アポリポタンパク質CI

利用可能なタンパク質構造：
PDB	IPR006781 PF04691 ( ECOD ; PDBsum )
アルファフォールド	IPR006781; PF04691;

ApoC-I
ApoC-I
	ヒヒ（Papio sp.）血漿タンパク質であるコレステリルエステル転移酵素阻害物質の構造研究。
識別子
シンボル	ApoC-I
Pfam	PF04691
インタープロ	IPR006781
SCOP2	1ale / SCOPe / SUPFAM
PDB
利用可能なタンパク質構造：
PDB	IPR006781 PF04691 ( ECOD ; PDBsum )
アルファフォールド	IPR006781; PF04691;

APOC1
利用可能な構造物
PDB	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコード一覧
	1ALE、1ALF、1IOJ、1OPP
識別子
別名	APOC1、Apo-CI、ApoC-I、apo-CIB、apoC-IB、アポリポタンパク質C1、アポリポタンパク質CI
外部ID	オミム: 107710 ; MGI : 88053 ;ホモロジーン: 136749 ;ジーンカード: APOC1 ; OMA : APOC1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クリスチャン	染色体19（ヒト）
終わり	44,919,349 bp
遺伝子の位置（マウス）
クリスチャン	染色体7（マウス）
終わり	19,426,585 bp
RNA発現パターン
	トップは
	肝臓の右葉; 左副腎皮質; 右副腎皮質; 側坐核; 被殻; 尾状核; 右肺; 脾臓; 黒質; 視床下部;
	トップは
	肝臓の左葉; 胆嚢; リップ; 胚盤胞; 褐色脂肪組織; 外耳の皮膚; 卵黄嚢; 膀胱の移行上皮; 食道; 大動脈の外膜;
	より多くの参照発現データ
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	ホスホリパーゼ阻害活性; リパーゼ阻害活性; ホスファチジルコリン結合; 脂肪酸結合; ホスファチジルコリンステロールO-アシル転移酵素活性化活性;
細胞成分	カイロミクロン; 超低密度リポタンパク質粒子; 小胞体; 高密度リポタンパク質粒子; 細胞外領域;
生物学的プロセス	脂質輸送; カイロミクロン残渣の除去; 脂肪酸生合成プロセスの負の制御; 脂質代謝; コレステロールエステル化の正の調節; リン脂質の流出; コレステロール代謝プロセス; ホスファチジルコリン異化プロセスの負の制御; 血漿リポタンパク質粒子のリモデリング; 超低密度リポタンパク質粒子クリアランスの負の調節; コレステロール輸送の調節; 受容体介在性エンドサイトーシスの負の制御; 高密度リポタンパク質粒子リモデリング; コレステロールの排出; コレステロール輸送の負の調節; リポタンパク質リパーゼ活性の負の制御; 超低密度リポタンパク質粒子集合体; 脂質異化プロセスの負の制御; トリグリセリド代謝プロセス; 脂質代謝プロセスの負の制御; 触媒活性の正の調節; 超低密度リポタンパク質粒子クリアランス; リポタンパク質の代謝プロセス;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	341
	11812
	ENSG00000130208
	ENSMUSG00000040564
	P02654
	P34928
	NM_001645 NM_001321065 NM_001321066 NM_001379687
	NM_001110009 NM_007469
	NP_001307994 NP_001307995 NP_001636 NP_001366616
	NP_001103479 NP_031495
	ウィキデータ
人間を表示/編集	マウスの表示/編集

アポリポタンパク質CIはリポタンパク質のタンパク質成分であり、ヒトではAPOC1遺伝子によってコードされている。^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、アポリポタンパク質Cファミリーの一員である。この遺伝子は主に肝臓で発現し、単球がマクロファージに分化する際に活性化される。この遺伝子には選択的スプライシング転写バリアントが見つかっているが、一部のバリアントの生物学的妥当性はまだ確認されていない。^{[ 7 ]}

アポリポタンパク質CIは、通常血漿中に存在し、57個のアミノ酸からなるタンパク質で、エステル化レシチンコレステロールの活性化に関与し、リポタンパク質間のエステル化コレステロールの交換や組織からのコレステロール除去において重要な役割を果たします。その主な機能は、おそらくHDL分子の電荷を変化させることによって、コレステリルエステル転送タンパク質（CETP）を阻害することです。

