Loading article…
| アトラクス | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | ATRX、ATR2、JMS、MRXHF1、RAD54、RAD54L、SFM1、SHS、XH2、XNP、ZNF-HX、MRX52、アルファサラセミア/精神遅滞症候群X連鎖、クロマチンリモデラー、ATRXクロマチンリモデラー | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | OMIM : 300032; MGI : 103067;ホモロジーン: 416;ジーンカード：ATRX; OMA :ATRX - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
転写調節因子ATRXは、ATP依存性ヘリカーゼATRX、X連鎖ヘリカーゼII、またはX連鎖核タンパク質（XNP）としても知られ 、ヒトではATRX遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6] [7]
関数
転写調節因子ATRXはATPase /ヘリカーゼドメインを含み、したがってクロマチンリモデリングタンパク質のSWI/SNFファミリーに属します。ATRXは、テロメアや他のゲノムリピートでのヒストンバリアントH3.3の沈着に必要です。 [8]これらの相互作用は、これらのサイトでのサイレンシングを維持するために重要です。[9] [10] [11]
さらに、ATRXは細胞周期依存性のリン酸化を受け、核マトリックスとクロマチンの結合を制御し、有糸分裂の間期における遺伝子制御と染色体分離に関与していることを示唆している。[7]
臨床的意義
遺伝性変異
ATRX遺伝子の遺伝性変異は、X連鎖性精神遅滞（XLMR）症候群と関連しており、最も頻繁にはα-サラセミア（ATR-X ）症候群を伴う。これらの変異はDNAメチル化パターンに多様な変化を引き起こすことが示されており、これはクロマチンリモデリング、DNAメチル化、および発達過程における遺伝子発現の間の関連を提供する可能性がある。異なるアイソフォームをコードする複数の選択的スプライシング転写変異体が報告されている。女性保因者は、偏ったX染色体不活性化を示す可能性がある。[7]
体細胞変異
ATRXの獲得性変異は、膵臓神経内分泌腫瘍[12] 、神経膠腫[13] 、[14] 、 骨肉腫[15]、 軟部肉腫[16]、悪性褐色細胞腫[17 ]など、多くのヒト癌で報告されています。ATRX変異と癌におけるテロメア代替延長（ALT）表現型の間には強い相関関係があります。[12]
インタラクション
ATRXはヒストンH3.3シャペロンであるDAXXと複合体を形成する。 [18]
ATRXはEZH2と相互作用することも示されている。[19]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000085224 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031229 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Stayton CL、Dabovic B、Gulisano M、Gecz J、Broccoli V、Giovanazzi S、他 (1994 年 11 月)。「推定ヘリカーゼをコードする新しいヒト Xq13 遺伝子のクローニングと特性評価」。Human Molecular Genetics。3 ( 11): 1957– 64。doi :10.1093/ hmg /3.11.1957。PMID 7874112 。
- ^ Gibbons RJ、Suthers GK、Wilkie AO、Buckle VJ、Higgs DR (1992 年 11 月)。「X 連鎖アルファサラセミア/精神遅滞 (ATR-X) 症候群: X 染色体不活性化および連鎖解析による Xq12-q21.31 への局在」。American Journal of Human Genetics。51 ( 5 ): 1136–49。PMC 1682840。PMID 1415255 。
- ^ abc 「Entrez Gene: ATRX アルファサラセミア/精神遅滞症候群 X 連鎖 (RAD54 ホモログ、S. cerevisiae)」。
- ^ Wong LH、McGhie JD、Sim M 、 Anderson MA、Ahn S、Hannan RD、他 (2010 年 3 月)。「ATRX は多能性胚性幹細胞のテロメア構造の完全性維持において H3.3 と相互作用する」。 ゲノム研究。20 ( 3): 351– 60。doi :10.1101/ gr.101477.109。PMC 2840985。PMID 20110566。
- ^ Voon HP、Hughes JR、Rode C、De La Rosa-Velázquez IA、Jenuwein T、Feil R、他 (2015 年 4 月)。「ATRX は、間質ヘテロクロマチン遺伝子座およびインプリント遺伝子のサイレンシング維持に重要な役割を果たす」。Cell Reports . 11 (3): 405– 18. doi :10.1016/j.celrep.2015.03.036. PMC 4410944 . PMID 25865896。
- ^ Elsässer SJ、Noh KM、Diaz N、Allis CD、Banaszynski LA (2015 年 6 月)。「ヒストン H3.3 は、胚性幹細胞における内因性レトロウイルス要素サイレンシングに必要である」。Nature . 522 ( 7555 ) : 240– 4。Bibcode :2015Natur.522..240E。doi : 10.1038 /nature14345。PMC 4509593。PMID 25938714。
- ^ Udugama M、M Chang FT、Chan FL、Tang MC、Pickett HA、R McGhie JD、他 (2015 年 12 月)。「ヒストン変異体 H3.3 はテロメアにヘテロクロマチン H3 リジン 9 トリメチル化マークを提供する」。核酸研究 。43 ( 21 ) : 10227– 37。doi :10.1093/nar/gkv847。PMC 4666390。PMID 26304540。
- ^ ab Heaphy CM, de Wilde RF, Jiao Y, Klein AP, Edil BH, Shi C, et al. (2011年7月). 「ATRXおよびDAXX変異を伴う腫瘍におけるテロメアの変化」. Science . 333 (6041): 425. Bibcode :2011Sci...333..425H. doi :10.1126/science.1207313. PMC 3174141. PMID 21719641 .
