ウイルス学
MERS-CoVウイルスは、ベータコロナウイルスのベータ群、系統Cに属するコロナウイルスです。MERS -CoVゲノムは系統発生的にAとBの2つのクレードに分類されます。初期の症例はAクレードのクラスターでしたが、最近の症例の大部分は遺伝的に異なるBクレードです。[ 12 ]
MERS-CoVは、 HCoV-229E、 HCoV-NL63、 HCoV-OC43、 HCoV-HKU1、元の SARS-CoV(またはSARS-CoV-1)、およびSARS-CoV-2を含む、ヒトに感染することが知られている7つのコロナウイルスの1つです。[ 13 ]これは、SARS様ウイルスとして頻繁に言及されています。[ 14 ] 2019年11月までに、MERSの症例は2,494件報告され、858人が死亡しており、症例致死率は30%を超えています。[ 15 ]
伝染 ; 感染
2013年2月13日、世界保健機関は「持続的な人から人への感染のリスクは非常に低いと思われる」と述べた。[ 28 ] MERS-CoVが肺で感染する細胞は呼吸器上皮細胞のわずか20%に過ぎないため、感染を引き起こすには大量のウイルス粒子を吸入する必要があると考えられる。[ 26 ]
メリーランド州ベセスダにある国立衛生研究所のアンソニー・ファウチ氏は、MERS-CoVは「持続的に人から人へ感染することはない」と述べつつ、ウイルスが人から人へ感染する株に変異する可能性を指摘した。[ 29 ]しかし、医療従事者の感染により、人から人への感染が懸念されている。[ 30 ]
米国疾病予防管理センター(CDC)は、MERSをヒトからヒトに感染するウイルスとしてリストアップしている。[ 31 ]彼らは、「MERS-CoVは、密接な接触のある人々の間で感染が広がることが示されている。感染した患者から医療従事者への感染も観察されている。いくつかの国で発生している症例の集団発生について調査が行われている。」と述べている。[ 31 ] [ 32 ]
しかし、5月28日、CDCは、当初は(ビジネスミーティングでインディアナ州の男性から)人から人への感染の最初の事例と考えられていたイリノイ州の男性が、実際にはMERS-CoVの検査で陰性だったことを明らかにした。中和抗体アッセイを用いた追加のより決定的な検査を完了した後、CDCの専門家は、インディアナ州の患者がイリノイ州の患者にウイルスを感染させていないと結論付けた。検査の結果、イリノイ州の男性は以前に感染していなかったことが判明した。MERSは無症状である可能性があり、初期の研究では、症例の最大20%が活動性感染の兆候を示さないが、血液中にMERS-CoV抗体を持っていることが示されている。[ 33 ]
進化
MERS-CoVスパイクタンパク質の3Dモデルこのウイルスはコウモリに由来すると考えられている。[ 34 ]ウイルス自体はコウモリから分離されている。[ 35 ]このウイルスは、Tylonycteris コウモリコロナウイルス HKU4およびPipistrellus コウモリコロナウイルス HKU5と密接に関連している。[ 36 ]血清学的証拠によると、これらのウイルスは少なくとも 20 年間ラクダに感染していた。いくつかのヒト株の最近の共通祖先は 2012 年 3 月 (95% 信頼区間 2011 年 12 月~2012 年 6 月) と推定されている。[ 37 ]
ウイルスはコウモリにしばらく存在し、1990年代半ばまでにラクダに広がったと考えられている。ウイルスは2010年代初頭にラクダからヒトに広がったようだ。元のコウモリの宿主種と、この種での最初の感染時期はまだ特定されていない。238の分離株の配列を調べたところ、このウイルスはコドン使用、宿主、地理的分布が異なる3つのクレードに進化していることが示唆された。[ 38 ]