絶食中は（他のアポリポタンパク質Cと同様に）主に HDL中に存在し、食後は他のリポタンパク質の表面に存在する。カイロミクロンやVLDLなどのトリグリセリドを豊富に含むタンパク質が分解されると、このアポリポタンパク質は再びHDLに移行する。これは人体で最も正電荷を帯びたタンパク質の1つである。

偽遺伝子

この遺伝子の偽遺伝子は、染色体19上のapoC-I遺伝子から4kb下流に同じ向きで存在し、両方ともアポリポタンパク質遺伝子クラスター内に位置している。この偽遺伝子は、デニソワ人やネアンデルタール人にも存在していたと報告されており、2つの異なる事象に由来する。新世界ザルがヒトの系統から分岐した後、apoC-I遺伝子が重複した。旧世界ザルとヒト以外の大型類人猿は、2つの活性遺伝子を持つことが示されている。重複した遺伝子の1つは、ヒトのアポリポタンパク質CIに相同な、apoC-IBと呼ばれる塩基性タンパク質をコードしている。もう1つは、偽遺伝子によってコードされる仮想タンパク質に相同な、apoC-IAと呼ばれる酸性タンパク質をコードしている。偽遺伝子化事象は、ボノボとチンパンジーがヒトの系統から分岐してから、デニソワ人とネアンデルタール人が出現するまでの間に起こった。偽遺伝子は、シグナル配列の最後から2番目のアミノ酸、すなわちグルタミンのコドンの単一ヌクレオチドの変化によって生じ、その結果、終止コドンが生じる。^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

インタラクティブな経路マップ

以下の遺伝子、タンパク質、代謝物をクリックすると、それぞれの記事にリンクします。^{[ §1 ]}

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スタチン経路編集

↑インタラクティブな経路マップはWikiPathwaysの「Statin_Pathway_WP430」で編集できます。

参考文献

1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000130208 – Ensembl、2017年5月
1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000040564 – Ensembl、2017年5月
↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
↑ Tata F、Henry I、Markham AF、Wallis SC、Weil D、Grzeschik KH、et al. (1985) 。「ヒトアポリポタンパク質CIのcDNAクローンの単離と特性評価、および遺伝子の19番染色体への割り当て」。Human Genetics。69 ( 4): 345–9。doi : 10.1007 / BF00291654。PMID 2985493。S2CID 32767041。
↑スミット M、ファン・デル・コーイ・メイス E、フランツ RR、ハヴェケス L、クラセン EC (1988 年 1 月)。「染色体 19 上のアポリポタンパク質遺伝子クラスター。III 型高リポタンパク質血症に関連する APOC2 遺伝子と多型 Hpa I 部位の明確な局在」。人間の遺伝学。78 (1): 90– 3.土井: 10.1007/BF00291243。PMID 2892779。S2CID 22711986。
↑ 「Entrez Gene: APOC1 アポリポタンパク質 CI」。
↑ Puppione DL、Ryan CM、Bassilian S、Souda P、Xiao X、Ryder OA、Whitelegge JP (2010年3月)。「大型類人猿における2つの異なるアポC-I型の検出」。Comparative Biochemistry and Physiology. Part D, Genomics & Proteomics . 5 (1): 73–9 . doi : 10.1016/j.cbd.2009.12.003 . PMC 2830554 . PMID 20209111 .
↑ Puppione D、Whitelegge JP (2013年10月)。「進化中の霊長類apoC-Iの変化に関するプロテオゲノムレビュー」。Frontiers in Biology。8 ( 5 ): 533–548。doi : 10.1007/s11515-013-1278-7。PMC 5528196。PMID 28757862。
↑ Puppione DL (2014年9月)「高等霊長類は、新世界ザルとは異なり、apoC-I遺伝子を挟むエンハンサーの重複セットを持つ」Comparative Biochemistry and Physiology. Part D, Genomics & Proteomics . 11 : 45–8 . doi : 10.1016/j.cbd.2014.08.001 . PMID 25160599 .

