ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ATP5PF |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ATP5PF、ATP5、ATP5A、ATPM、CF6、F6、ATP合成酵素、H+輸送、ミトコンドリアFo複合体サブユニットF6、ATP合成酵素末梢茎サブユニットF6、ATP5J |
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| 外部ID | オミム:603152; MGI : 107777;ホモロジーン: 1272;ジーンカード:ATP5PF; OMA :ATP5PF - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 16番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 16|16 C3.3 | 始める | 84,624,754 bp [2] |
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| 終わり | 84,632,513 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 左心室の心筋
- 右心室
- 脈絡叢上皮
- 右心房の心筋組織
- 上腕二頭筋
- 腹直筋の骨格筋組織
- 舌の体
- 大静脈
- 上腕二頭筋の骨格筋組織
- 外側広筋
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| | トップの表現 | - 右腎臓
- 二腹筋
- 球形嚢
- 心室の心筋
- 胸郭横隔膜
- 房室弁
- 心筋
- 顔面運動核
- 上腕三頭筋
- 太ももの筋肉
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- トランスポーター活性
- プロトン膜輸送活性
- 膜貫通輸送体の活性
- ATPase活性
- タンパク質含有複合体結合
| | 細胞成分 |
- ミトコンドリアプロトン輸送ATP合成酵素複合体、結合因子F(o)
- プロトン輸送ATP合成酵素複合体、結合因子F(o)
- 膜
- ミトコンドリアプロトン輸送ATP合成酵素複合体
- ミトコンドリア内膜
- ミトコンドリア
- 細胞外空間
- 細胞表面
| | 生物学的プロセス |
- ATP合成とプロトン輸送の連動
- イオン輸送
- 黒質の発達
- ATP代謝プロセス
- ミトコンドリアATP合成とプロトン輸送の結合
- ATP生合成プロセス
- クリステ形成
- 輸送
- 心拍数の積極的な調節
- 筋肉の活動に対する反応
- プロスタグランジン分泌の抑制
- 血圧の積極的な調節
- アラキドン酸分泌の抑制
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001003696 NM_001003697 NM_001003701 NM_001003703 NM_001685
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NM_001320266 NM_001320267 |
| NM_016755 NM_001302213 NM_001302214 NM_001302215 NM_001302216
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NM_001358499 NM_001358500 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001003696 NP_001003697 NP_001003701 NP_001003703 NP_001307195
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NP_001307196 NP_001676 |
| NP_001289142 NP_001289143 NP_001289144 NP_001289145 NP_058035
|
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NP_001345428 NP_001345429 |
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| 場所 (UCSC) | 21章: 25.72 – 25.74 Mb | 16 章: 84.62 – 84.63 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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タンパク質ファミリー
| ミトコンドリアATP合成酵素カップリング因子6(F6) |
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 ウシ心臓ミトコンドリアのATP合成酵素の末梢茎領域からのサブユニットF6の溶液構造 |
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| シンボル | ATP-シント_F6 |
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| パム | PF05511 |
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| インタープロ | 著作権 |
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ミトコンドリアATP合成酵素結合因子6は、ヒトではATP5PF遺伝子によってコードされる酵素 サブユニットである。[5] [6] [7]
関数
ミトコンドリアATP合成酵素は、酸化リン酸化中に内膜を横切る電気化学的プロトン勾配を利用してATP合成を触媒する。この酵素は、可溶性触媒コアであるF 1と、プロトンチャネルを構成する膜貫通成分であるF Oの2つの連結した多サブユニット複合体から構成される。F 1複合体は、3つのアルファ、3つのベータ、および他の3つの代表1つの比率で組み立てられた5つの異なるサブユニット(アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ、イプシロン)で構成される。F Oは、9つのサブユニット(a、b、c、d、e、f、g、F6、8)を持つと思われる。この遺伝子は、F 1とF O の相互作用に必要な、F O複合体のF6サブユニットをコードしている。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが同定されている。[7]
F6サブユニットは、F 1複合体とF O複合体を連結する周辺柄の一部で、特定のサブユニットが中央の回転要素と一緒に回転するのを防ぐ固定子として機能します。周辺柄は、ミトコンドリア、葉緑体、細菌の F-ATPase間でサブユニット構成が異なります。ミトコンドリアでは、周辺柄はサブユニットOSCP(オリゴマイシン感受性付与タンパク質)、F6、b、dの各コピーで構成されています。 [8]細菌または葉緑体F-ATPaseにはサブユニットF6の相同体は存在せず、その周辺柄は細菌ではデルタサブユニット(OSCPに相同)の1コピーとサブユニットbの2コピーで構成され、葉緑体と光合成 細菌ではサブユニットbとb'の各コピーで構成されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000154723 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022890 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Higuti T、鶴見C、川村Y、辻田H、大阪F、吉原Y、谷I、田中K、市原A (1991年7月)。 「ミトコンドリアにおけるH(+)-ATPシンターゼのヒトカップリングファクター6のインポート前駆体のcDNAの分子クローニング」。生化学および生物物理学研究コミュニケーション。178 (2): 793–9 .土井:10.1016/0006-291X(91)90178-A。PMID 1830479。
- ^ Javed AA、Ogata K、Sanadi DR(1991年1月)。「ヒトミトコンドリアATP合成酵素:結合因子6の核コード化前駆体のcDNAのクローニング」。遺伝子。97(2):307-10。doi : 10.1016 / 0378-1119 ( 91)90068-M。PMID 1825642 。
- ^ ab "Entrez Gene: ATP5PF ATP合成酵素末梢茎サブユニットF6".