2022年初頭、南アフリカのNeoromiciaコウモリから、MERS関連の新しいコロナウイルスであるNeoCoVが同定された。MERS-CoVと他のいくつかの関連するコウモリコロナウイルスはDPP4を使用して宿主細胞に侵入するが、NeoCoVと近縁のPDF-2180-CoVは、SARS関連ウイルスが侵入に使用するのと同じ受容体である、コウモリとヒトのACE2受容体のいくつかの形を使用して侵入できることが判明した。[ 10 ] [ 11 ]研究者らは、ウイルスの結合界面付近、Asp338残基付近に、ウイルスがヒトACE2を使用して感染できないようにする分子決定因子を発見した。しかし、受容体結合ドメイン(RBD)モチーフにT501F変異を持つNeoCoVウイルスは、ヒトACE2を発現する細胞に効果的に感染することができた。研究者たちはウイルスの特性を懸念し、NeoCoVを潜在的なパンデミックリスクとして特定した。ある研究では、NeoCoVがパンデミックを引き起こした場合、致死率は30%となり、MERSと同程度のレベルになる可能性があると述べている。[ 10 ]
天然貯水池
ウイルスはコウモリに由来すると考えられており、エジプトの墓コウモリがその候補の1つである。[ 39 ]ニューヨークのコロンビア大学の疫学者イアン・リプキンの研究では、コウモリから分離されたウイルスがヒトで見つかったウイルスと一致するように見えることが示された。 [ 35 ] [ 40 ] 2cベータコロナウイルスは、ガーナのNycterisコウモリとヨーロッパのPipistrellusコウモリ で検出され、MERS-CoVウイルスと系統発生的に関連している。[ 41 ]しかし、ヒトがウイルスに感染する主な自然宿主は、2013年8月9日に医学誌The Lancet Infectious Diseasesに掲載された報告で、オマーンのラクダ50頭中50頭(100%)とスペインのラクダ105頭中15頭(14%)がMERS-CoVスパイクタンパク質に対するタンパク質特異的抗体を持っていることが示されるまで不明のままだった。ヨーロッパのヒツジ、ヤギ、ウシ、その他のラクダ科動物の血清にはそのような抗体はなかった。[ 42 ]
その後間もなく、2013年9月5日、 RA Pereraら[ 43 ]がEurosurveillance誌に発表した血清疫学的研究では、1343人のヒト血清と625の動物血清を調査した結果、エジプトのヒトコブラクダ110頭のうち108頭にMERS-CoV特異抗体が豊富に存在していたが、この地域のヤギ、牛、羊などの他の動物には存在していなかったことが示された。[ 43 ]これらは、「ヒトコブラクダ」がMERS-CoVの宿主としての役割を担っていることを示唆した最初の重要な科学的報告である。
研究ではラクダとの関連性が示されており、ヒトコブラクダの子ラクダと成体のコロナウイルス感染は、ヒトのクレードB MERS-CoVのゲノムと99.9%一致することが示されています。[ 44 ] MERSに感染した人の少なくとも1人は、ラクダと接触したか、最近ラクダの乳を飲んだことが知られています。[ 45 ]サウジアラビアやアラブ首長国連邦のような国は、大量のラクダ肉を生産し消費しています。アフリカやオーストラリアのコウモリがウイルスを保有し、ラクダに感染させる可能性があります。これらの地域から輸入されたラクダがウイルスを中東に持ち込んだ可能性があります。[ 46 ]
2013年、MERS-CoVはカタールの納屋で飼育されていたヒトコブラクダの群れのうち3頭で確認され、その後回復した2人のヒトの確定症例と関連していた。ラクダにおけるMERS-CoVの存在は、保健省の国立公衆衛生環境研究所(RIVM)とオランダのエラスムス医療センター(WHO協力センター)によって確認された。サンプル採取時、ラクダはいずれも病気の兆候を示さなかった。カタール最高保健評議会は2013年11月、心臓病、糖尿病、腎臓病、呼吸器疾患、免疫抑制状態、高齢者などの基礎疾患を持つ人は、農場や市場を訪れる際に動物との密接な接触を避け、手洗いなどの適切な衛生習慣を実践するよう勧告した。[ 47 ]
