Loading article…
| トレオニンプロテアーゼ | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
ヒトプロテアソームα1の結晶構造 | |||||||
| 識別子 | |||||||
| シンボル | 3月 | ||||||
| |||||||
トレオニンプロテアーゼは、活性部位内にトレオニン(Thr)残基を持つタンパク質分解 酵素のファミリーです。このクラスの酵素の原型はプロテアソームの触媒サブユニットですが、アシルトランスフェラーゼは同じ活性部位の形状とメカニズムを収束的に進化させました。
機構
トレオニンプロテアーゼは、N末端トレオニンの二級アルコールを求核剤として触媒作用を行う。[1] [2]トレオニンはN末端でなければならない。なぜなら、同じ残基の末端アミンは、整列した水を分極させて一般的な塩基として働き、アルコールを脱プロトン化して求核剤としての反応性を高めるからである。[3] [4]
触媒作用は 2 つの段階で起こります。
- まず、求核剤が基質を攻撃して共有結合したアシル酵素中間体を形成し、最初の生成物を放出します。
- 次に、中間体は水によって加水分解され、遊離酵素が再生され、第 2 の生成物が放出されます。
- オルニチンアシルトランスフェラーゼでは、水の代わりに基質オルニチン(受容体)が2回目の求核攻撃を行い、アシル基を残して離脱します。
分類と進化

現在、2つの別々のスーパーファミリーに属する5つのファミリーが認識されています:Ntnフォールドプロテオソーム[1](スーパーファミリーPB)とDOMフォールドオルニチンアシルトランスフェラーゼ[2](スーパーファミリーPE)。2つのスーパーファミリーは、同じ活性部位の2つの独立した収束進化を表しています。 [4] [5]
参照
- プロテアーゼ
- 酵素
- タンパク質分解
- 触媒三位一体
- 収斂進化
- タンパク質分解マップ
- プロテアーゼ阻害剤(薬理学)
- プロテアーゼ阻害剤(生物学)
- TopFIND - プロテアーゼ特異性、基質、生成物、阻害剤のデータベース
- MEROPS - プロテアーゼ進化グループのデータベース
参考文献
- ^ ab Brannigan JA、Dodson G、Duggleby HJ、Moody PC、Smith JL、Tomchick DR、Murzin AG (1995 年 11 月)。「N 末端求核剤を持つタンパク質触媒フレームワークは自己活性化が可能」。Nature。378 ( 6555 ) : 416–9。Bibcode : 1995Natur.378..416B。doi : 10.1038 /378416a0。PMID 7477383。S2CID 4277904。
- ^ ab Cheng H, Grishin NV (2005 年 7 月). 「DOM フォールド: DmpA、オルニチンアセチルトランスフェラーゼ、モリブデン補因子結合ドメインに見られる交差ループを持つ構造」.タンパク質科学. 14 (7): 1902–10. doi :10.1110/ps.051364905. PMC 2253344. PMID 15937278 .
- ^ Dodson G, Wlodawer A (1998年9月). 「触媒トライアドとその関連物」.生化学科学の動向. 23 (9): 347–52. doi :10.1016/S0968-0004(98)01254-7. PMID 9787641.
- ^ ab Ekici OD、Paetzel M 、Dalbey RE(2008年12月)。「非従来型セリンプロテアーゼ:触媒Ser/His/Aspトライアド構成のバリエーション」。タンパク質科学。17 (12):2023–37。doi : 10.1110 /ps.035436.108。PMC 2590910。PMID 18824507。
- ^ Buller AR、Townsend CA (2013 年 2 月)。「プロテアーゼ構造、酵素アシル化、および触媒トライアドのアイデンティティに対する本質的な進化的制約」。米国科学アカデミー紀要。110 ( 8 ): E653-61。Bibcode :2013PNAS..110E.653B。doi : 10.1073 /pnas.1221050110。PMC 3581919。PMID 23382230。
