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便検査は、糞便を採取して分析する医学的診断技術です。便サンプルに対して行われる検査には、微生物分析（培養）、顕微鏡検査、化学検査などがあります。
便検体は採取後できるだけ早く検査室に送付し、検査室に送付する前に冷蔵してはいけません。[ 1 ]
診察室や病床にいる患者や医療従事者は、いくつかの重要な観察を行うことができる。
便潜血検査と便免疫化学検査は、大腸がんや胃がんなど、消化器系で出血を引き起こす多くの疾患を診断するための最も一般的な便検査です。[ 2 ]米国消化器病学会は、便免疫化学検査（FIT） を推奨し、大腸がんスクリーニングツールとしてのgFOBT検査を廃止することを推奨しています。[ 3 ] 新しく推奨されている検査では、グロビン、DNA 、またはトランスフェリンなどの他の血液因子を調べますが、従来の便グアヤック検査ではヘムを調べます。
癌、そして程度は低いものの前癌病変は、異常な細胞を便中に放出します。[ 4 ]排便によって潰瘍化したり擦れたりする癌や前癌病変（ポリープ）も便中に血液を放出することがあり、これはヘモグロビン検査で確認できます。[ 4 ]
米国癌協会と米国予防サービス特別委員会は、 45歳から毎年便免疫化学検査による大腸がん検診、または3年ごとに多標的便DNA検査を受けることを推奨しています。[ 5 ]その他の選択肢としては、5年ごとにS状結腸鏡検査または仮想大腸内視鏡検査（CT大腸造影）、または10年ごとに 大腸内視鏡検査があります。便潜血検査は、偽陽性率が高く、食事や薬の制限があるため、もはや推奨されていません。[ 5 ] [ 6 ]全米医療品質保証委員会（NCQA）は、2017年の医療効果データ情報セット（HEDIS）の更新を発表しましたが、ガイドラインは50歳以上の患者に対して引き続き適用されます。[ 7 ]
多標的便DNA検査は、2014年8月にFDAによって、無症状で平均リスクの50歳以上の成人を対象としたスクリーニング検査として承認されました。[ 8 ] 2017年の研究では、この検査は、大腸内視鏡検査や便潜血検査と比較して費用対効果が低いことがわかりました。 [ 9 ] 3年間の多標的便DNA検査は、スクリーニングを行わない場合と比較して、質調整生存年（QALY）あたり11,313ドルの費用がかかると推定されています。[ 10 ]
回虫症、鉤虫症、糞線虫症、鞭虫症などの寄生虫疾患は、顕微鏡で便を検査して虫の幼虫や卵の存在を確認することで診断できます。一部の細菌性疾患は、便培養で検出できます。クロストリジオイデス・ディフィシル（C. diff ）などの細菌の毒素も特定できます。ロタウイルスなどのウイルスも便中に見られます。[ 11 ]その他の便検査には、適切な治療を導くための抗生物質耐性の検出が含まれます。たとえば、ヘリコバクター・ピロリのクラリスロマイシン耐性は除菌療法における大きな課題ですが、原因となる細菌のゲノムマーカーはPCR技術を使用して便中で検出できるため、特定の患者に適切な抗生物質を処方することができます。[ 12 ]
便のpH検査は、乳糖不耐症や感染症の有無を判断するために使用できます。 [ 13 ]脂肪便は、脂肪の吸収不良を調べる便脂肪検査を使用して診断できます。 [ 14 ]
糞便エラスターゼ値は、膵炎診断の主要な指標となりつつある。