2013年12月に発表されたサウジアラビアのヒトコブラクダに関するさらなる研究では、評価されたヒトコブラクダの90%(310頭)にMERS-CoVが存在することが明らかになり、ヒトコブラクダはMERS-CoVの主要な宿主であるだけでなく、MERSの動物由来源でもある可能性が示唆された。[ 48 ]
2014年3月27日のMERS-CoV概要更新によると、最近の研究では、ラクダがヒトに感染するMERS-CoVの主要な感染源であり、コウモリがウイルスの最終的な宿主である可能性が支持されている。証拠としては、ヒトの症例が曝露されたラクダでウイルスが発見された頻度、ラクダにおける広範な感染を示す血清学的データ、ラクダCoVとヒトCoVの類似性などが挙げられる。[ 49 ]
2014年6月6日、アラブニュース紙は、ニューイングランド医学誌に掲載された最新の研究結果を強調した。この研究では、9頭のラクダを飼育していた44歳のサウジアラビア人男性が2013年11月にMERSで死亡した。友人たちは、彼がMERSに感染する7日前に、病気のラクダ(4頭は鼻水が出ていたと報告されている)の1頭の鼻に局所薬を塗布しているのを目撃したと証言した。研究者たちは、病気のラクダの1頭から見つかったウイルスと、この男性を死に至らしめたウイルスのゲノム配列を解析し、両者のゲノムが同一であることを発見した。同じ記事の中で、アラブニュース紙は、2014年6月6日現在、サウジアラビア王国でMERSの症例が689件報告され、283人が死亡していると報じた。[ 50 ]
分類学
MERS-CoVは、SARS-CoV(系統2B)よりもコウモリコロナウイルスHKU4およびHKU5(系統2C)に近縁であり(2、9)、最も近縁なコウモリコロナウイルスHKU4およびHKU5と90%以上の配列同一性を共有しているため、国際ウイルス分類委員会(ICTV)によって同じ種に属すると考えられています。
- 学名: Betacoronavirus cameli [ 1 ]
- 一般名:中東呼吸器症候群コロナウイルス(MERS-CoV)[ 2 ]
- その他の名称:
- 新型コロナウイルス(nCoV)
- ロンドン1型新型CoV/2012 [ 51 ]
- ヒトコロナウイルス エラスムス医療センター/2012 ( HCoV-EMC/2012 )
研究と特許
サウジアラビア当局は、ヒト株を最初に分離したザキ博士がフーシエにウイルスのサンプルを送ることを許可しておらず、フーシエがMERS-CoVの完全な遺伝子配列の特許を主張したことに憤慨した。[ 52 ]
エコノミスト誌の編集者は、「安全保障への懸念が緊急の作業を遅らせてはならない。致死性のウイルスを研究することは危険だ。研究しないことの方が危険だ」と述べた。[ 52 ]ザキ博士は、発表の際にサウジアラビア保健省を迂回し、サンプルと研究結果を共有した結果、病院の職を解雇された。[ 53 ] [ 54 ] [ 55 ] [ 56 ]
2013年5月に開催された世界保健総会の年次会合で、WHO事務局長のマーガレット・チャン氏は、知的財産、すなわち新ウイルス株の特許は、科学的調査を制限することによって各国が国民を保護することを妨げるべきではないと述べた。保健副大臣のジアード・メミッシュ氏は、MERS-CoVの特許を保有する科学者が他の科学者に特許物質の使用を許可せず、診断検査の開発を遅らせているのではないかと懸念を示した。[ 57 ]エラスムスMCは、特許申請はMERSおよびMERS-CoVに関する公衆衛生研究を制限するものではなく、[ 58 ]ウイルスと診断検査は、そのような試薬を要求したすべての人に無料で送付されたと回答した。
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外部リンク
- 中東呼吸器症候群コロナウイルスの出現
- MERSコロナウイルスの完全ゲノム
- 新興ウイルス
- MERSコロナウイルスの分子構造図
- フィリピンは依然としてMERS-CoV感染者ゼロ – 保健省(2014年6月28日、 Wayback Machineにアーカイブ)
- エジプトの墓からコウモリが発見され、中東で致死性のコロナウイルスが蔓延