| 寿司ドメイン (SCR/CCP) | |||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||
| シンボル | 寿司 | ||||||||||
| パム | PF00084 | ||||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||||
| キャス | 1g4g | ||||||||||
| SCOP2 | 1hfi / スコープ / SUPFAM | ||||||||||
| 医療機器 | cd00033 | ||||||||||
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寿司ドメインは進化的に保存されたタンパク質ドメインです。補体制御タンパク質(CCP)モジュールまたは短いコンセンサスリピート(SCR)としても知られています。この名前は、ジスルフィド結合によって作られたループを示す一次構造を描くと、ドメインが握り寿司に視覚的に似ていることに由来しています。[1]
寿司ドメインは、さまざまな補体タンパク質や接着タンパク質に存在します。このドメインの構造は、ベータサンドイッチ配置に基づいていることが知られています。1つの面は3つのβストランドが 水素結合して中央に三重鎖領域を形成し、もう1つの面は2つの別々のβストランドで構成されています。[2]
CD21 (C3d 受容体、CR2、エプスタイン・バーウイルス受容体、または EBV-R とも呼ばれる) は、EBV および C3d、C3dg、iC3b の受容体です。補体成分はCD21 を介してB 細胞を活性化する可能性があります。CD21 は、CD19、CD81、および Leu13 も関与する大規模なシグナル伝達複合体の一部です。
このグループのタンパク質の一部は、赤血球膜の外側にある表面マーカーである血液型抗原の分子基盤を担っています。これらのマーカーのほとんどはタンパク質ですが、一部は脂質やタンパク質に結合した炭水化物です。[3]補体崩壊促進因子(抗原CD55)はクロマー血液型システムに属し、Cr(a)、Dr(a)、Es(a)、Tc(a/b/c)、Wd(a)、WES(a/b)、IFC、UMC抗原と関連しています。補体受容体1型(C3b/C4b受容体)(抗原CD35)はノップス血液型システムに属し、Kn(a/b)、McC(a)、Sl(a)、Yk(a)抗原と関連しています。
亜科
例
このドメインを含むタンパク質をコードするヒト遺伝子には以下のものがあります。
- AGC1、APOH、
- BCAN、BF、
- C1R、C1S、C2、C4BPA、C4BPB、C6、C7、CD46、CD55、CFB、CFH、CFHR1、CFHR2、CFHR3、CFHR4、CFHR5、CR1、CR1L、CR2、CSMD1、CSMD2、CSMD3、CSPG3、
- DAF、
- F13B、FHR4、GABBR1、
- HP、
- IL2RA、
- KIAA0247、
- MASP1、MASP2、
- PAPPA、PAPPA2、psk-3、
- ランプ、
- SEL-OB、SELE、SELL、SELP、SEZ6、SEZ6L、SEZ6L2、SNED1、SRPX、SRPX2、SUSD1、SUSD2、SUSD4、SVEP1、SEZ6L2、
- TAOK1、TPO、VCAN
参考文献
- ^一ノ瀬 明忠; ボッテヌス ラルフ E.; デイビー アール W.「トランスグルタミナーゼの構造」生化学ジャーナル265 :13411–13414. PMID 1974250.
- ^ Campbell ID, Baron M, Day AJ, Sim RB, Norman DG, Barlow PN (1991). 「溶液中の補体制御タンパク質モジュールの3次元構造」J. Mol. Biol . 219 (4): 717–725. doi :10.1016/0022-2836(91)90666-T. PMID 1829116.
- ^ ロマス・フランシス、クリスティン、リード、マリオン E. (2004)。血液型抗原:ファクトブック。ボストン:アカデミック・プレス。ISBN 0-12-586585-6。