さらに読む

Shulman RS、Herbert PN、Wehrly K、Fredrickson DS (1975 年 1 月) 「ヒト超低密度リポタンパク質由来のアポリポタンパク質 CI (apoLp-Ser) の完全アミノ酸配列」 The Journal of Biological Chemistry . 250 (1): 182–90 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)41998-4 . PMID 166984 .
Lauer SJ、Walker D、Elshourbagy NA、Reardon CA、Levy-Wilson B、Taylor JM (1988 年 5 月)。「ヒトのアポリポタンパク質 CI 遺伝子の 2つのコピーは、アポリポタンパク質 E 遺伝子と密接に連鎖している」。The Journal of Biological Chemistry。263 (15): 7277–86。doi: 10.1016 / S0021-9258(18)68638-7。PMID 2835369。
Smit M、van der Kooij-Meijs E、Woudt LP、Havekes LM、Frants RR (1988 年 5 月)。「APOC1 遺伝子のプロモーター領域における家族性βリポタンパク血症関連 HpaI 制限酵素部位の正確な局在」。Biochemical and Biophysical Research Communications。152 ( 3 ) : 1282–8。doi : 10.1016/S0006-291X(88)80424-8。PMID 2897845。
Davison PJ、Norton P、Wallis SC、Gill L、Cook M、Williamson R、Humphries SE（1986年5月）。「ヒトアポリポタンパク質CI（apo CI）の遺伝子配列は19番染色体上に2つあり、そのうちの1つはapo Eの遺伝子から4kb離れている」。Biochemical and Biophysical Research Communications。136（3）：876–84。doi：10.1016/0006-291X(86 ) 90414-6。PMID 3013172。
Myklebost O、Rogne S（1986年8月）。「ヒトアポリポタンパク質CI遺伝子は、19番染色体上のアポリポタンパク質E遺伝子から4.3キロベース離れた位置にある」。Human Genetics。73（4 ）：286–9。doi：10.1007 / BF00279087。PMID 3017837。S2CID 11662593。
Jackson RL、Sparrow JT、Baker HN、Morrisett JD、Taunton OD、Gotto AM (1974年8月) 「アポロタンパク質-セリンの一次構造」 The Journal of Biological Chemistry . 249 (16): 5308–13 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)42365-X . PMID 4369340 .
Knott TJ、Robertson ME、Priestley LM、Urdea M、Wallis S、Scott J (1984 年 5 月)。「ヒトアポリポタンパク質 CI の前駆体をコードする mRNA の特性解析」。Nucleic Acids Research。12 ( 9 ) : 3909–15。doi : 10.1093/nar/12.9.3909。PMC 318798。PMID 6328444。
Servillo L 、 Brewer HB、Osborne JC（1981年2月）。「アポリポタンパク質A-IIとCI平衡沈降の混合相互作用の評価」。Biophysical Chemistry。13 （1）：29–38。doi：10.1016/0301-4622（81）80022-1。PMID 6789904。
Curry MD、McConathy WJ、Fesmire JD、Alaupovic P (1981年4月) 「ヒト血漿中のアポリポタンパク質CIおよびC-IIの個別電気免疫測定法による定量的測定」 . Clinical Chemistry . 27 (4): 543–8 . doi : 10.1093/clinchem/27.4.543 . PMID 7471419 .
Rozek A、Buchko GW、Cushley RJ (1995年6月)「CDおよびNMR分光法による、ドデシル硫酸ナトリウム存在下におけるヒトアポリポタンパク質CI残基7-24および35-53に対応する2つのペプチドの立体構造」Biochemistry.34 ( 22 ) : 7401–8.doi : 10.1021 / bi00022a013.PMID 7779782 .
丸山和也、菅野茂（1994年1月）「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便な方法」Gene.138 （ 1–2 ）：171–4 . doi：10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Trask B、Fertitta A、Christensen M、Youngblom J、Bergmann A、Copeland A、et al. (1993 年 1 月) 「ヒト 19 番染色体の蛍光 in situ ハイブリダイゼーションマッピング: 540 個のコスミドと 70 個の遺伝子または DNA マーカーの細胞遺伝学的バンド位置」 . Genomics . 15 (1): 133–45 . doi : 10.1006/geno.1993.1021 . PMID 8432525 .
Kamino K, Yoshiiwa A, Nishiwaki Y, Nagano K, Yamamoto H, Kobayashi T, et al. (1996). "アルツハイマー型認知症とAPOE/C1/C2遺伝子クラスターとの遺伝子関連研究". Gerontology . 42 (Suppl 1): 12–9 . doi : 10.1159/000213820 . PMID 8804993 .
Rozek A、Buchko GW、Kanda P、Cushley RJ (1997年9月) 「CDおよび1H NMR分光法によるヒトアポリポタンパク質CIのN末端脂質結合ドメインの立体構造研究」 Protein Science . 6 (9): 1858–68 . doi : 10.1002/pro.5560060906 . PMC 2143781. PMID 9300485 .
鈴木裕、中川義友健、丸山健、須山昭、菅野聡 (1997 年 10 月) 「全長濃縮 cDNA ライブラリーおよび 5' 末端濃縮 cDNA ライブラリーの構築と特性解析」Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Halushka MK、Fan JB、Bentley K、Hsie L、Shen N、Weder A、et al. (1999年7月)「血圧恒常性に関わる候補遺伝子における一塩基多型のパターン」Nature Genetics . 22 (3): 239–47 . doi : 10.1038/10297 . PMID 10391210. S2CID 4636523 .
Freitas EM、Zhang WJ、Lalonde JP、Tay GK、Gaudieri S、Ashworth LKら（1999）。「APO E-C2遺伝子クラスターの42kbの配列決定により、新しい遺伝子PEREC1が明らかになった」。DNA Sequence。9 （ 2 ）： 89–100。doi ： 10.3109 / 10425179809086433。PMID 10520737。
Gautier T、Masson D、de Barros JP、Athias A、Gambert P、Aunis D、et al. (2000 年 12 月) 「ヒトアポリポタンパク質 CI は、血漿高密度リポタンパク質がコレステリルエステル転送タンパク質の活性を阻害する能力を説明する」 The Journal of Biological Chemistry . 275 (48): 37504–9 . doi : 10.1074/jbc.M007210200 . PMID 10978346 .
Hartley JL、Temple GF、Brasch MA（2000年11月）。「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」。Genome Research。10（11 ）：1788–95。doi：10.1101/ gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863。

