アダRB1

アダRB1
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1ZY7、5ED1、5ED2、5HP3、5HP2
識別子
エイリアス	ADARB1、ADAR2、DRABA2、DRADA2、RED1、アデノシンデアミナーゼ、RNA 特異的 B1、アデノシンデアミナーゼ RNA 特異的 B1、NEDHYMS
外部ID	オミム：601218; MGI : 891999;ホモロジーン: 8280;ジーンカード：ADARB1; OMA :ADARB1 - オルソログ
EC番号	3.5.4.37
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体21（ヒト）
終わり	45,226,560 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体10（マウス）
終わり	77,254,104 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	脛骨動脈; ; 胃粘膜; ; 右冠動脈; ; 小脳虫部; ; 伏在静脈; ; 視床の外側核群; ; 胸部大動脈下行; ; 上行大動脈; ; アキレス腱; ; 左冠動脈;
	トップの表現
	内側背核; ; 内側膝状体; ; 外側膝状体; ; 下丘; ; 小脳皮質; ; 延髄; ; 分界条核; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 橋核; ; 視覚野;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	金属イオン結合; アデノシンデアミナーゼ活性; タンパク質結合; RNA結合; 二本鎖RNA結合; mRNA結合; 加水分解酵素活性; 二本鎖RNAアデノシンデアミナーゼ活性; tRNA特異的アデノシンデアミナーゼ活性;
細胞成分	核質; 核小体; 核; 細胞質; 細胞質;
生物学的プロセス	RNA処理; 免疫システムのプロセス; mRNA処理; 基底変換または置換編集; 細胞周期の調節; 細胞移動の負の調節; ウイルスに対する防御反応; タンパク質リン酸化の調節によるタンパク質キナーゼ活性の負の調節; ウイルスゲノム複製の正の制御; 先天性免疫反応; アデノシンからイノシンへの編集; 細胞集団増殖の負の調節; 神経筋シナプス伝達; 顔面神経の形態形成; 舌下神経の形態形成; 脊髄腹側交連の形態形成; 多細胞生物の成長; 姿勢を制御する神経筋プロセス; 神経支配; 筋組織の形態形成; 運動行動; 運動ニューロンのアポトーシス過程;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	104
	110532
	ENSG00000197381
	ENSMUSG00000020262
	P78563
	Q91ZS8
NM_001033049 ; NM_001112 ; NM_001160230 ; NM_015833 ; NM_015834;
	NM_001346687 ; NM_001346688
	NM_001024837 ; NM_001024838 ; NM_001024839 ; NM_001024840 ; NM_130895
NP_001103 ; NP_001153702 ; NP_001333616 ; NP_001333617 ; NP_056648;
	NP_056649
	NP_001020008 ; NP_570965 ; NP_001020009
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

二本鎖RNA特異的エディターゼ1は、ヒトではADARB1遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]^{[7]この酵素は}ADARファミリーのメンバーである。

関数

この遺伝子は、アデノシンの部位特異的脱アミノ化によるグルタミン酸受容体サブユニットBのpremRNA編集を担う酵素をコードする。ラットの研究では、この酵素が自身のpremRNA分子に作用してAA ジヌクレオチドをAIジヌクレオチドに変換し、新しいスプライス部位を形成することがわかった。この遺伝子の選択的スプライシングにより、いくつかの転写バリアントが生じ、そのいくつかは Aluカセット挿入の有無と短いまたは長いC末端領域によって特徴付けられる。^[7]

ADARB1が適切に機能するには、小分子イノシトールヘキサキスリン酸（IP _{6 ）が必要です。}^[8] ADARB1は、主にタンパク質コード基質に作用するA-to-I RNA編集酵素です。^[9]