- ^ Schwartzentruber J, Korshunov A, Liu XY, Jones DT, Pfaff E, Jacob K, et al. (2012年1月). 「小児神経膠芽腫におけるヒストンH3.3およびクロマチンリモデリング遺伝子のドライバー変異」. Nature . 482 (7384): 226– 31. Bibcode :2012Natur.482..226S. doi :10.1038/nature10833. PMID 22286061. S2CID 4312169.
- ^ Kannan K, Inagaki A, Silber J, Gorovets D, Zhang J, Kastenhuber ER, et al. (2012年10月). 「全エクソーム配列解析により、低悪性度神経膠腫における重要な分子決定因子としてATRX変異が特定される」。Oncotarget . 3 ( 10): 1194– 203. doi :10.18632/oncotarget.689. PMC 3717947. PMID 23104868 .
- ^ Chen X, Bahrami A, Pappo A, Easton J, Dalton J, Hedlund E, et al. (2014年4月). 「小児骨肉腫における再発性体細胞構造変異が腫瘍形成に寄与する」. Cell Reports . 7 (1): 104–12 . doi :10.1016/j.celrep.2014.03.003. PMC 4096827. PMID 24703847 .
- ^ Cancer Genome Atlas Research Network (2017年11月)。「成人軟部肉腫の包括的かつ統合的なゲノム特性評価」。Cell . 171 (4): 950–965 . doi : 10.1016/j.cell.2017.10.014 . PMID 29100075。
- ^ Comino-Méndez, I (2016年6月). 「複合悪性褐色細胞腫におけるATRXドライバー変異」. Cancer Genetics . 209 (6): 272– 7. doi :10.1016/j.cancergen.2016.04.058. PMID 27209355.
- ^ Lewis PW、Elsaesser SJ、Noh KM、Stadler SC、Allis CD (2010 年 8 月)。「Daxx は H3.3 特異的ヒストンシャペロンであり、テロメアでの複製非依存的クロマチンアセンブリにおいて ATRX と連携します」。米国 科学アカデミー紀要。107 ( 32 ): 14075– 80。Bibcode : 2010PNAS..10714075L。doi : 10.1073 / pnas.1008850107。PMC 2922592。PMID 20651253。
- ^ Cardoso C, Timsit S, Villard L, Khrestchatisky M, Fontès M, Colleaux L (1998年4月). 「XNP/ATR-X遺伝子産物とヒトEZH2タンパク質のSETドメイン間の特異的相互作用」.ヒト分子遺伝学. 7 (4): 679– 84. doi : 10.1093/hmg/7.4.679 . PMID 9499421.
さらに読む
- Mulley JC、 Kerr B、 Stevenson R 、 Lubs H (1992)。「X連鎖性精神遅滞の命名ガイドライン」。アメリカ医学遺伝学誌。43 ( 1–2 ): 383–91。doi :10.1002/ajmg.1320430159。PMID 1605216。
- Tang P、Park DJ、Marshall Graves JA、Harley VR (2004 年 9月)。「ATRX と性分化」。内分泌学と代謝の動向。15 (7): 339– 44。doi :10.1016 / j.tem.2004.07.006。PMID 15350606。S2CID 22192941 。
- Forget BG (2006 年 3 月)。「アルファサラセミアの新規および後天性形態」。Current Hematology Reports。5 ( 1): 11– 4。PMID 16537041 。
- Adès LC、Kerr B、Turner G 、 Wise G (1991 年 9 月)。「2人の兄弟における Smith-Fineman-Myers 症候群」。American Journal of Medical Genetics。40 ( 4): 467– 70。doi :10.1002/ajmg.1320400419。PMID 1684092 。
- Sutherland GR 、Gedeon AK、Haan EA、Woodroffe P、Mulley JC (1988)。「精神遅滞、小頭症、痙性両麻痺のX連鎖症候群の遺伝子（MRX2）に関する連鎖研究」。American Journal of Medical Genetics。30（1–2 ）：493–508。doi：10.1002/ajmg.1320300152。PMID 3177467 。
- Shapiro MB、Senapathy P (1987 年 9 月)。「異なるクラスの真核生物の RNA スプライスジャンクション: 配列統計と遺伝子発現における機能的意味」。核酸研究。15 (17): 7155– 74。doi :10.1093 / nar /15.17.7155。PMC 306199。PMID 3658675 。
- Gibbons RJ、Picketts DJ、Villard L、Higgs DR (1995 年 3 月)。「推定されるグローバル転写制御因子の変異が、X 連鎖性精神遅滞およびアルファサラセミア (ATR-X 症候群) を引き起こす」。Cell . 80 (6): 837– 45. doi : 10.1016/0092-8674(95)90287-2 . PMID 7697714。