- ^ Carbajo RJ、Kellas FA、Runswick MJ、Montgomery MG、Walker JE、Neuhaus D (2005 年 8 月)。「ウシ F1Fo-ATPase の固定子の F1 結合ドメインの構造とアルファサブユニットへの結合方法」。Journal of Molecular Biology。351 ( 4): 824– 38。doi :10.1016/ j.jmb.2005.06.012。PMID 16045926 。
外部リンク
さらに読む
- Kinosita K, Yasuda R, Noji H (2003). 「F1-ATPase: 非常に効率的な回転式 ATP マシン」.生化学エッセイ. 35 : 3–18 . doi :10.1042/bse0350003. PMID 12471886.
- Oster G、Wang H (2003年3 月)。「回転タンパク質モーター」。細胞生物学の動向。13 (3): 114– 21。doi :10.1016/S0962-8924(03)00004-7。PMID 12628343 。
- Leyva JA、 Bianchet MA、 Amzel LM (2003)。「ATP合成の理解:F1-ATPaseの構造とメカニズム(レビュー)」。 分子膜生物学。20 (1):27–33。doi:10.1080 / 0968768031000066532。PMID 12745923。S2CID 218895820 。
- Hochstrasser DF、Frutiger S、Paquet N、Bairoch A、Ravier F、Pasquali C、Sanchez JC、Tissot JD、Bjellqvist B、Vargas R (1992 年 12 月)。「ヒト肝臓タンパク質マップ: マイクロシーケンシングとゲル比較によって確立された参照データベース」。電気泳動。13 ( 12 ): 992– 1001。doi :10.1002/elps.11501301201。PMID 1286669。S2CID 23518983 。
- Yan WL、Lerner TJ、Haines JL、Gusella JF (1994 年 11 月)。「新規ヒトミトコンドリア ATP 合成酵素サブユニット 9 cDNA (ATP5G3) の配列分析とマッピング」。Genomics . 24 ( 2): 375– 7. doi :10.1006/geno.1994.1631. PMID 7698763。
- Elston T、Wang H、Oster G (1998 年 1 月)。「ATP 合成酵素におけるエネルギー変換」。Nature . 391 ( 6666 ) : 510– 3。Bibcode :1998Natur.391..510E。doi :10.1038/35185。PMID 9461222。S2CID 4406161 。
- Webster KA、 Oliver NA、Wallace DC (1982 年 3 月)。「ヒト染色体10へのオリゴマイシン耐性遺伝子座の割り当て」。体細胞遺伝学。8 ( 2 ): 223– 44。doi :10.1007/BF01538679。PMID 9732751。S2CID 12445064 。
- Wang H, Oster G (1998 年 11 月). 「ATP 合成酵素の F1 モーターにおけるエネルギー変換」. Nature . 396 (6708): 279– 82. Bibcode :1998Natur.396..279W. doi :10.1038/24409. PMID 9834036. S2CID 4424498.
- ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターヘフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B 、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001 年 3 月)。 「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム研究。11 (3): 422–35 .土井:10.1101/gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
- 小山内 哲史、中村 正人、佐々木 晋也、富田 裕人、斉藤 正樹、大沢 裕人、山部 裕也、村上 秀樹、孫田 和也、奥村 和也 (2003 年 12 月)。 「末期腎疾患患者におけるカップリング因子6の血漿濃度と心血管イベント」。キドニー・インターナショナル。64 (6): 2291–7 .土井: 10.1046/j.1523-1755.2003.00334.x。PMID 14633154。
- Cross RL (2004 年 1 月). 「分子モーター: ATP モーターの転換」. Nature . 427 (6973): 407–8 . Bibcode :2004Natur.427..407C. doi : 10.1038/427407b . PMID 14749816. S2CID 52819856.
- ジェイコブス LJ、デ・クー IF、ナイランド JG、ガルジャール RJ、ロス FJ、スーンダーウール K、ニールマイヤー MF、ゲラーツ JP、ショルテ HR、スミーツ HJ (2005 年 3 月)。 「T9176C ミトコンドリア DNA 変異の伝播と出生前診断」。分子的人間の生殖。11 (3): 223– 8. CiteSeerX 10.1.1.603.8165。土井:10.1093/molehr/gah152。PMID 15709156。
この記事にはパブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR008387からのテキストが組み込まれています。