参照

アデノシンデアミナーゼ（ADA）は、単離されたアデノシンに作用する酵素である。

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000197381 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020262 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Mittaz L、Scott HS、Rossier C、Seeburg PH、Higuchi M、Antonarakis SE (1997 年 4 月)。「染色体 21q22.3 にマップされるグルタミン酸受容体のヒト RNA 編集脱アミノ酵素 (ADARB1) のクローニング」。Genomics . 41 ( 2): 210–7. doi :10.1006/geno.1997.4655. PMID 9143496。
^ Keegan LP、Leroy A、Sproul D 、 O'Connell MA (2004 年 2 月)。「RNA に作用するアデノシンデアミナーゼ (ADAR): RNA 編集酵素」。ゲノム生物学。5 (2): 209。doi : 10.1186/ gb - 2004-5-2-209。PMC 395743。PMID 14759252。
^ ab 「Entrez Gene: ADARB1 アデノシンデアミナーゼ、RNA 特異的、B1 (RED1 ホモログラット)」。
^ Macbeth MR、Schubert HL、Vandemark AP、Lingam AT、Hill CP、Bass BL (2005 年 9 月)。「イノシトールヘキサキスリン酸は ADAR2 コアに結合し、RNA 編集に必要」。Science。309 ( 5740 ) : 1534–9。Bibcode : 2005Sci ...309.1534M。doi : 10.1126/ science.11 13150。PMC 1850959。PMID 16141067。
^ Licht K、Jantsch MF（2016年4月）。「 RNA編集とRNA修飾による迅速かつ動的なトランスクリプトーム制御」。The Journal of Cell Biology。213（1）：15–22。doi ： 10.1083 / jcb.201511041。PMC 4828693。PMID 27044895 。

さらに読む

Valenzuela A、Blanco J、Callebaut C、Jacotot E、Lluis C、Hovanessian AG、Franco R (1997)。「HIV-1 エンベロープ gp120 とウイルス粒子がアデノシンデアミナーゼのヒト CD26 への結合をブロック」。免疫機能と疾患における細胞ペプチダーゼ。実験医学と生物学の進歩。第 421 巻。pp. 185–92。doi : 10.1007/978-1-4757-9613-1_24。ISBN 978-1-4757-9615-5. PMID 9330696。
Melcher T 、Maas S、Herb A、 Sprengel R、Seeburg PH、Higuchi M (1996 年 2 月)。「哺乳類の RNA 編集酵素」。Nature . 379 ( 6564) : 460–4。Bibcode :1996Natur.379..460M。doi :10.1038/379460a0。PMID 8559253。S2CID 4326456。
O'Connell MA、Gerber A、Keller W (1997 年 1 月)。「脳グルタミン酸受容体 B プレ mRNA の編集に関与するヒト二本鎖 RNA 特異的エディターゼ 1 (hRED1) の精製」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 1): 473–8。doi : 10.1074 / jbc.272.1.473。PMID 8995285。
Valenzuela A、Blanco J、Callebaut C、Jacotot E、Lluis C、Hovanessian AG、Franco R (1997 年 4 月)。「ヒト CD26 へのアデノシンデアミナーゼの結合は、HIV-1 エンベロープ糖タンパク質 gp120 およびウイルス粒子によって阻害される」。Journal of Immunology。158 ( 8 ): 3721–9。doi : 10.4049 /jimmunol.158.8.3721。PMID 9103436。
Lai F、Chen CX 、 Carter KC、Nishikura K (1997 年 5 月)。「4 つの選択的スプライシングを受けた DRADA2 二本鎖 RNA アデノシンデアミナーゼによるグルタミン酸受容体 B サブユニットイオンチャネル RNA の編集」。分子細胞生物学。17 (5): 2413–24。doi :10.1128 / MCB.17.5.2413。PMC 232090。PMID 9111310。
Yang JH、Sklar P、Axel R、Maniatis T (1997 年 4 月)。「グルタミン酸受容体 B プレ mRNA 編集のためのヒト RNA アデノシンデアミナーゼの精製と特性評価」。米国科学アカデミー紀要。94 (9): 4354–9。Bibcode : 1997PNAS ... 94.4354Y。doi : 10.1073 / pnas.94.9.4354。PMC 20726。PMID 9113993。
Gerber A、O'Connell MA、Keller W (1997 年 5 月)。「Alu カセットの挿入によって生成される 2 つの形態のヒト二本鎖 RNA 特異的エディターゼ 1 (hRED1)」。RNA。3 ( 5 ) : 453–63。PMC 1369496。PMID 9149227。
Villard L、Tassone F、 Haymowicz M、Welborn R、Gardiner K (1997 年 3 月)。「ヒト RED1 RNA エディターゼの地図上の位置、ゲノム構成、および発現パターン」。体細胞および分子遺伝学。23 ( 2 ): 135–45。doi :10.1007/BF02679972。PMID 9330641。S2CID 45104326 。
ブランコ J、バレンズエラ A、エレーラ C、ルイス C、ホヴァネシアン AG、フランコ R (2000 年 7 月)。「HIV-1 gp120 は、CD4 および CXCR4 の発現によって調節される機構により、アデノシンデアミナーゼの CD26 への結合を阻害します。」FEBS レター。477 (1-2): 123-8。土居：10.1016/S0014-5793(00)01751-8。PMID 10899322。S2CID 22229481 。
Herrera C、Morimoto C、Blanco J、Mallol J、Arenzana F、Lluis C、Franco R (2001 年 6 月)。「ヒトリンパ球における CXCR4 と CD26 の共調節」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 22): 19532–9。doi : 10.1074/jbc.M004586200。PMID 11278278。
Maas S、Patt S、Schrey M、Rich A (2001 年 12 月)。「悪性神経膠腫におけるグルタミン酸受容体 GluR-B mRNA の過少編集」。米国科学アカデミー紀要。98 (25): 14687–92。Bibcode : 2001PNAS ...9814687M。doi : 10.1073 / pnas.251531398。PMC 64742。PMID 11717408。
Jayan GC、Casey JL (2002 年 4 月) 。「ADAR1およびADAR2 の高レベル発現による RNA 編集の増加とデルタ肝炎ウイルスの複製の阻害」。Journal of Virology。76 (8): 3819–27。doi : 10.1128 / JVI.76.8.3819-3827.2002。PMC 136091。PMID 11907222。
Jaikaran DC、Collins CH、MacMillan AM (2002 年 10 月)。「ADAR2 によるアデノシンからイノシンへの編集には、GluR-B R/G 部位での三元複合体の形成が必要」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 40): 37624–9。doi : 10.1074/ jbc.M204126200。PMID 12163487。
Jayan GC、Casey JL (2002 年 12 月)。「短い阻害 RNA を介した ADAR1 のノックダウンによる肝炎デルタウイルス RNA 編集の阻害は、ADAR2 発現のノックダウンには影響しない」。Journal of Virology。76 ( 23 ) : 12399–404。doi :10.1128/JVI.76.23.12399-12404.2002。PMC 136899。PMID 12414985。
Slavov D、Gardiner K (2002 年 10 月)。「pre-mRNA アデノシンデアミナーゼ ADAR2 遺伝子と転写産物の系統学的比較: 編集部位配列と選択的スプライシングパターンの保全と多様性」。Gene . 299 (1–2): 83–94。doi : 10.1016 /S0378-1119(02)01016-8。PMID 12459255 。

