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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | ATXN2、ASL13、ATX2、SCA2、TNRC13、アタキシン2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：601517; MGI : 1277223;ホモロジーン: 2234;ジーンカード：ATXN2; OMA :ATXN2 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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アタキシン2は、ヒトではATXN2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] ATXN2の変異は脊髄小脳失調症2型（SCA2）を引き起こす。
タンパク質構造
アタキシン-2には以下のタンパク質ドメインが含まれている: [7]
- 2つのLSmドメインはRNAへの結合を可能にすると考えられる
- ポリ(A)結合タンパク質と関連すると予測されるPAM2モチーフ
- いくつかの種にみられるポリグルタミン鎖（霊長類ではアミノ末端付近、昆虫ではLSmドメイン間に位置する）[8]
内部コーディングエクソンを欠落した潜在的な転写変異体が記載されているが、その全長の性質は不明である。[9]
種、組織、細胞内分布
ATXN2は真核生物全体で保存されています。ほとんどの脊椎動物にはこの遺伝子の2つの相同遺伝子（ヒトではATXN2とATXN2Lと呼ばれる）がありますが、鳥類には1つしかありません。植物種には2～6個のATXN2相同遺伝子があります。[8]
ATXN2はさまざまな組織に普遍的に発現しており、個々の細胞内ではゴルジ体とストレス顆粒に局在しています。[10]
関数
アタキシン2はポリ(A)結合タンパク質との相互作用を通じてmRNAの翻訳を制御する。また、ストレス顆粒やPボディの形成にも関与しており、これらもRNA制御に関与している。[10]
臨床的意義
脊髄小脳失調症2型（SCA2）
ヒトアタキシン2のポリグルタミン領域は不安定で、世代を超えて受け継がれるにつれて拡大する可能性がある。正常な対立遺伝子は通常22または23回の繰り返しを持つが、最大31回の繰り返しを含むことができる。より長い拡大は脊髄小脳失調症2型（SCA2）を引き起こす可能性がある。これは小脳、下オリーブ、橋、およびその他の領域のニューロンが変性する致命的な進行性遺伝性疾患である。SCA2の症状には、運動失調（協調運動の喪失）、パーキンソン症候群、および場合によっては認知症が含まれる。[11]この疾患対立遺伝子は通常34～52回のCAG繰り返しを含むが、32回と少ない場合や100回を超える場合もあり、次の世代に受け継がれるにつれてサイズが拡大する可能性がある。アタキシン2のポリグルタミン拡大がこれらの症状を引き起こす仕組みは不明である。
筋萎縮性側索硬化症（ALS）
2010年、ペンシルバニア大学のアーロン・ギトラーとナンシー・ボニーニの研究により、中程度のCAGリピート伸長が筋萎縮性側索硬化症（ルー・ゲーリック病）の発症リスクと有意に関連していることが発見されました。[12]
原発開放隅角緑内障（POAG）と眼圧（IOP）
ゲノムワイド関連研究により、ATXN2変異体とPOAGおよびIOPの間に有意な関連があることが明らかになりました。ATXN2とPOAGの関連の根底にある遺伝的および生物学的メカニズムのさらなる調査は、緑内障の病因と潜在的な治療標的に関する貴重な洞察をもたらす可能性があります。[13]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000204842 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000042605 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Gispert S、Twells R、Orozco G、Brice A、Weber J、Heredero L、Scheufler K、Riley B、Allotey R、Nothers C (1993 年 7 月)。「常染色体優性小脳失調症 (SCA2) の 2 番目の遺伝子座の染色体 12q23-24.1 への割り当て」。Nature Genetics。4 ( 3 ) : 295–9。doi : 10.1038/ng0793-295。PMID 8358438。S2CID 7387082。
- ^ Margolis RL、Abraham MR、Gatchell SB、Li SH、Kidwai AS、Breschel TS、Stine OC、Callahan C、McInnis MG、Ross CA (1997 年 7 月)。「ヒト脳由来の長い CAG トリヌクレオチド反復を持つ cDNA」。Human Genetics。100 ( 1 ) : 114–22。doi :10.1007/s004390050476。PMID 9225980。S2CID 25999127 。
- ^ Albrecht M, Golatta M, Wüllner U, Lengauer T (2004年8月). 「アタキシン-2およびアタキシン-3の構造および機能解析」. European Journal of Biochemistry . 271 (15): 3155–70. doi : 10.1111/j.1432-1033.2004.04245.x . PMID 15265035.
