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プロテオリシスMAP（PMAP ）は、プロテアーゼに焦点を当てた統合ウェブリソースでした。[ 1 ]現在、そのドメインは詐欺/スパムブラウザ拡張機能にリンクしています。
PMAPはもともと、カリフォルニア州ラホヤにあるバーナム医学研究所で創設されました。2004年、米国国立衛生研究所（NIH）は、ジェフリー・W・スミス氏率いるチームを選定し、タンパク質分解経路センター（CPP）を設立しました。NIHの生物医学研究ロードマップの一環として、同センターはタンパク質の挙動を研究するための技術を開発し、その知識を広く科学コミュニティに普及させる活動を行っています。
プロテアーゼは、タンパク質のペプチド結合を切断することで、細胞内外を問わず、人体内で起こる多くの現象を制御する酵素群です。この働きによって、分化、運動性、分裂、細胞死という4つの必須細胞機能を制御し、血液凝固における生化学的カスケード効果など、重要な細胞外現象を活性化します。プロテアーゼがなければ、生命は存在し得ません。プロテアーゼ（ペプチダーゼとも呼ばれる）の包括的なオンライン分類システムは、 MEROPSデータベースに登録されています。
タンパク質分解経路、すなわちタンパク質分解とは、特定の刺激に応答してプロテアーゼによって制御される一連の反応のことである。血液凝固やインスリン産生は、タンパク質分解経路の一例とみなすことができる。タンパク質の活性化、調節、阻害は、血糖値の変化に対するプロテアーゼ反応であり、下流の他のプロテアーゼを活性化する。
PMAPは5つのデータベースを統合しています。ProteaseDBとSubstrateDBは、分子情報が豊富な動的な「分子ページ」を生成する自動アノテーションパイプラインによって駆動されます。CutDB [ 2 ]には6,600を超えるタンパク質分解イベントに関する情報があり、ProfileDBはプロテアーゼの基質認識特異性に関する情報に特化しています。PathwayDBは、ルールベース方式で動的にモデル化できる代謝経路の蓄積を開始しています。仮説ネットワークは、文献からの半自動的な選別によって推論されます。プロテアーゼソフトウェアツールは、個々のプロテアーゼとプロテオーム全体のデータセットの分析に役立ちます。
PMAPでよく利用されるページは、プロテアーゼ分子ページと基質分子ページです。プロテアーゼ分子ページには、 PubMedに掲載されたプロテアーゼに関する最新のニュース、既知のタンパク質分解イベント、タンパク質ドメインの位置と構造ビュー、および他のバイオインフォマティクスデータベースにおける相互注釈が表示されます。基質分子ページには、特定の標的タンパク質のタンパク質ドメインと、実験的に得られたプロテアーゼ切断部位が表示されます。