ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ＳＳＸ４ 識別子 エイリアス SSX4 、CT5.4、滑膜肉腫、Xブレークポイント4、SSXファミリーメンバー4 外部ID オミム ：300326; MGI : 2446771; ホモロジーン ：133052; ジーンカード ：SSX4; OMA :SSX4 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 X染色体（マウス） [2] バンド X A1.1|X 始める 8,320,584 bp [2] 終わり 8,327,965 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 睾丸 生殖腺 右精巣 左精巣 鼻粘膜の嗅覚領域 胸部大動脈 上行大動脈 脛骨動脈 脾臓 子宮管
トップの表現 精子細胞 睾丸 胚 精母細胞 上前頭回 卵巣 小脳皮質 一次視覚野 レンズ
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分 生物学的プロセス
核酸テンプレート転写の負の制御 転写の調節、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001001450 NM_001134226
RefSeq (タンパク質) 場所 (UCSC) 染色体X: 48.38 – 48.39 Mb 染色体X: 8.32 – 8.33 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
タンパク質SSX4 は、ヒトでは SSX4 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5]
この遺伝子の産物は、 高度に相同な 滑膜肉腫 X (SSX) ブレークポイント タンパク質のファミリーに属します。これらのタンパク質は、転写 リプレッサー として機能する可能性があります。また、がん患者の自発的な 体液性免疫応答 と 細胞性免疫応答 を誘発する能力があり 、 がんワクチンをベースとした免疫療法 の潜在的に有用なターゲットです。SSX1 、 SSX2 、および SSX4 遺伝子は、すべての 滑膜肉腫 に特徴的に見られる t(X;18) 染色体転座に関与しています。この転座 により、 18 番染色体 上の滑膜肉腫転座遺伝子が X 染色体 上の SSX 遺伝子の 1 つに融合します 。染色体 Xp11 には 分節重複 が含まれており、その結果、滑膜肉腫 X ブレークポイント 4、SSX4、および SSX4B の 2 つの同一コピーが尾同士の向きで生じます。この遺伝子SSX4は、より テロメアに 近いコピーである。この遺伝子には、 異なる アイソフォームをコードする2つの 転写変異体 が同定されている。 [5]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000268009 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000023165 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ ab 「Entrez Gene: SSX4 滑膜肉腫、X ブレークポイント 4」。
さらに読む
dos Santos NR、de Bruijn DR、van Kessel AG (2001)。「ヒト滑膜肉腫発症の分子メカニズム」。Genes Chromosomes Cancer。30 ( 1 ): 1–14。doi : 10.1002 /1098-2264(2000)9999:9999<::AID-GCC1056>3.0.CO;2- G。PMID 11107170。S2CID 24403558 。 Gure AO、Türeci O、Sahin U、et al. (1997)。「SSX: 正常精巣およびヒト癌で転写される複数のメンバーを含む多重遺伝子ファミリー」。Int . J. Cancer . 72 (6): 965–71. doi :10.1002/(SICI)1097-0215(19970917)72:6<965::AID-IJC8>3.0.CO;2-N. PMID 9378559. S2CID 21203036。 Skytting B、Nilsson G、Brodin B、et al. (1999)。「滑膜肉腫における新規融合遺伝子SYT-SSX4」。J . Natl. Cancer Inst . 91 (11): 974–5. doi : 10.1093/jnci/91.11.974 . PMID 10359553。 Chen CH, Chen GJ, Lee HS, et al. (2001). 「ヒト肝細胞癌における癌精巣抗原の発現」. Cancer Lett . 164 (2): 189–95. doi :10.1016/S0304-3835(01)00379-2. PMID 11179834. Brodin B、Haslam K、Yang K、他 (2001)。「滑膜肉腫のスプライス融合転写変異体のクローニングと特性評価: SYT/SSX4、SYT/SSX4v、および SYT/SSX2v。野生型 SYT 発現における融合遺伝子産物の考えられる制御的役割」。Gene . 268 ( 1–2): 173–82。doi : 10.1016 /S0378-1119(01)00412-7。PMID 11368913 。 Panagopoulos I、Mertens F、 Isaksson M、他 (2001)。「滑膜肉腫における分子および細胞遺伝学的所見の臨床的影響」。Genes Chromosomes Cancer。31 ( 4 ): 362–72。doi :10.1002/gcc.1155。PMID 11433527。S2CID 41111894。 de Bruijn DR、dos Santos NR、Kater-Baats E、et al. (2002)。「がん関連タンパク質 SSX2 は、Ras 様 GTPase 相互作用因子のヒト相同体である RAB3IP、および新規核タンパク質 SSX2IP と相互作用する」。Genes Chromosomes Cancer。34 ( 3 ) : 285–98。doi :10.1002/gcc.10073。PMID 12007189。S2CID 11734893 。 Yang K、Lui WO、Xie Y、et al. (2002)。「滑膜肉腫におけるSYT-SSX1とSYT-SSX2融合の共存」。Oncogene . 21 ( 26): 4181–90. doi : 10.1038/sj.onc.1205569 . PMID 12037676。 Güre AO 、Wei IJ、Old LJ、Chen YT (2002)。「SSX遺伝子ファミリー：9つの完全な遺伝子の特徴」。Int . J. Cancer。101 ( 5 ) : 448–53。doi ： 10.1002 /ijc.10634。PMID 12216073。S2CID 21174312 。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Ross MT、 Grafham DV、Coffey AJ 、 他 (2005)。「ヒトX染色体のDNA配列」。Nature 434 ( 7031 ): 325–37。Bibcode :2005Natur.434..325R。doi : 10.1038 /nature03440。PMC 2665286。PMID 15772651 。 Ayyoub M、Merlo A、Hesdorffer CS、et al. (2005)。「メラノーマ患者におけるSSX-4に対するCD4+ T細胞応答」。J . Immunol . 174 (8): 5092–9. doi : 10.4049/jimmunol.174.8.5092 . PMID 15814740。 Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