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト ADARB1 ゲノムの位置と ADARB1 遺伝子の詳細ページ。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000197381 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020262 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid9143496-5] Mittaz L、Scott HS、Rossier C、Seeburg PH、Higuchi M、Antonarakis SE (1997 年 4 月)。「染色体 21q22.3 にマップされるグルタミン酸受容体のヒト RNA 編集脱アミノ酵素 (ADARB1) のクローニング」。Genomics . 41 ( 2): 210–7. doi :10.1006/geno.1997.4655. PMID 9143496。

[pmid14759252-6] ^ Keegan LP、Leroy A、Sproul D 、 O'Connell MA (2004 年 2 月)。「RNA に作用するアデノシンデアミナーゼ (ADAR): RNA 編集酵素」。ゲノム生物学。5 (2): 209。doi : 10.1186/ gb - 2004-5-2-209。PMC 395743。PMID 14759252。

[entrez-7] 「Entrez Gene: ADARB1 アデノシンデアミナーゼ、RNA 特異的、B1 (RED1 ホモログラット)」。

[pmid16141067-8] Macbeth MR、Schubert HL、Vandemark AP、Lingam AT、Hill CP、Bass BL (2005 年 9 月)。「イノシトールヘキサキスリン酸は ADAR2 コアに結合し、RNA 編集に必要」。Science。309 ( 5740 ) : 1534–9。Bibcode : 2005Sci ...309.1534M。doi : 10.1126/ science.11 13150。PMC 1850959。PMID 16141067。

[9] ^ Licht K、Jantsch MF（2016年4月）。「 RNA編集とRNA修飾による迅速かつ動的なトランスクリプトーム制御」。The Journal of Cell Biology。213（1）：15–22。doi ： 10.1083 / jcb.201511041。PMC 4828693。PMID 27044895 。