- ^ ab Jiménez-López D, Guzmán P (2014年7月). 「真核生物におけるアタキシン2タンパク質の進化とドメイン構造に関する考察」BMC Research Notes . 7 : 453. doi : 10.1186/1756-0500-7-453 . PMC 4105795 . PMID 25027299.
- ^ 「Entrez Gene: ATXN2 アタキシン 2」。
- ^ ab Orr HT (2012年4月). 「脊髄小脳失調症の細胞生物学」. The Journal of Cell Biology . 197 (2): 167–77. doi : 10.1083 /jcb.201105092. PMC 3328388. PMID 22508507.
- ^ 参考文献、遺伝学ホーム。「SCA2」。遺伝学ホーム参考文献。2018年1月11日閲覧。
- ^ Elden AC、Kim HJ、Hart MP、Chen-Plotkin AS、Johnson BS、Fang X、Armakola M、Geser F、Greene R、Lu MM、Padmanabhan A、Clay-Falcone D、McCluskey L、Elman L、Juhr D、Gruber PJ、Rüb U、Auburger G、Trojanowski JQ、Lee VM、Van Deerlin VM、Bonini NM、Gitler AD (2010 年 8 月)。「アタキシン 2 中間長ポリグルタミン伸長は ALS リスク増加と関連している」。Nature . 466 ( 7310 ) : 1069–75。Bibcode :2010Natur.466.1069E。doi : 10.1038/nature09320。PMC 2965417。PMID 20740007。
- ^ ズーカーマン R、ハリス A、ヴェルセリン AV、シエスキー B、パスカーレ LR、シウラ TA (2020 年 12 月)。 「緑内障の分子遺伝学: サブタイプと民族性の考慮事項」。遺伝子。12 (1): 55.土井: 10.3390/genes12010055。PMC 7823611。PMID 33396423。
さらに読む
- Stevanin G、Dürr A、Brice A (2000 年 1 月)。「常染色体優性小脳失調症の臨床的および分子的進歩: 遺伝子型から表現型および生理病理学まで」。European Journal of Human Genetics。8 ( 1): 4–18。doi : 10.1038/ sj.ejhg.5200403。PMID 10713882。
- Pulst SM、Nechiporuk A、Nechiporuk T、Gispert S、Chen XN、Lopes-Cendes I、Pearlman S、Starkman S、Orozco-Diaz G、Lunkes A、DeJong P、Rouleau GA、Auburger G、Korenberg JR、Figueroa C、Sahba S (1996 年 11 月)。「脊髄小脳失調症 2 型における、通常は二対立遺伝子のトリヌクレオチド反復配列の中程度の拡大」。Nature Genetics。14 ( 3 ) : 269–76。doi : 10.1038 /ng1196-269。PMID 8896555。S2CID 12365475 。
- Sanpei K, Takano H, Igarashi S, Sato T, Oyake M, Sasaki H, Wakisaka A, Tashiro K, Ishida Y, Ikeuchi T, Koide R, Saito M, Sato A, Tanaka T, Hanyu S, Takiyama Y, Nishizawa M, Shimizu N, Nomura Y, Segawa M, Iwabuchi K, Eguchi I, Tanaka H, Takahashi H, Tsuji S (1996 年 11 月)。「反復配列の直接同定とクローニング技術 (DIRECT) を使用した脊髄小脳失調症 2 型遺伝子の同定」。Nature Genetics。14 ( 3 ) : 277–84。doi :10.1038/ng1196-277。PMID 8896556。S2CID 24971010 。
- Imbert G、Saudou F、Yvert G、Devys D、Trottier Y、Garnier JM、Weber C、Mandel JL、Cancel G、Abbas N、Dürr A、Didierjean O、Stevanin G、Agid Y、Brice A (1996 年 11 月)。「脊髄小脳失調症 2 の遺伝子のクローニングにより、CAG/グルタミン反復の拡張に対して高い感受性を持つ遺伝子座が明らかになりました」。Nature Genetics。14 ( 3 ) : 285–91。doi : 10.1038/ng1196-285。PMID 8896557。S2CID 9304975。
- Sahba S、Nechiporuk A、Figueroa KP、Nechiporuk T、Pulst SM (1998 年 2 月)。「染色体 12q24.1 上の脊髄小脳失調症 2 型 (SCA2) のヒト遺伝子のゲノム構造」。Genomics。47 ( 3 ) : 359–64。doi : 10.1006 /geno.1997.5131。PMID 9480749 。
