでは 染色体 20 、マウスでは染色体 2、ラットでは染色体 3、ブタでは染色体 17、ウシでは染色体 13 です。BPIF 遺伝子ファミリーは、BPIFA と BPIFB の 2 つのグループに分かれています。ヒトでは、BIPFA は 3 つのタンパク質コード遺伝子 BPIFA1 、 BPIFA2 、 BPIFA3 、および 1 つの擬似遺伝子 BPIFA4P で構成されています 。一方、BPIFB は 5 つのタンパク質コード化遺伝子 BPIFB1 、 BPIFB2 、 BPIFB3 、 BPIFB4 、 BPIFB6 と 2 つの疑似遺伝子 BPIFB5P 、 BPIFB9P で構成されています。ヒトで疑似遺伝子として現れるものは、他の種では完全に機能する遺伝子として現れる場合があります。
ヒトでは、 BPIFB2遺伝子は最初 BPIL3 遺伝子 [5] として同定され、 そのコードされるタンパク質はLPLUNC2（長口蓋肺および鼻上皮クローン2）と呼ばれていましたが、 [11] その後PLUNCタンパク質はBPIフォールドスーパーファミリーのサブファミリーに分類されました。 [10] ヒトでは、 BPIFB2 遺伝子はBPI/LBP/PLUNCスーパーファミリーの他のメンバーとともに、20番染色体上のクラスターに存在します。
関数 BPIFB2タンパク質は、他の密接に関連するBPIFBタンパク質と同様に、口、鼻腔、肺の粘膜における細菌曝露に対する自然免疫反応に関与しています。特に、 ヒトの正常な唾液腺と食道、および 肥大扁桃腺で高度に発現しています。 [6] 慢性副鼻腔炎では、BPIFB2/LPLUNC2レベルが大幅に低下しており、これは腺の自然防御分子の放出の欠陥として解釈されています。 [12]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000078898 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027481 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ ab Mulero JJ、Boyle BJ、Bradley S、Bright JM、Nelken ST、Ho TT、他 (2002 年 8 月)。「脂質輸送/リポ多糖結合タンパク質ファミリー (LT/LBP) の 3 つの新しいヒトメンバー」。 免疫 遺伝 学 。54 (5): 293–300。doi : 10.1007 /s00251-002-0467-3。PMID 12185532。S2CID 11886572 。 ^ ab 「Entrez Gene: BPIL1 殺菌性/透過性増加タンパク質様 1」。 ^ Beamer LJ、Carroll SF、 Eisenberg D (1998 年 4 月)。「BPI/ LBP タンパク質ファミリー: 保存領域の構造解析」。 タンパク質 科学 。7 ( 4): 906–914。doi :10.1002/pro.5560070408。PMC 2143972。PMID 9568897 。 ^ 「CDD保存タンパク質ドメインファミリー：BPI」 。www.ncbi.nlm.nih.gov 。 ^ Beamer LJ、Fischer D、Eisenberg D (1998 年 7 月)。 「哺乳類 のLPS 結合 タンパク質および脂質輸送タンパク質の遠縁の検出」。 タンパク質科学 。7 (7): 1643–1646。doi : 10.1002 /pro.5560070721。PMC 2144061。PMID 9684900 。 ^ ab Bingle CD、Seal RL、Craven CJ (2011 年 8 月)。「BPI フォールド含有スーパーファミリーのサブファミリーとしての PLUNC/PSP/BSP30/SMGB タンパク質の体系的な命名法」。 生化学 協会 トランザクション 。39 ( 4): 977–983。doi : 10.1042/BST0390977。PMC 3196848。PMID 21787333 。 ^ Casado B、 Pannell LK、Iadarola P、Baraniuk JN (2005 年 7 月)。「プロテオミクスを用い た ヒト鼻粘液タンパク質の同定」。 プロテオミクス 。5 (11): 2949–2959。doi :10.1002/pmic.200401172。PMID 15996010。S2CID 22281622 。 ^ Seshadri S, Lin DC, Rosati M, Carter RG, Norton JE, Suh L, et al. (2012年7月). 「慢性副鼻腔炎患者の鼻ポリープ組織における抗菌性PLUNCタンパク質の発現低下」. アレルギー . 67 (7): 920–928. doi :10.1111/j.1398-9995.2012.02848.x. PMC 3375597. PMID 22676062 .
外部リンク
さらに読む
Bingle CD、Bingle L (2000 年 10 月)。「上気道と鼻咽頭に限定された発現パターンを持つ遺伝子産物であるヒト plunc 遺伝子の特性」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子構造と発現 。1493 (3): 363–367。doi :10.1016/S0167-4781(00)00196-2。PMID 11018263 。 Bingle CD、Craven CJ (2002 年 4 月)。「PLUNC: 上気道と鼻咽頭で発現する宿主防御タンパク質候補の新規ファミリー」。 ヒト 分子 遺伝学 。11 (8): 937–943。doi : 10.1093/ hmg /11.8.937。PMID 11971875 。 Zhang Z、 Henzel WJ (2004 年 10 月) 。 「実験的に検証 さ れ た切断部位の分析に基づくシグナルペプチド予測」。 タンパク質科学 。13 (10): 2819–2824。doi :10.1110/ps.04682504。PMC 2286551。PMID 15340161 。 Ramachandran P、Boontheung P、Xie Y 、 Sondej M、Wong DT、Loo JA (2006 年 6 月)。「糖タンパク質捕捉および質量分析によるヒト唾液中の N 結合型糖タンパク質の同定」。Journal of Proteome Research。5 ( 6): 1493–1503。doi :10.1021 / pr050492k。PMID 16740002 。