外部リンク

UCSCゲノムブラウザにあるヒトAPOC1ゲノムの位置とAPOC1遺伝子の詳細ページ。
PDBe-KBは、ヒトアポリポタンパク質CIのPDBに登録されているすべての構造情報の概要を提供します。

[WikiPathways-11] インタラクティブな経路マップはWikiPathwaysの「Statin_Pathway_WP430」で編集できます。

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000130208 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000040564 – Ensembl、2017年5月

[3] 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid2985493-5] Tata F、Henry I、Markham AF、Wallis SC、Weil D、Grzeschik KH、et al. (1985) 。「ヒトアポリポタンパク質CIのcDNAクローンの単離と特性評価、および遺伝子の19番染色体への割り当て」。Human Genetics。69 ( 4): 345–9。doi : 10.1007 / BF00291654。PMID 2985493。S2CID 32767041。

[pmid2892779-6] スミット M、ファン・デル・コーイ・メイス E、フランツ RR、ハヴェケス L、クラセン EC (1988 年 1 月)。「染色体 19 上のアポリポタンパク質遺伝子クラスター。III 型高リポタンパク質血症に関連する APOC2 遺伝子と多型 Hpa I 部位の明確な局在」。人間の遺伝学。78 (1): 90– 3.土井: 10.1007/BF00291243。PMID 2892779。S2CID 22711986。

[entrez-7] 「Entrez Gene: APOC1 アポリポタンパク質 CI」。

[pmid20209111-8] Puppione DL、Ryan CM、Bassilian S、Souda P、Xiao X、Ryder OA、Whitelegge JP (2010年3月)。「大型類人猿における2つの異なるアポC-I型の検出」。Comparative Biochemistry and Physiology. Part D, Genomics & Proteomics . 5 (1): 73–9 . doi : 10.1016/j.cbd.2009.12.003 . PMC 2830554 . PMID 20209111 .

[pmid28757862-9] Puppione D、Whitelegge JP (2013年10月)。「進化中の霊長類apoC-Iの変化に関するプロテオゲノムレビュー」。Frontiers in Biology。8 ( 5 ): 533–548。doi : 10.1007/s11515-013-1278-7。PMC 5528196。PMID 28757862。

[pmid25160599-10] Puppione DL (2014年9月)「高等霊長類は、新世界ザルとは異なり、apoC-I遺伝子を挟むエンハンサーの重複セットを持つ」Comparative Biochemistry and Physiology. Part D, Genomics & Proteomics . 11 : 45–8 . doi : 10.1016/j.cbd.2014.08.001 . PMID 25160599 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ §1 ]