- Huynh DP、Del Bigio MR、Ho DH 、 Pulst SM (1999 年 2 月)。「正常な個人およびアルツハイマー病および脊髄小脳失調症 2 の患者の脳におけるアタキシン 2 の発現」。Annals of Neurology。45 ( 2): 232–41。doi : 10.1002/1531-8249(199902)45:2<232::AID-ANA14>3.0.CO;2-7。PMID 9989626。S2CID 18022785 。
- Huynh DP、Figueroa K、Hoang N、Pulst SM (2000 年 9 月)。「マウスやヒトにおける SCA2 の発症には 、アタキシン 2 の核局在や封入体形成は不要」。Nature Genetics 26 (1): 44–50。doi :10.1038 / 79162。PMID 10973246。S2CID 14489237 。
- Affaitati A、de Cristofaro T、Feliciello A、Varrone S (2001 年 4 月)。「脊髄小脳失調症 2 型遺伝子の選択的スプライシングの同定」。遺伝子267 ( 1): 89–93。doi : 10.1016 /S0378-1119(01)00402-4。PMID 11311558 。
- Kiehl TR、Shibata H、Vo T 、 Huynh DP、Pulst SM (2001 年 8 月)。「 A2BP1のマウス相同遺伝子の同定と発現」。哺乳類ゲノム。12 (8): 595–601。doi : 10.1007 /s00335-001-2056-4。PMID 11471052。S2CID 7340712。
- Choudhry S、Mukerji M、Srivastava AK、Jain S、Brahmachari SK (2001 年 10 月)。「SCA2 遺伝子座における CAG 反復不安定性: CAA 中断の固定と連鎖した一塩基多型」。ヒト分子 遺伝学。10 (21): 2437–46。doi : 10.1093/hmg/10.21.2437。PMID 11689490。
- Pang JT、Giunti P、Chamberlain S、An SF、Vitaliani R、Scaravilli T、Martinian L、Wood NW、Scaravilli F、Ansorge O (2002 年 3 月)。「SCA2 における神経核内封入体: 2 つの症例の遺伝学的、形態学的、免疫組織化学的研究」。Brain . 125 ( Pt 3): 656–63. doi : 10.1093/brain/awf060 . PMID 11872620。
- Satterfield TF、Jackson SM 、 Pallanck LJ (2002 年 12 月)。「ポリグルタミン病遺伝子 SCA2 のショウジョウバエ相同遺伝子は、アクチンフィラメント形成の用量感受性調節因子である」。遺伝学。162 (4): 1687–702。doi : 10.1093 / genetics /162.4.1687。PMC 1462369。PMID 12524342。
- Wiedemeyer R、Westermann F、Wittke I、Nowock J、Schwab M (2003年1 月)。「アタキシン 2 はヒト神経芽細胞腫細胞のアポトーシスを促進する」。Oncogene . 22 (3): 401–11. doi : 10.1038/sj.onc.1206150 . PMID 12545161。
- Payami H、Nutt J、Gancher S、Bird T、McNeal MG、Seltzer WK、Hussey J、Lockhart P、Gwinn-Hardy K、Singleton AA、Singleton AB、Hardy J、Farrer M (2003 年 4 月)。「SCA2 はレボドパ反応性パーキンソン病として現れる可能性がある」。運動障害 。18 ( 4 ): 425–9。doi :10.1002/mds.10375。PMID 12671950。S2CID 35401117 。
- Svetel M、Djarmati A、Dragasević N、Savić D、Culjković B、Romac S、Kostić VS (2003 年 9 月)。「若年発症型ドーパ反応性パーキンソン病における SCA2 および SCA3 変異」。European Journal of Neurology。10 ( 5 ) : 597。doi : 10.1046/j.1468-1331.2003.00671.x。PMID 12940846。S2CID 30076827 。
- ブレンネス C、ベッシュ SM、ショッケ M、ウェニング GK、ポーヴェ W (2003 年 10 月)。 「ボクセルベースの形態計測によって決定されたSCA2の萎縮パターン」。ニューロレポート。14 (14): 1799–802。土井：10.1097/00001756-200310060-00008。PMID 14534423。S2CID 26149005 。
外部リンク
- GeneReviews/NIH/NCBI/UW 脊髄小脳失調症 2 型に関するエントリー
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト ATXN2 ゲノムの位置と ATXN2 遺伝子の詳細ページ。