- Wang LH、Collins A、Lawrence S、Keats BJ、 Morton NE (1994 年 8 月)。「遺伝子マップの統合: 染色体 X」。ゲノミクス。22 ( 3): 590– 604。doi :10.1006/geno.1994.1432。PMID 8001970 。
- Gecz J、Pollard H、Consalez G、Villard L、Stayton C、Millasseau P、Khrestchatisky M、Fontes M (1994 年 1 月)。「Xq13.3 で PGK1 に密接にリンクしている推定ヒト X 連鎖核タンパク質遺伝子のマウス相同遺伝子のクローニングと発現」。ヒト分子遺伝学。3 ( 1): 39– 44。doi :10.1093/ hmg /3.1.39。PMID 8162050。
- Villard L、Gecz J、Mattéi JF、 Fontés M、Saugier-Veber P、Munnich A、Lyonnet S (1996 年 4 月)。「Juberg-Marsidi 症候群の大家族における XNP 変異」。Nature Genetics。12 ( 4 ) : 359– 60。doi : 10.1038/ng0496-359。PMID 8630485。S2CID 33759894。
- Bonaldo MF、 Lennon G、Soares MB (1996 年 9 月)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする2つのアプローチ」。ゲノム研究。6 (9): 791– 806。doi : 10.1101/ gr.6.9.791。PMID 8889548 。
- Picketts DJ、Higgs DR、Bachoo S、Blake DJ、Quarrell OW、Gibbons RJ (1996 年 12 月)。「ATRX は SNF2 ファミリーのタンパク質の新規メンバーをコードします。変異は ATR-X 症候群の根底にある共通のメカニズムを示唆しています」。Human Molecular Genetics。5 ( 12 ) : 1899– 907。doi : 10.1093/hmg/5.12.1899。PMID 8968741。
- Villard L、Lacombe D、 Fontés M (1997)。「XNP遺伝子の点変異は、α-サラセミアを伴わないATR-X表現型と関連している」。European Journal of Human Genetics。4 ( 6): 316– 20。doi :10.1159/000472225。PMID 9043863。S2CID 43618843 。
- Villard L、Lossi AM、Cardoso C、Proud V、Chiaroni P、Colleaux L、Schwartz C、Fontés M (1997 年 7 月)。「潜在的なジンクフィンガーヘリカーゼをコードする XNP/ATRX 遺伝子のゲノム構造の決定」。Genomics . 43 ( 2): 149– 55. doi :10.1006/geno.1997.4793. PMID 9244431。
- Golub EI、Kovalenko OV、Gupta RC、 Ward DC、 Radding CM (1997 年 10 月)。「ヒト組換えタンパク質 Rad51 と Rad54 の相互作用」。核酸研究。25 ( 20): 4106–10。doi :10.1093/ nar /25.20.4106。PMC 147015。PMID 9321665。
- Gibbons RJ、Bachoo S、Picketts DJ、Aftimos S、Asenbauer B、Bergoffen J、Berry SA、Dahl N、Fryer A、Keppler K、Kurosawa K、Levin ML、Masuno M、Neri G、Pierpont ME、Slaney SF、Higgs DR (1997 年 10 月)。「転写調節因子 ATRX の変異により PHD 様ドメインの機能的重要性が明らかに」。Nature Genetics。17 ( 2 ) : 146– 8。doi : 10.1038 /ng1097-146。PMID 9326931。S2CID 12470300。
- Cardoso C、Timsit S、Villard L、Khrestchatisky M、Fontès M、Colleaux L (1998 年 4 月)。「XNP/ATR-X 遺伝子産物とヒト EZH2 タンパク質の SET ドメイン間の特異的相互作用」。 ヒト分子遺伝学。7 (4 ) : 679– 84。doi : 10.1093/ hmg /7.4.679。PMID 9499421。
- Bérubé NG、Mangelsdorf M、Jagla M、Vanderluit J、Garrick D、Gibbons RJ、Higgs DR、Slack RS、Picketts DJ (2005 年 2 月)。「クロマチンリモデリングタンパク質 ATRX は、皮質形成中の神経細胞の生存に重要です」。The Journal of Clinical Investigation。115 ( 2 ): 258– 67。doi :10.1172/JCI22329。PMC 544602。PMID 15668733。
外部リンク
- GeneReviews/NCBI/NIH/UW のアルファサラセミア X 連鎖性精神遅滞症候群、ATRX 症候群、アルファサラセミア/精神遅滞、X 連鎖性、XLMR 低緊張性顔面症候群に関するエントリ
- アルファサラセミアX連鎖性精神遅滞症候群に関するOMIMのエントリ
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト ATRX ゲノムの位置と ATRX 遺伝子の詳細ページ。
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト RAD54L ゲノムの位置と RAD54L 遺伝子の詳細ページ。